105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3940 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3940  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 174 aa  338  2.9999999999999998e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0125128  normal  0.230028 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2055  OmpA/MotB domain-containing protein  72.32 
 
 		 179 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0263919  normal  0.321427 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1878  OmpA/MotB domain protein  72.88 
 
 		 179 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2987  OmpA/MotB domain-containing protein  55.06 
 
 		 179 aa  158  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.221024  normal  0.129145 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2800  OmpA/MotB domain-containing protein  60.92 
 
 		 177 aa  156  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.705658  normal  0.415796 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3709  OmpA/MotB domain protein  46.7 
 
 		 183 aa  127  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2121  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  72.22 
 
 		 823 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.475646 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2357  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  62.75 
 
 		 842 aa  120  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131798  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3552  OmpA/MotB  44.62 
 
 		 196 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237192  normal  0.244916 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3197  cytochrome c oxidase, subunit II  46.32 
 
 		 525 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0672  cytochrome c oxidase, subunit II  46.32 
 
 		 525 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0170  cytochrome c oxidase, subunit II  46.81 
 
 		 517 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.32275  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1422  cytochrome c oxidase, subunit II  46.81 
 
 		 517 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0507  cytochrome c oxidase, subunit II  46.32 
 
 		 525 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2849  cytochrome c oxidase, subunit II  46.81 
 
 		 517 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  53.12 
 
 		 538 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0489  cytochrome c oxidase, subunit II  45.26 
 
 		 525 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  57.38 
 
 		 532 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1793  OmpA/MotB  32.93 
 
 		 156 aa  67.4  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.557894 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  57.38 
 
 		 532 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  57.38 
 
 		 532 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  54.1 
 
 		 544 aa  67  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  45.26 
 
 		 525 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0102  outer membrane related peptidoglycan-associated lipoprotein  51.02 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207037  normal  0.26967 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  55.74 
 
 		 557 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  55.74 
 
 		 531 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2902  cytochrome c oxidase, subunit II  55.74 
 
 		 535 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  55.74 
 
 		 532 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2764  cytochrome c oxidase, subunit II  55.74 
 
 		 535 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4148  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.62 
 
 		 560 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6457  OmpA/MotB domain-containing protein  31.71 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6618  OmpA/MotB domain-containing protein  36.27 
 
 		 248 aa  47.8  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.978639  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2189  ompA family protein  33.98 
 
 		 271 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  32.35 
 
 		 648 aa  46.2  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3084  OmpA/MotB domain-containing protein  37.17 
 
 		 242 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180513 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.05 
 
 		 248 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0357  OmpA/MotB  30.95 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 270 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  30.69 
 
 		 231 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1888  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  37.5 
 
 		 919 aa  45.4  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.640223  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  33.98 
 
 		 271 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  32.04 
 
 		 270 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  33.94 
 
 		 330 aa  44.7  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  33.66 
 
 		 240 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5131  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 		 170 aa  44.7  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  37.21 
 
 		 206 aa  44.3  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  37.21 
 
 		 206 aa  44.3  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  32.11 
 
 		 1026 aa  44.3  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51710  peptidoglycan associated lipoprotein OprL precursor  34.95 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000147686  hitchhiker  0.00068918 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1412  OmpA/MotB domain-containing protein  34.18 
 
 		 321 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.166227  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0784  OmpA/MotB domain-containing protein  39.13 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0131111  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4535  peptidoglycan associated lipoprotein OprL precursor  34.95 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  32.69 
 
 		 587 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2453  sodium-type flagellar protein MotY, putative  27.82 
 
 		 280 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.230815  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0736  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  39.73 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  27.2 
 
 		 537 aa  43.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0354  OmpA/MotB domain protein  32.67 
 
 		 315 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.322397 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  33.68 
 
 		 226 aa  43.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2674  OmpA/MotB  33.77 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  39.13 
 
 		 326 aa  43.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000475354  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  35.71 
 
 		 224 aa  43.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  31.68 
 
 		 247 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  40.85 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  31.68 
 
 		 240 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3522  OmpA/MotB domain-containing protein  32.04 
 
 		 270 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36630  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  35.92 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.668034  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  31.68 
 
 		 236 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  35.62 
 
 		 264 aa  42.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  32.67 
 
 		 237 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  36.49 
 
 		 215 aa  42.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1278  OmpA domain-containing protein  34.95 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0630955  normal  0.378402 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0603  OmpA family protein  37.97 
 
 		 207 aa  42.4  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  32.67 
 
 		 237 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 543 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  30.1 
 
 		 270 aa  42  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1455  OmpA/MotB domain-containing protein  34.65 
 
 		 324 aa  42.4  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.935476  normal  0.139769 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  33.33 
 
 		 261 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  30.72 
 
 		 244 aa  42  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  30.1 
 
 		 270 aa  42  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  33.33 
 
 		 261 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  31.07 
 
 		 270 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.33 
 
 		 542 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  37.68 
 
 		 345 aa  41.6  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  37.68 
 
 		 321 aa  41.6  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0685  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.72 
 
 		 173 aa  41.6  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163413  normal  0.289483 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0729  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.36 
 
 		 173 aa  41.6  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0152345  normal  0.212711 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  31.53 
 
 		 227 aa  41.6  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 544 aa  41.6  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  40.58 
 
 		 220 aa  41.2  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2349  OmpA/MotB domain-containing protein  40.3 
 
 		 215 aa  41.2  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0905515  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  33.8 
 
 		 212 aa  41.2  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0796  OmpA/MotB  32.89 
 
 		 170 aa  41.2  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53166  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1848  NAD-dependent DNA ligase  32.67 
 
 		 195 aa  40.8  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.449373  normal  0.815473 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2483  OmpA/MotB domain-containing protein  40.3 
 
 		 232 aa  41.2  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421874  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  32.67 
 
 		 321 aa  41.2  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06186  hypothetical protein  28.16 
 
 		 216 aa  41.2  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  37.68 
 
 		 229 aa  40.8  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  37.31 
 
 		 220 aa  40.8  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  30.08 
 
 		 222 aa  40.8  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3257  OmpA/MotB domain-containing protein  34.86 
 
 		 576 aa  40.8  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>