266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1793 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1793  OmpA/MotB  100 
 
 		 156 aa  301  3.0000000000000004e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.557894 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  48.98 
 
 		 532 aa  84.7  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2800  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 		 177 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.705658  normal  0.415796 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1878  OmpA/MotB domain protein  48.08 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2357  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.46 
 
 		 842 aa  82.4  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131798  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2055  OmpA/MotB domain-containing protein  48.08 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0263919  normal  0.321427 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  47.96 
 
 		 531 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  46.94 
 
 		 532 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  46.94 
 
 		 532 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0102  outer membrane related peptidoglycan-associated lipoprotein  53.4 
 
 		 214 aa  80.5  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207037  normal  0.26967 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0507  cytochrome c oxidase, subunit II  47.37 
 
 		 525 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3197  cytochrome c oxidase, subunit II  47.37 
 
 		 525 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1422  cytochrome c oxidase, subunit II  47.37 
 
 		 517 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0672  cytochrome c oxidase, subunit II  47.37 
 
 		 525 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2987  OmpA/MotB domain-containing protein  45.45 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.221024  normal  0.129145 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2849  cytochrome c oxidase, subunit II  47.37 
 
 		 517 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0170  cytochrome c oxidase, subunit II  47.37 
 
 		 517 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.32275  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2121  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.44 
 
 		 823 aa  79  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.475646 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0489  cytochrome c oxidase, subunit II  47.37 
 
 		 525 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  45.92 
 
 		 532 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2764  cytochrome c oxidase, subunit II  48.42 
 
 		 535 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2902  cytochrome c oxidase, subunit II  48.42 
 
 		 535 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  46.39 
 
 		 525 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3552  OmpA/MotB  54.55 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237192  normal  0.244916 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3709  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 183 aa  73.9  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  43.3 
 
 		 557 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  41.24 
 
 		 538 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  42.27 
 
 		 544 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4148  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.86 
 
 		 560 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3940  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 		 174 aa  62  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0125128  normal  0.230028 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  36.19 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  34.29 
 
 		 271 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0363  OmpA/MotB domain-containing protein  39.77 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.658698  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2189  ompA family protein  34.29 
 
 		 271 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3522  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 		 270 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 270 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 270 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1509  OmpA/MotB  35.92 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.152591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1976  OmpA/MotB domain protein  38.16 
 
 		 331 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0825703  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 270 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  30.19 
 
 		 641 aa  53.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  35.9 
 
 		 729 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.96 
 
 		 542 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15220  outer membrane protein, OmpA/MotB family  37.18 
 
 		 270 aa  51.6  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  37.66 
 
 		 270 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  31.09 
 
 		 1313 aa  51.6  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3541  OmpA/MotB  32.19 
 
 		 193 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.09094e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  29.85 
 
 		 543 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0908  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.98 
 
 		 172 aa  51.2  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.975322  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  32.35 
 
 		 464 aa  50.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0122  OmpA/MotB domain protein  34.58 
 
 		 310 aa  50.4  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  28 
 
 		 326 aa  50.4  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000475354  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  32.65 
 
 		 330 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0462  OmpA family protein  22.67 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5270  OmpA/MotB domain protein  31.63 
 
 		 464 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  32.11 
 
 		 638 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  33.03 
 
 		 658 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0277  OmpA/MotB domain protein  33.71 
 
 		 204 aa  49.7  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  34 
 
 		 464 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  37.5 
 
 		 463 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  32.76 
 
 		 344 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  31.13 
 
 		 505 aa  49.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  27.48 
 
 		 630 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  28.89 
 
 		 229 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  28.3 
 
 		 459 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  31.91 
 
 		 321 aa  49.7  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  32.08 
 
 		 544 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  31.68 
 
 		 227 aa  48.9  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3583  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.84 
 
 		 200 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  32.99 
 
 		 334 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 214 aa  48.1  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  31.07 
 
 		 670 aa  48.1  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  30.91 
 
 		 215 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  30.91 
 
 		 215 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  29.63 
 
 		 364 aa  47.8  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  30.91 
 
 		 215 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  30.91 
 
 		 215 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6672  OmpA/MotB domain-containing protein  34.07 
 
 		 552 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.263605 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  29.09 
 
 		 217 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  30.91 
 
 		 215 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  30.91 
 
 		 215 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  27.82 
 
 		 525 aa  47.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  32.08 
 
 		 214 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10918  outer membrane protein A ompA  35.19 
 
 		 326 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  32.47 
 
 		 424 aa  47  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0165  peptidoglycan-associated lipoprotein  29.33 
 
 		 174 aa  47  0.00009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  27.7 
 
 		 432 aa  47  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2746  OmpA family protein  37.86 
 
 		 451 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0862852  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0563  OmpA/MotB domain-containing protein  22 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  30.91 
 
 		 316 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2092  OmpA/MotB  29.41 
 
 		 289 aa  47  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000014464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2434  OmpA/MotB domain protein  32.38 
 
 		 507 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4669  OmpA/MotB domain protein  30.77 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2321  OmpA domain-containing protein  29.33 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.149229  normal  0.659387 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  30.91 
 
 		 261 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5488  peptidoglycan-associated lipoprotein  32 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.429117  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  34.23 
 
 		 220 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19452  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2738  OmpA/MotB domain-containing protein  28.07 
 
 		 289 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00376202  hitchhiker  0.000469935 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  30 
 
 		 631 aa  46.2  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2132  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.25 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.250962  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>