101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3272 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3272  blue (type1) copper domain-containing protein  100 
 
 		 116 aa  239  7.999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.639699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2615  blue (type 1) copper domain protein  53.66 
 
 		 109 aa  96.3  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338185  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0599  plastocyanin/azurin family copper binding protein  43.4 
 
 		 111 aa  89.7  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2978  putative copper binding protein  38.37 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  36.11 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4734  amicyanin  34.74 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164074  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2424  blue (type1) copper domain-containing protein  32.5 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  37.04 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0561  amicyanin  41.18 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  37.93 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0968  plastocyanin  32.69 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2673  blue (type1) copper domain-containing protein  35.44 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0284633  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5325  blue (type 1) copper domain protein  35.63 
 
 		 114 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5049  blue (type1) copper domain-containing protein  35.29 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1272  hypothetical protein  35.48 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3607  blue (type1) copper domain-containing protein  35.56 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.400265  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4760  blue (type1) copper domain-containing protein  35.56 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1678  blue (type1) copper domain-containing protein  38.64 
 
 		 336 aa  61.2  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4700  blue (type1) copper domain-containing protein  34.57 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1788  plastocyanin-like protein  32.69 
 
 		 264 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4142  blue (type1) copper domain-containing protein  34.18 
 
 		 113 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.470905 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5523  blue (type1) copper domain-containing protein  35.56 
 
 		 112 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736304 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4608  blue (type1) copper domain-containing protein  35.44 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.811834 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1286  copper binding protein, plastocyanin  32.65 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.232717  normal  0.839304 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0817  blue (type1) copper domain-containing protein  34.12 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.737466  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3194  blue (type1) copper domain-containing protein  35 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0345  blue (type 1) copper domain protein  37.04 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  39.47 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  35.71 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0784  blue (type 1) copper domain protein  32.91 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46005  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3897  blue (type1) copper domain-containing protein  31 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.25 
 
 		 417 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0146  blue (type 1) copper domain protein  34.09 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1499  hypothetical protein  31.65 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0060  hypothetical protein  31.65 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  39.47 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  38.1 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1216  hypothetical protein  31.65 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  35.53 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0072  hypothetical protein  31.65 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  29.17 
 
 		 128 aa  52.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.590546 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0247  blue (type 1) copper domain protein  30 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  31.36 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  35.53 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1566  plastocyanin/azurin family copper binding protein  30.38 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0088  plastocyanin/azurin family copper binding protein  30.38 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0071  plastocyanin/azurin family copper binding protein  30.38 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4790  blue (type1) copper domain-containing protein  35.06 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339634  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2134  blue (type1) copper domain-containing protein  31.71 
 
 		 117 aa  52  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0741476  normal  0.352825 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  35.53 
 
 		 119 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  35.53 
 
 		 119 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  36.84 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  36.84 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  35.53 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6257  blue (type1) copper domain-containing protein  32.91 
 
 		 123 aa  50.8  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.417235 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  36.84 
 
 		 116 aa  50.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0975  blue (type1) copper domain-containing protein  31.65 
 
 		 120 aa  50.4  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4690  plastocyanin like protein  32.88 
 
 		 72 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.571062  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0323  blue (type1) copper domain-containing protein  29.55 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00521297  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1226  blue (type1) copper domain-containing protein  32.73 
 
 		 358 aa  48.9  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7490  Amicyanin precursor protein  26.73 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.41774  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1443  blue (type1) copper domain-containing protein  34.21 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  31.46 
 
 		 173 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  34.67 
 
 		 119 aa  47.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1273  blue (type1) copper domain-containing protein  37.84 
 
 		 287 aa  47.8  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.367942 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3976  blue (type 1) copper domain protein  28.24 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.262484  normal  0.466824 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4195  blue (type1) copper domain-containing protein  29.81 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0422303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0340  blue (type1) copper domain-containing protein  29.55 
 
 		 130 aa  45.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2695  hypothetical protein  27.93 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945566  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34733  plastocyanin, chloroplast precursor  29.76 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3000  hypothetical protein  28.57 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0511761 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  37.21 
 
 		 347 aa  44.7  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1734  hypothetical protein  25.45 
 
 		 276 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0063943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2773  hypothetical protein  27.55 
 
 		 123 aa  43.9  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.326615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0263  blue (type1) copper domain-containing protein  33.94 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.804107  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3670  blue (type1) copper domain-containing protein  26.44 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2854  halocyanin domain protein  35.8 
 
 		 210 aa  43.9  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.811461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3100  halocyanin domain protein  31.07 
 
 		 224 aa  43.9  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3095  blue (type1) copper domain-containing protein  31.25 
 
 		 192 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1439  hypothetical protein  28.42 
 
 		 103 aa  43.9  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  30.56 
 
 		 444 aa  43.9  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1637  blue (type1) copper domain-containing protein  31.65 
 
 		 623 aa  43.9  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1250  protease inhibitor Kazal-type  29.73 
 
 		 239 aa  43.5  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2896  hypothetical protein  27.1 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.328337 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0721  blue (type 1) copper domain protein  25.93 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0215  putative amicyanin precursor protein  27.17 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0925  blue (type1) copper domain-containing protein  29.76 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000269051 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3197  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.32 
 
 		 749 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0061261  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3177  blue (type 1) copper domain protein  28.75 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1102  blue (type1) copper domain-containing protein  31.17 
 
 		 318 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6437  hypothetical protein  27.78 
 
 		 107 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  25.47 
 
 		 137 aa  41.6  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3225  cell surface lipoprotein  24.05 
 
 		 218 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00779237  normal  0.0523754 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1705  pseudoazurin  33.64 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1156  halocyanin domain protein  32.91 
 
 		 186 aa  41.2  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.362387 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1652  blue (type 1) copper domain protein  26.8 
 
 		 486 aa  41.2  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373533  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2780  blue (type 1) copper domain protein  25.93 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1110  hypothetical protein  25.61 
 
 		 464 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4301  blue (type 1) copper domain protein  31.43 
 
 		 235 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3576  blue (type 1) copper domain protein  26.51 
 
 		 156 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384715  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>