More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3925 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3925  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 298 aa  609  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0345488  normal  0.030729 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3091  Alpha/beta hydrolase  78.77 
 
 		 294 aa  481  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.1055 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2767  alpha/beta hydrolase fold  76.7 
 
 		 297 aa  449  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2543  alpha/beta hydrolase fold  70.82 
 
 		 298 aa  422  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.239971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  39.18 
 
 		 309 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  39.18 
 
 		 309 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  39.18 
 
 		 309 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2211  putative hydrolase  39.66 
 
 		 320 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  38.3 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  38.3 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  37.99 
 
 		 283 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  36.73 
 
 		 324 aa  177  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  36.43 
 
 		 282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  35.66 
 
 		 262 aa  169  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26090  putative hydrolase  34.84 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.860193 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  39.29 
 
 		 290 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  34.88 
 
 		 335 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  35.47 
 
 		 346 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6868  Alpha/beta hydrolase  33.09 
 
 		 312 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  32.5 
 
 		 321 aa  152  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2809  alpha/beta hydrolase fold protein  35.36 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  32.55 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  36.62 
 
 		 291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1225  alpha/beta hydrolase fold  38.87 
 
 		 292 aa  145  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.475843  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 		 291 aa  145  9e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  36.27 
 
 		 291 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  36.27 
 
 		 291 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  35.46 
 
 		 291 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 335 aa  142  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  35.46 
 
 		 291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0533  alpha/beta hydrolase fold  36.52 
 
 		 284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 		 302 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 		 351 aa  139  7e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  34.05 
 
 		 278 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  34.39 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  29.51 
 
 		 311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  31.99 
 
 		 304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6445  alpha/beta hydrolase fold protein  31.97 
 
 		 340 aa  136  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668195  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02030  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.66 
 
 		 341 aa  135  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  30.14 
 
 		 317 aa  135  8e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  28.27 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  29.75 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4626  alpha/beta hydrolase fold protein  32.46 
 
 		 348 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  32.62 
 
 		 296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  29.69 
 
 		 303 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 		 287 aa  116  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 		 291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4088  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 		 309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.90454  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2668  alpha/beta hydrolase fold protein  32.85 
 
 		 278 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  31.65 
 
 		 301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  34.81 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 		 292 aa  108  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  32.76 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  26.77 
 
 		 289 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  25.44 
 
 		 290 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2970  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 315 aa  106  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  35.21 
 
 		 300 aa  105  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 		 294 aa  105  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  26.39 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 		 286 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  32.11 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3835  Alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0435059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1864  Alpha/beta hydrolase  31.16 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  hitchhiker  0.00668375 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  31.49 
 
 		 288 aa  103  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  30.45 
 
 		 307 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4103  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 		 301 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  30.56 
 
 		 288 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  29.25 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4275  putative hydrolase  34.64 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0484838 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  31.77 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 287 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1728  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.0268844 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1453  alpha/beta hydrolase fold  32.86 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2350  alpha/beta hydrolase fold  33.8 
 
 		 298 aa  99  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2964  alpha/beta hydrolase fold  33.8 
 
 		 298 aa  99  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391734  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  31.49 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 		 291 aa  99  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  32.55 
 
 		 270 aa  98.6  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1448  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.358742 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3226  alpha/beta hydrolase fold protein  29.9 
 
 		 297 aa  97.1  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476161 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2985  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 298 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 288 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0308  epoxide hydrolase-related protein  33.57 
 
 		 316 aa  97.1  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2960  alpha/beta hydrolase fold  33.8 
 
 		 298 aa  96.7  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  27.54 
 
 		 284 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  33.67 
 
 		 297 aa  95.9  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  34.23 
 
 		 292 aa  95.5  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5258  haloacetate dehalogenase  32.99 
 
 		 292 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  26.99 
 
 		 290 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0537  putative hydrolase  33.21 
 
 		 316 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195807  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1354  alpha/beta hydrolase fold  29.69 
 
 		 302 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3012  alpha/beta hydrolase fold  33.68 
 
 		 298 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  31.12 
 
 		 297 aa  94  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  30.69 
 
 		 295 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0347  putative epoxide hydrolase  33.21 
 
 		 297 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0359  putative epoxide hydrolase  33.21 
 
 		 297 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  28.08 
 
 		 301 aa  93.2  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>