More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0187 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0187  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  671    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0143  hypothetical protein  85.95 
 
 		 324 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0125  hypothetical protein  86.29 
 
 		 324 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1315  hypothetical protein  52.74 
 
 		 328 aa  352  5e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39846  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2006  hypothetical protein  53.74 
 
 		 345 aa  315  6e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.88077 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3797  extra-cytoplasmic solute receptor  45.75 
 
 		 320 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3537  hypothetical protein  42.95 
 
 		 322 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  43.2 
 
 		 358 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4415  extra-cytoplasmic solute receptor  46.1 
 
 		 320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.597884  normal  0.464948 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  41.72 
 
 		 339 aa  252  6e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  43.96 
 
 		 336 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  43.88 
 
 		 356 aa  242  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  41.85 
 
 		 326 aa  241  9e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  41.64 
 
 		 331 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  41.69 
 
 		 314 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  41.75 
 
 		 329 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  43.03 
 
 		 353 aa  236  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  41.09 
 
 		 327 aa  235  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  40.8 
 
 		 328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  38.69 
 
 		 332 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  41.18 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  41.31 
 
 		 335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  39.86 
 
 		 330 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  39.86 
 
 		 330 aa  232  5e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  43.64 
 
 		 328 aa  232  7.000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  41.38 
 
 		 322 aa  232  8.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  41.81 
 
 		 328 aa  231  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  43.31 
 
 		 328 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4537  hypothetical protein  38.85 
 
 		 319 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000308592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  40.2 
 
 		 325 aa  229  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  39.42 
 
 		 329 aa  229  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  41.58 
 
 		 327 aa  228  8e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  41.78 
 
 		 327 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2909  hypothetical protein  39.93 
 
 		 323 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  41.24 
 
 		 355 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  39.26 
 
 		 330 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  41.61 
 
 		 322 aa  227  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  41.44 
 
 		 325 aa  227  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  41.44 
 
 		 327 aa  227  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  42.25 
 
 		 328 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0599  hypothetical protein  41.1 
 
 		 325 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127348  normal  0.507852 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  39.08 
 
 		 331 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1233  hypothetical protein  40.82 
 
 		 326 aa  225  7e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.305229  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  41.72 
 
 		 334 aa  225  8e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  39.73 
 
 		 323 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  40.61 
 
 		 349 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  41.2 
 
 		 333 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  40.52 
 
 		 337 aa  223  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  41.58 
 
 		 331 aa  223  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  37.7 
 
 		 323 aa  223  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0120  hypothetical protein  40.21 
 
 		 361 aa  223  4e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  38.51 
 
 		 324 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  38.96 
 
 		 331 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  38.64 
 
 		 324 aa  222  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  39.26 
 
 		 331 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  40.47 
 
 		 326 aa  222  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  42.23 
 
 		 322 aa  222  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  42.31 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  41.89 
 
 		 386 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  39.72 
 
 		 330 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  43.53 
 
 		 325 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  42.27 
 
 		 326 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  39.39 
 
 		 324 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  38.79 
 
 		 327 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3216  hypothetical protein  39.54 
 
 		 332 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  40.8 
 
 		 328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  41.1 
 
 		 322 aa  220  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  39.35 
 
 		 320 aa  220  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  38.19 
 
 		 348 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2502  hypothetical protein  39.86 
 
 		 333 aa  220  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0326182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  40.21 
 
 		 322 aa  220  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  41.1 
 
 		 331 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4432  hypothetical protein  41.47 
 
 		 324 aa  219  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65696  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  39.38 
 
 		 324 aa  219  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3300  hypothetical protein  38.74 
 
 		 323 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205377  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  40.53 
 
 		 337 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  39.93 
 
 		 328 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4563  hypothetical protein  37.13 
 
 		 329 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  37.65 
 
 		 324 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  40 
 
 		 330 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  39.32 
 
 		 321 aa  218  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  38.62 
 
 		 324 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  39.04 
 
 		 337 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  38.85 
 
 		 328 aa  216  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  37.95 
 
 		 325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  40 
 
 		 327 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  38.51 
 
 		 325 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  39.8 
 
 		 343 aa  216  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  39.73 
 
 		 325 aa  216  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  38.49 
 
 		 334 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  42.66 
 
 		 324 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  36.86 
 
 		 346 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1244  hypothetical protein  38.98 
 
 		 330 aa  215  8e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.275742  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  38.14 
 
 		 334 aa  215  9e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  38.91 
 
 		 318 aa  215  9e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  36.74 
 
 		 332 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  40.51 
 
 		 334 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  39.52 
 
 		 339 aa  215  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  39.86 
 
 		 339 aa  215  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  38.75 
 
 		 351 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>