More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0267 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0267  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 610 aa  1244    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1087  DNA mismatch repair protein MutL  45.51 
 
 		 582 aa  476  1e-133  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0917186  normal  0.0241297 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2458  DNA mismatch repair protein MutL  58.66 
 
 		 711 aa  383  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.593809 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1729  DNA mismatch repair protein MutL  56.19 
 
 		 763 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  35.91 
 
 		 605 aa  351  2e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  37.7 
 
 		 607 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2319  DNA mismatch repair protein MutL  53.69 
 
 		 739 aa  348  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  37.38 
 
 		 607 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  36.69 
 
 		 606 aa  341  2e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  37.74 
 
 		 608 aa  342  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  34.63 
 
 		 628 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  35.83 
 
 		 602 aa  340  5.9999999999999996e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3464  DNA mismatch repair protein MutL  52.2 
 
 		 692 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  33.9 
 
 		 632 aa  338  9.999999999999999e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_002978  WD1306  DNA mismatch repair protein  35.1 
 
 		 608 aa  338  1.9999999999999998e-91  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.66007  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  34.81 
 
 		 647 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  34.53 
 
 		 584 aa  334  3e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  35.53 
 
 		 594 aa  333  5e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1919  DNA mismatch repair protein MutL  34.55 
 
 		 670 aa  333  5e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.770906  hitchhiker  0.00107591 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  36.72 
 
 		 645 aa  331  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  34.8 
 
 		 647 aa  330  3e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  36.73 
 
 		 601 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  36.6 
 
 		 648 aa  328  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  34.39 
 
 		 611 aa  325  1e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  36.56 
 
 		 643 aa  325  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  36.28 
 
 		 625 aa  325  2e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  35.48 
 
 		 603 aa  323  7e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  35.86 
 
 		 635 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2754  DNA mismatch repair protein  35.39 
 
 		 634 aa  321  3e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.679624 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  36.5 
 
 		 600 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  36.04 
 
 		 600 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  35.43 
 
 		 633 aa  320  5e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  35.33 
 
 		 633 aa  320  6e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  35.14 
 
 		 602 aa  320  6e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  36.18 
 
 		 623 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  35.48 
 
 		 633 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  35.49 
 
 		 632 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  33.65 
 
 		 586 aa  319  9e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  35.08 
 
 		 623 aa  318  1e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  35.08 
 
 		 623 aa  318  1e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  35.16 
 
 		 633 aa  319  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  35.17 
 
 		 632 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  33.76 
 
 		 622 aa  317  5e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  35.9 
 
 		 620 aa  317  5e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  34.8 
 
 		 566 aa  316  9e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  35.42 
 
 		 612 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  36.25 
 
 		 613 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1626  DNA mismatch repair protein  35.6 
 
 		 603 aa  315  1.9999999999999998e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.951242 
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  34.64 
 
 		 566 aa  314  2.9999999999999996e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  34.89 
 
 		 661 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  35.63 
 
 		 611 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  31.1 
 
 		 644 aa  313  4.999999999999999e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  34.95 
 
 		 626 aa  313  5.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  36.21 
 
 		 615 aa  313  6.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  34.55 
 
 		 639 aa  313  7.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  35.47 
 
 		 606 aa  312  1e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  33.33 
 
 		 652 aa  312  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  34.54 
 
 		 622 aa  312  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  32.12 
 
 		 630 aa  312  1e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  33.94 
 
 		 655 aa  312  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  33.64 
 
 		 629 aa  312  1e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  33.83 
 
 		 691 aa  312  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  33.17 
 
 		 608 aa  312  1e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  36.22 
 
 		 616 aa  311  2.9999999999999997e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  35.28 
 
 		 641 aa  310  2.9999999999999997e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  34.44 
 
 		 705 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  34.89 
 
 		 619 aa  309  6.999999999999999e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  35.93 
 
 		 632 aa  309  9e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  34.58 
 
 		 621 aa  309  1.0000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  33.96 
 
 		 636 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  34.04 
 
 		 687 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2946  DNA mismatch repair protein  36.15 
 
 		 629 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  33.49 
 
 		 630 aa  307  3e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0281  DNA mismatch repair protein  33.48 
 
 		 667 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0765  DNA mismatch repair protein  33.48 
 
 		 667 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0514  DNA mismatch repair protein  33.88 
 
 		 684 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2314  DNA mismatch repair protein  33.88 
 
 		 684 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2192  DNA mismatch repair protein  33.88 
 
 		 684 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3297  DNA mismatch repair protein  33.88 
 
 		 684 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365803  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3264  DNA mismatch repair protein  33.93 
 
 		 681 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.815986  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1085  DNA mismatch repair protein  33.88 
 
 		 684 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3308  DNA mismatch repair protein  34.14 
 
 		 681 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554472  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  34.31 
 
 		 566 aa  306  8.000000000000001e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  35.2 
 
 		 595 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  31.59 
 
 		 614 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  35.2 
 
 		 595 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  31.94 
 
 		 641 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0599  DNA mismatch repair protein MutL  32.02 
 
 		 621 aa  306  1.0000000000000001e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0798741  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  35.77 
 
 		 616 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  34.41 
 
 		 589 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  32.7 
 
 		 626 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  34.04 
 
 		 661 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  32.97 
 
 		 644 aa  303  5.000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  35.28 
 
 		 611 aa  303  6.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  30.91 
 
 		 644 aa  303  7.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  34.15 
 
 		 661 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1711  DNA mismatch repair protein MutL  32.2 
 
 		 588 aa  303  7.000000000000001e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.619498  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0215  DNA mismatch repair protein MutL  33.55 
 
 		 608 aa  302  1e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.137951 
 
 
-
 
NC_002978  WD0509  DNA mismatch repair protein  33.12 
 
 		 598 aa  302  1e-80  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.587743  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  34.41 
 
 		 628 aa  302  1e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>