63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5940 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5940  fimbrial protein  100 
 
 		 335 aa  678    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5763  fimbrial protein  33.96 
 
 		 396 aa  129  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000317961 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0124  fimbrial protein  33.2 
 
 		 334 aa  103  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5793  fimbrial protein  29.76 
 
 		 311 aa  95.5  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0492679 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5939  hypothetical protein  31.79 
 
 		 262 aa  79  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.528612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4996  fimbrial protein  36.06 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.230772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3297  fimbrial protein  30.61 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0152009 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2875  fimbrial protein  32.47 
 
 		 355 aa  76.6  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2230  type-1 fimbrial protein, A subunit  31.63 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1024  type-1 fimbrial protein, A subunit  31.12 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2087  major fimbrial subunit protein  31.12 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4253  fimbrial protein  31.97 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413623  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0564  Fimbrial protein  31.35 
 
 		 345 aa  67  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.648396 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6926  Fimbrial protein  28.31 
 
 		 340 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.289443  normal  0.816903 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2030  type-1 fimbrial protein, A subunit  37.96 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0060  fimbrial adhesin precursor  29.08 
 
 		 354 aa  64.3  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.485498  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0062  fimbrial adhesin precursor  27.2 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.571199  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0050  fimbrial protein  29.08 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1052  fimbrial protein  30.5 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0195347 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1072  fimbrial protein  30.99 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1816  fimbrial protein-like protein  28.02 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2785  fimbrial protein  28.27 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.971875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  32.45 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2238  fimbrial protein  33.09 
 
 		 327 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160036  decreased coverage  0.00460081 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2241  fimbrial protein  27.19 
 
 		 331 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0288255  normal  0.0430038 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  31.79 
 
 		 185 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  31.79 
 
 		 185 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  31.79 
 
 		 185 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  31.79 
 
 		 185 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  32.48 
 
 		 187 aa  52.8  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  33.55 
 
 		 175 aa  50.1  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6274  type-1 fimbrial protein subunit A  22.64 
 
 		 306 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2283  Fimbrial protein  32.89 
 
 		 183 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4796  fimbrial protein FimF  32.65 
 
 		 176 aa  48.5  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  36.55 
 
 		 193 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04187  minor component of type 1 fimbriae  30.9 
 
 		 176 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04149  hypothetical protein  30.9 
 
 		 176 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5824  fimbrial protein FimF  30.9 
 
 		 176 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3679  Fimbrial protein  30.9 
 
 		 176 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.544356  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4544  fimbrial protein FimF  30.9 
 
 		 176 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.596311  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4915  protein FimF  30.34 
 
 		 176 aa  47  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4845  fimbrial protein FimF  29.78 
 
 		 176 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3982  protein LpfE  27.86 
 
 		 174 aa  46.2  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.567222  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  32.12 
 
 		 175 aa  46.2  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  34.67 
 
 		 182 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3289  fimbrial protein  30.6 
 
 		 134 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.222873 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2545  fimbrial protein  27.04 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.625686 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  30.92 
 
 		 170 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  30.92 
 
 		 170 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  30.92 
 
 		 170 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  30.92 
 
 		 170 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  30.92 
 
 		 170 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1454  fimbrial protein  29.22 
 
 		 360 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118343 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  31.08 
 
 		 176 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1697  fimbrial protein  27.78 
 
 		 345 aa  43.9  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1498  fimbrial protein  32.43 
 
 		 359 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  32.5 
 
 		 176 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  32.5 
 
 		 176 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  32.5 
 
 		 176 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  32.19 
 
 		 172 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  34 
 
 		 184 aa  43.5  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1051  fimbrial protein  33.57 
 
 		 174 aa  43.1  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0357059 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4025  fimbrial protein  26.09 
 
 		 334 aa  42.7  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.355446 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>