More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1695 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  100 
 
 		 356 aa  714    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  48.66 
 
 		 351 aa  283  2.0000000000000002e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2182  polysaccharide export protein  31.88 
 
 		 298 aa  152  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  34.54 
 
 		 268 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  30.86 
 
 		 270 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  36.76 
 
 		 277 aa  132  9e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2734  capsular polysaccharide export protein, putative  31.15 
 
 		 276 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  27.83 
 
 		 347 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  29.25 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3311  polysaccharide export protein  31.17 
 
 		 324 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.328062 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  30 
 
 		 264 aa  114  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1463  putative polysaccharide export protein  28.52 
 
 		 352 aa  113  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.24713e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  28.91 
 
 		 264 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2584  polysaccharide export protein  28.67 
 
 		 288 aa  110  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3803  polysaccharide export protein  29.07 
 
 		 344 aa  109  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  27.11 
 
 		 379 aa  106  6e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  29.48 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1877  polysaccharide export protein  26.46 
 
 		 281 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  32.97 
 
 		 243 aa  104  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2367  polysaccharide export protein EpsE  30 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  32.27 
 
 		 388 aa  103  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  27.14 
 
 		 473 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0834  polysaccharide export protein  29.82 
 
 		 309 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  31.42 
 
 		 478 aa  98.2  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  25.71 
 
 		 495 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  28.57 
 
 		 362 aa  95.1  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3013  polysaccharide export protein  37.85 
 
 		 270 aa  95.1  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  34.88 
 
 		 232 aa  92.8  8e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3287  polysaccharide export protein  27.12 
 
 		 492 aa  92.8  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  26.41 
 
 		 282 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  24.05 
 
 		 869 aa  91.3  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  29.88 
 
 		 205 aa  89.7  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2529  polysaccharide export protein  31.87 
 
 		 208 aa  89  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  26.14 
 
 		 478 aa  88.2  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  35.34 
 
 		 249 aa  86.3  8e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0835  polysaccharide export protein  25.91 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  34.48 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  25.2 
 
 		 897 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3871  polysaccharide export protein  29.27 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  25.7 
 
 		 352 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  29.65 
 
 		 393 aa  82.8  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2475  polysaccharide export protein  27.59 
 
 		 283 aa  82.4  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5025  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.02 
 
 		 211 aa  81.6  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1536  polysaccharide export protein  29.55 
 
 		 207 aa  82  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595422  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4112  polysaccharide export protein  28.08 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  30.56 
 
 		 580 aa  80.9  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  24.02 
 
 		 936 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  25.99 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1596  polysaccharide export protein  27.88 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  29.52 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3242  polysaccharide export protein  27.49 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1339  polysaccharide biosynthesis/export domain protein  23.55 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  29.52 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  29.52 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  24.61 
 
 		 919 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1430  capsular polysaccharide export protein, putative  28.9 
 
 		 333 aa  79.3  0.00000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4031  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 216 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123149  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.36 
 
 		 920 aa  79  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  25.66 
 
 		 576 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  24.44 
 
 		 508 aa  79.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 208 aa  79  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  24.44 
 
 		 920 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1985  polysaccharide export protein  29.52 
 
 		 208 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560938  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0468  polysaccharide export outer membrane protein  24.76 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.622539  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  30.12 
 
 		 210 aa  78.2  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0658  polysaccharide export protein  30.72 
 
 		 188 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  23.89 
 
 		 910 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1928  polysaccharide export protein  26.79 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  25 
 
 		 952 aa  77  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  24.7 
 
 		 948 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3509  polysaccharide export protein  29.52 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101119 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  23.93 
 
 		 781 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  24.68 
 
 		 922 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0689  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  27.83 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.659999 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2336  polysaccharide export protein  27.98 
 
 		 215 aa  75.9  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.125477  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  27.63 
 
 		 940 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  26.01 
 
 		 803 aa  75.9  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  26.67 
 
 		 205 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1985  outer membrane protein, putative  25.94 
 
 		 282 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3037  polysaccharide export protein  26.32 
 
 		 365 aa  74.7  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.28 
 
 		 152 aa  74.3  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1690  polysaccharide export protein  24.67 
 
 		 428 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.977677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  28 
 
 		 753 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3196  polysaccharide export protein  26.2 
 
 		 391 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.622788  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1020  EPS I polysaccharide export outer membrane transmembrane protein  25.25 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  27.71 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2397  polysaccharide export protein  31.14 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00232374  normal  0.762704 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3282  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  30.54 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.306881  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1170  polysaccharide export protein  27.47 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0578  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.69 
 
 		 375 aa  72.8  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.809222  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  26.47 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3133  polysaccharide export protein  27.1 
 
 		 417 aa  72.8  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1660  polysaccharide export protein  24.4 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.614311  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  25.12 
 
 		 201 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4409  polysaccharide export protein  23.15 
 
 		 398 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0281  polysaccharide export outer membrane protein  28.14 
 
 		 207 aa  71.6  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.585377  normal  0.906054 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  24.09 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3071  polysaccharide export protein  25.65 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2478  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  26.34 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3126  polysaccharide export protein  27.95 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>