140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4553 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4553  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 247 aa  487  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3873  extracellular solute-binding protein  68.35 
 
 		 250 aa  325  6e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.543903  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_003296  RS04698  periplasmic substrate binding ABC transporter protein  66.67 
 
 		 245 aa  315  4e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.291783 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7267  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  66.8 
 
 		 264 aa  310  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6190  extracellular solute-binding protein family 3  66.12 
 
 		 273 aa  308  4e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6273  extracellular solute-binding protein  67.49 
 
 		 244 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5977  extracellular solute-binding protein  67.21 
 
 		 244 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2836  extracellular solute-binding protein  65.96 
 
 		 248 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.918231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6880  extracellular solute-binding protein  65.57 
 
 		 244 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.21399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5602  extracellular solute-binding protein  65.29 
 
 		 244 aa  293  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5966  extracellular solute-binding protein  65.42 
 
 		 349 aa  291  7e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5653  extracellular solute-binding protein  63.79 
 
 		 243 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.493733 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3717  extracellular solute-binding protein  62.96 
 
 		 243 aa  289  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4651  extracellular solute-binding protein  62.96 
 
 		 243 aa  289  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.545523  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6466  extracellular solute-binding protein  64.46 
 
 		 244 aa  289  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.59873  normal  0.0219509 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3154  extracellular solute-binding protein family 3  61.86 
 
 		 249 aa  277  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0903537  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4744  extracellular solute-binding protein family 3  60.85 
 
 		 277 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273902  normal  0.741652 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1361  extracellular solute-binding protein  49.79 
 
 		 269 aa  237  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0588  extracellular solute-binding protein family 3  52.45 
 
 		 207 aa  218  7e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1628  extracellular solute-binding protein  52.38 
 
 		 279 aa  202  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.625521  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4109  extracellular solute-binding protein  50.21 
 
 		 264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.664204  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3636  extracellular solute-binding protein family 3  48.67 
 
 		 238 aa  184  8e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.59453 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8634  extracellular solute-binding protein family 3  40 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2646  extracellular solute-binding protein  34.85 
 
 		 266 aa  132  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.997273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45195  predicted protein  37.34 
 
 		 253 aa  132  6e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.177256  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0285  extracellular solute-binding protein  31.09 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.994895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3455  putative amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  32.42 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1297  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4313  extracellular solute-binding protein  31.28 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.438014  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  26.37 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  26.37 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2601  extracellular solute-binding protein  23.42 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.186233 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6677  extracellular solute-binding protein  34.25 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3978  extracellular solute-binding protein  29.93 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0094  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.49 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.546217  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3110  extracellular solute-binding protein family 3  36 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6284  putative periplasmic-binding protein  22.47 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2649  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.57 
 
 		 269 aa  53.9  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4514  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.968225  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0237  extracellular solute-binding protein family 3  25.76 
 
 		 267 aa  52.8  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.640745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0887  extracellular solute-binding protein  29.5 
 
 		 290 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1498  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6331  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 		 268 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.483344  normal  0.916228 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1705  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.216099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6996  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 		 268 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0898754 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0150  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 		 306 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0729  extracellular solute-binding protein  29.71 
 
 		 318 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.446742  normal  0.30254 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1489  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 268 aa  50.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3130  extracellular solute-binding protein  28.19 
 
 		 263 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0202  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 		 306 aa  49.7  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.725948  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1513  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  23.87 
 
 		 260 aa  49.7  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  26.63 
 
 		 253 aa  49.3  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0043  cyclohexadienyl dehydratase  25.64 
 
 		 265 aa  48.9  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3976  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 		 268 aa  48.5  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2432  glutamine ABC transporter extracellular solute-binding family 3 protein  28.25 
 
 		 263 aa  48.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.151494  normal  0.0748361 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0211  extracellular solute-binding protein  26.41 
 
 		 274 aa  48.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3190  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.22 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3673  extracellular solute-binding protein family 3  28.77 
 
 		 275 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3329  extracellular solute-binding protein  25.22 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1742  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 		 273 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1959  extracellular solute-binding protein  31.33 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.553895 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5951  extracellular solute-binding protein family 3  27.85 
 
 		 276 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245803  normal  0.0107841 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0788  putative ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.33 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334731 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4588  extracellular solute-binding protein  28.87 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0319028  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3449  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  25.22 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3891  Arogenate dehydratase  25 
 
 		 265 aa  47  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0903  extracellular solute-binding protein family 3  23.64 
 
 		 307 aa  46.6  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  27.06 
 
 		 1574 aa  47  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1846  extracellular solute-binding protein  33.07 
 
 		 277 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.898841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 247 aa  46.6  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2945  prephenate dehydratase  23.32 
 
 		 270 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0273907  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0110  prephenate dehydratase  23.32 
 
 		 270 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433262  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3226  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.36 
 
 		 1251 aa  46.2  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0796968  normal  0.806997 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3266  putative PAS/PAC sensor protein  28.03 
 
 		 830 aa  46.2  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0125  arogenate dehydratase  23.32 
 
 		 270 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5167  extracellular solute-binding protein family 3  27.21 
 
 		 318 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5245  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.43 
 
 		 261 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0999  extracellular solute-binding protein  28.06 
 
 		 304 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.584157 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3631  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 		 282 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.867063  normal  0.017598 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3291  cyclohexadienyl dehydratase  23.32 
 
 		 266 aa  45.8  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.87694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0448  extracellular solute-binding protein family 3  20.44 
 
 		 298 aa  45.8  0.0007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.917749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07790  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  29.33 
 
 		 278 aa  45.8  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0230  extracellular solute-binding protein  28.93 
 
 		 268 aa  45.8  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0306  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 		 261 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0449  extracellular solute-binding protein  21.05 
 
 		 263 aa  45.4  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0013  extracellular solute-binding protein  31.17 
 
 		 253 aa  45.4  0.0009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126244  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0298  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7091  extracellular solute-binding protein family 3  27.22 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0100  prephenate dehydratase  23.3 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688966  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0782  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 		 269 aa  45.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2438  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5218  extracellular solute-binding protein  23.28 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1916  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 261 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.189267 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1958  putative PAS/PAC sensor protein  26.23 
 
 		 598 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1010  extracellular solute-binding protein  32.32 
 
 		 267 aa  43.9  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2115  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 		 604 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00123104  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  24.84 
 
 		 266 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4039  extracellular solute-binding protein family 3  25.84 
 
 		 295 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0726  histidine kinase  28.21 
 
 		 570 aa  43.9  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.408803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3925  extracellular solute-binding protein family 3  25.84 
 
 		 295 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>