289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2892 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  100 
 
 
399 aa  830    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1859  di-haem cytochrome c peroxidase  64.69 
 
 
398 aa  493  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3799  Cytochrome-c peroxidase  49.74 
 
 
427 aa  374  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0226321  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0145  di-haem cytochrome c peroxidase  51.14 
 
 
383 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0005  cytochrome-c peroxidase  48.35 
 
 
395 aa  343  2e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000020159 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0005  di-haem cytochrome c peroxidase  44.92 
 
 
401 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  42.15 
 
 
369 aa  300  4e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1590  cytochrome-c peroxidase  46.81 
 
 
398 aa  293  4e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.133335  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3631  cytochrome-c peroxidase  41.23 
 
 
390 aa  225  8e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0505  cytochrome-c peroxidase  40.76 
 
 
365 aa  219  8.999999999999998e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0442639  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  36.74 
 
 
343 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0943  di-haem cytochrome c peroxidase  38.07 
 
 
308 aa  211  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.832679  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1193  cytochrome-c peroxidase  38.9 
 
 
333 aa  209  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  41.07 
 
 
357 aa  206  8e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3699  Cytochrome-c peroxidase  40 
 
 
328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281509  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5504  Di-heme cytochrome c peroxidase  40 
 
 
297 aa  195  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  36.13 
 
 
365 aa  188  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  36.44 
 
 
360 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  36.13 
 
 
336 aa  180  4e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  36.22 
 
 
594 aa  180  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  35.45 
 
 
377 aa  178  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  35.2 
 
 
352 aa  176  6e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  35.2 
 
 
352 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  35.07 
 
 
346 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3035  Cytochrome-c peroxidase  36.68 
 
 
401 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0428958  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  33.94 
 
 
369 aa  172  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  32.82 
 
 
353 aa  171  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  36.89 
 
 
352 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5007  cytochrome-c peroxidase  34.52 
 
 
347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3388  Cytochrome-c peroxidase  31.74 
 
 
373 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109099  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 
365 aa  162  9e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  33.82 
 
 
431 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06665  probable cytochrome-c peroxidase  33.42 
 
 
341 aa  161  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  35.91 
 
 
348 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  32.83 
 
 
349 aa  160  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  31.53 
 
 
358 aa  159  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  35.06 
 
 
417 aa  159  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  33.06 
 
 
365 aa  158  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4460  Cytochrome-c peroxidase  33.91 
 
 
345 aa  157  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0825354 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  33.03 
 
 
333 aa  156  6e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  33.24 
 
 
768 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  30.92 
 
 
346 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  32.52 
 
 
346 aa  151  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  31.48 
 
 
379 aa  150  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  31.12 
 
 
358 aa  150  6e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1545  Cytochrome-c peroxidase  29.9 
 
 
384 aa  149  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16368  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2527  cytochrome-c peroxidase  34.04 
 
 
359 aa  149  6e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.730316  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  31.99 
 
 
337 aa  149  9e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  34.91 
 
 
437 aa  149  9e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04430  probable cytochrome-c peroxidase  32.23 
 
 
359 aa  149  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  31.44 
 
 
473 aa  146  5e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  31.04 
 
 
346 aa  146  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0893  cytochrome-c peroxidase  31.61 
 
 
340 aa  146  6e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.849776  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  33.43 
 
 
343 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  33.22 
 
 
352 aa  145  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  35.4 
 
 
311 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  31.74 
 
 
521 aa  144  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  33.24 
 
 
626 aa  144  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  32.7 
 
 
598 aa  142  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2827  cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 
377 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  34.48 
 
 
431 aa  139  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3904  cytochrome-c peroxidase  31.32 
 
 
330 aa  139  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0489303 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  32.66 
 
 
398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  31.43 
 
 
328 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  30.25 
 
 
345 aa  137  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2697  cytochrome c peroxidase  33.95 
 
 
357 aa  136  7.000000000000001e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.521922  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3489  Cytochrome-c peroxidase  32.72 
 
 
368 aa  136  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537332  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  30.09 
 
 
464 aa  135  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  32.46 
 
 
459 aa  134  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4821  cytochrome-c peroxidase  30.95 
 
 
328 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  28.31 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0020  Di-haem cytochrome c peroxidase  33.83 
 
 
345 aa  134  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 
345 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5805  Cytochrome-c peroxidase  31.27 
 
 
571 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  30.49 
 
 
459 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  30.49 
 
 
459 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  30.49 
 
 
459 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2744  cytochrome-c peroxidase  32.7 
 
 
332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  33.23 
 
 
626 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2395  BCCP, cytochrome c peroxidase  33.45 
 
 
347 aa  130  6e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1058  cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 
347 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0622508  normal  0.212255 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2381  Cytochrome-c peroxidase  31.55 
 
 
616 aa  129  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298438  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2379  Cytochrome-c peroxidase  31.27 
 
 
592 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.574362  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2378  cytochrome-c peroxidase  30 
 
 
384 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.804271 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4553  di-haem cytochrome c peroxidase  33.21 
 
 
314 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0088  cytochrome c551 peroxidase  32.85 
 
 
306 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2943  cytochrome c551 peroxidase, putative  32.08 
 
 
332 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.258388 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1377  cytochrome-c peroxidase  32.6 
 
 
347 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.189071 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3118  cytochrome C peroxidase  29.23 
 
 
662 aa  127  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2655  cytochrome-c peroxidase  28.7 
 
 
350 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.872358  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  30.82 
 
 
335 aa  127  5e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  31.14 
 
 
331 aa  126  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2671  Cytochrome-c peroxidase  32.14 
 
 
397 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  30.82 
 
 
346 aa  124  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0047  cytochrome c551 peroxidase  32.27 
 
 
304 aa  125  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4210  cytochrome-c peroxidase  30.22 
 
 
466 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0020  cytochrome c551 peroxidase  31.9 
 
 
304 aa  123  4e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  29.73 
 
 
346 aa  124  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4031  cytoChrome-c peroxidase  30.22 
 
 
466 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4103  cytochrome-c peroxidase  30.22 
 
 
466 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>