More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2394 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2394  hypothetical protein  100 
 
 		 406 aa  814    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48898  normal  0.587335 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1622  protein of unknown function DUF214  53.23 
 
 		 413 aa  382  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0370  hypothetical protein  53.37 
 
 		 409 aa  363  3e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0369  hypothetical protein  37.16 
 
 		 403 aa  262  6.999999999999999e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1621  protein of unknown function DUF214  35.43 
 
 		 404 aa  253  5.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2542  hypothetical protein  36.96 
 
 		 441 aa  250  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429279  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2395  hypothetical protein  34.83 
 
 		 404 aa  246  8e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.111806  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1293  efflux ABC transporter, permease protein  32.2 
 
 		 436 aa  201  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1098  hypothetical protein  30.17 
 
 		 429 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0142755  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29500  hypothetical protein  33.41 
 
 		 416 aa  193  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2530  hypothetical protein  31.84 
 
 		 407 aa  192  8e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0995274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000978  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  30.19 
 
 		 422 aa  178  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07028  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  30.19 
 
 		 422 aa  177  4e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0383  hypothetical protein  29.76 
 
 		 419 aa  168  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6004  hypothetical protein  32.43 
 
 		 405 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5639  hypothetical protein  32.43 
 
 		 387 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7413  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.73 
 
 		 405 aa  159  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2438  hypothetical protein  30.81 
 
 		 406 aa  159  9e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6495  hypothetical protein  32.43 
 
 		 405 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96926 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6148  hypothetical protein  31.83 
 
 		 405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.315368 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5041  putative ABC transporter, permease protein  26.78 
 
 		 441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5303  protein of unknown function DUF214  27.9 
 
 		 830 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19660  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  26.42 
 
 		 400 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1801  protein of unknown function DUF214  27.15 
 
 		 412 aa  119  9e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23260  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  26.35 
 
 		 419 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0434  hypothetical protein  26.93 
 
 		 425 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6689  hypothetical protein  26.55 
 
 		 465 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874754  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  25.9 
 
 		 419 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2020  protein of unknown function DUF214  27.86 
 
 		 411 aa  109  9.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000619382  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1691  protein of unknown function DUF214  29.9 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.132145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1949  hypothetical protein  28.03 
 
 		 475 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.519015  hitchhiker  0.00836465 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2373  ABC-type transport system, permease component  29.19 
 
 		 407 aa  107  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000351897  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23240  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  25.24 
 
 		 415 aa  106  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2535  protein of unknown function DUF214  27.47 
 
 		 412 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5042  ABC transporter, permease protein, putative  26.13 
 
 		 415 aa  102  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1663  protein of unknown function DUF214  25.79 
 
 		 535 aa  97.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0435  hypothetical protein  26.65 
 
 		 431 aa  97.1  5e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.131989  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2374  ABC-type transport system, permease component  25.06 
 
 		 409 aa  96.7  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000200206  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3196  hypothetical protein  22.56 
 
 		 410 aa  94  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1112  efflux ABC transporter, permease protein  26.75 
 
 		 475 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001465  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  23.7 
 
 		 411 aa  90.9  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1391  efflux ABC transporter, permease protein  26.75 
 
 		 475 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2085  putative ABC transporter, permease protein  26.75 
 
 		 475 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.01072  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2376  efflux ABC transporter, permease protein  26.75 
 
 		 475 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2344  ABC transporter, permease protein, putative  27.17 
 
 		 477 aa  90.9  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1430  hypothetical protein  23.67 
 
 		 428 aa  91.3  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1172  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.55 
 
 		 416 aa  89.7  8e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0830739  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3143  efflux ABC transporter, permease protein  26.34 
 
 		 475 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183035  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2660  hypothetical protein  25.06 
 
 		 410 aa  88.2  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1472  putative permease  26.34 
 
 		 716 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3257  efflux ABC transporter, permease protein  25.93 
 
 		 475 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.289143  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3232  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.75 
 
 		 418 aa  87.8  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215903  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2509  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.27 
 
 		 414 aa  86.7  7e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418191  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3231  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.69 
 
 		 422 aa  86.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113164  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5136  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.69 
 
 		 422 aa  86.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5146  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.81 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2095  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.94 
 
 		 421 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00459774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3256  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.52 
 
 		 418 aa  84.3  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3700  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.53 
 
 		 417 aa  83.6  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.8164 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0507  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.68 
 
 		 427 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.5 
 
 		 420 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2901  hypothetical protein  27.35 
 
 		 411 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0934048 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  30.23 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2089  protein of unknown function DUF214  20.49 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00149352  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2024  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.75 
 
 		 417 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3479  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  27.46 
 
 		 422 aa  81.3  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.640884  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05402  hypothetical protein  25.49 
 
 		 411 aa  81.3  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0889  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.94 
 
 		 411 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  27.33 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2749  hypothetical protein  27.55 
 
 		 409 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0349567  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1887  lipoprotein releasing system transmembrane protein, putative  22.5 
 
 		 448 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.358126  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1014  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.08 
 
 		 418 aa  79.7  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0682578 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2755  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.02 
 
 		 417 aa  79.7  0.00000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1472  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  28.18 
 
 		 414 aa  79.7  0.00000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3421  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.02 
 
 		 417 aa  79.7  0.00000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.176273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3197  hypothetical protein  24.72 
 
 		 427 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5420  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.64 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  28.42 
 
 		 390 aa  79  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2498  hypothetical protein  22.26 
 
 		 380 aa  79.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00553555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  32 
 
 		 646 aa  78.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  26.27 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2748  putative lipoprotein releasing system transmembrane  23.82 
 
 		 418 aa  78.6  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1156  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.39 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.342008  normal  0.0203303 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2151  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.5 
 
 		 417 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0738534  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01530  hypothetical protein  28.1 
 
 		 374 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1696  lipoprotein releasing system transmembrane protein, putative  22.5 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1474  putative lipoprotein releasing system transmembrane protein  22.5 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2718  lipoprotein releasing system transmembrane protein, putative  22.5 
 
 		 417 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3117  putative lipoprotein releasing system transmembrane protein  22.5 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139824  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2534  protein of unknown function DUF214  25.78 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261611  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2201  putative lipoprotein releasing system transmembrane protein  22.5 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2132  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.39 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.435353  normal  0.150883 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2584  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.25 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.297179  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2639  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.25 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.795007  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2659  hypothetical protein  24.16 
 
 		 421 aa  77  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1566  ABC lipoprotein efflux pump, inner membrane subunit  24.38 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.764315  normal  0.414868 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5963  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.39 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1440  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.62 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141439  normal  0.211841 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2114  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.39 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.08589  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1850  ABC transporter, permease protein, putative  24.34 
 
 		 444 aa  76.6  0.0000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>