233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4256 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4256  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  635    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011054  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0966  hypothetical protein  70.32 
 
 
310 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4277  hypothetical protein  73.23 
 
 
310 aa  461  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114263  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4223  hypothetical protein  72.58 
 
 
310 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.825511  normal  0.514911 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3749  hypothetical protein  72.58 
 
 
310 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3190  hypothetical protein  72.26 
 
 
310 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4033  hypothetical protein  72.26 
 
 
310 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.671915  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4333  hypothetical protein  72.26 
 
 
310 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0605  hypothetical protein  73.55 
 
 
310 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1829  hypothetical protein  73.55 
 
 
310 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.580374  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2597  protein of unknown function DUF849  74.43 
 
 
310 aa  450  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1122  hypothetical protein  73.23 
 
 
310 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0862  hypothetical protein  73.55 
 
 
310 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2337  hypothetical protein  72.58 
 
 
310 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1036  hypothetical protein  72.58 
 
 
310 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  64.19 
 
 
310 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2778  hypothetical protein  68.39 
 
 
314 aa  418  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  67.74 
 
 
310 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0956  hypothetical protein  61.29 
 
 
310 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3694  protein of unknown function DUF849  65.81 
 
 
309 aa  409  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4641  hypothetical protein  65.81 
 
 
309 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.719101  normal  0.130782 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6069  hypothetical protein  64.38 
 
 
307 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0426  hypothetical protein  63 
 
 
321 aa  398  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2660  hypothetical protein  65.48 
 
 
310 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2304  hypothetical protein  65.02 
 
 
309 aa  395  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284141 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1700  hypothetical protein  63.28 
 
 
308 aa  394  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3905  hypothetical protein  61.41 
 
 
310 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.251797 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4704  hypothetical protein  64.52 
 
 
310 aa  397  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1601  hypothetical protein  60.84 
 
 
334 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2854  hypothetical protein  65.05 
 
 
315 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5291  hypothetical protein  61.49 
 
 
311 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.125866 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2897  hypothetical protein  63.87 
 
 
309 aa  388  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18549  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3578  hypothetical protein  60.77 
 
 
310 aa  390  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  59.8 
 
 
312 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1172  hypothetical protein  64.67 
 
 
311 aa  382  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  53.23 
 
 
310 aa  379  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3093  hypothetical protein  61.81 
 
 
310 aa  374  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.615612 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0271  hypothetical protein  58.2 
 
 
310 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0058593  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0977  protein of unknown function DUF849  57.98 
 
 
310 aa  351  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3741  hypothetical protein  60.33 
 
 
306 aa  349  3e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3015  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  59.67 
 
 
306 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7701  hypothetical protein  57.57 
 
 
309 aa  344  8.999999999999999e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1056  hypothetical protein  55.81 
 
 
310 aa  342  4e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1687  hypothetical protein  56.21 
 
 
309 aa  342  5e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382631  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0103  hypothetical protein  56.49 
 
 
312 aa  341  7e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.109916  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3415  hypothetical protein  56.86 
 
 
308 aa  340  2e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0831805 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3777  hypothetical protein  55.95 
 
 
311 aa  322  5e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0940629 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5054  hypothetical protein  53.75 
 
 
313 aa  321  9.999999999999999e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486178  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0471  hypothetical protein  51.96 
 
 
309 aa  316  3e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4531  hypothetical protein  54.13 
 
 
309 aa  316  3e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.244191 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4648  hypothetical protein  54.13 
 
 
311 aa  316  4e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3076  hypothetical protein  56.27 
 
 
310 aa  310  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317072  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2002  hypothetical protein  46.58 
 
 
326 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2297  hypothetical protein  44.84 
 
 
310 aa  249  6e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1538  hypothetical protein  45.16 
 
 
310 aa  248  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  39.93 
 
 
273 aa  204  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5047  hypothetical protein  41.02 
 
 
308 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0287132  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  36.28 
 
 
293 aa  176  5e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  36.54 
 
 
305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  35.67 
 
 
297 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  34.71 
 
 
297 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  36.12 
 
 
289 aa  171  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  38.33 
 
 
272 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  38 
 
 
272 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  37.67 
 
 
272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1933  hypothetical protein  70.87 
 
 
129 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00663582  normal  0.160662 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  32.01 
 
 
296 aa  166  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  32.7 
 
 
297 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  34.11 
 
 
275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  31.96 
 
 
292 aa  162  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  36.19 
 
 
293 aa  162  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  33.44 
 
 
273 aa  162  8.000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  34.23 
 
 
273 aa  162  1e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  36.39 
 
 
311 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  32.23 
 
 
287 aa  160  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  37.67 
 
 
272 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  36.24 
 
 
321 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  35.35 
 
 
301 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  33.86 
 
 
304 aa  154  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  33.22 
 
 
272 aa  154  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  33.65 
 
 
294 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  35.45 
 
 
271 aa  152  8.999999999999999e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  33.65 
 
 
294 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  33.65 
 
 
294 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  32.7 
 
 
294 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5071  hypothetical protein  34.5 
 
 
295 aa  149  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  32.18 
 
 
290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1017  protein of unknown function DUF849  34.6 
 
 
293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000125138  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2361  hypothetical protein  30.06 
 
 
298 aa  146  5e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.479394  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2917  hypothetical protein  34.39 
 
 
295 aa  145  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.041062  normal  0.0930195 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  31.25 
 
 
296 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  34.28 
 
 
294 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5231  hypothetical protein  34.39 
 
 
295 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.225304  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1780  hypothetical protein  34.92 
 
 
291 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0176081  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3203  hypothetical protein  30.69 
 
 
316 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272252  normal  0.299347 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1958  hypothetical protein  34.18 
 
 
309 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2173  hypothetical protein  34.07 
 
 
300 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414156  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0986  hypothetical protein  34.18 
 
 
309 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2128  hypothetical protein  34.49 
 
 
309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0851  hypothetical protein  34.49 
 
 
309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>