More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0233 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0233  sensory box sensor histidine kinase  100 
 
 		 607 aa  1249    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.373916  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0178  sensor histidine kinase  28.5 
 
 		 596 aa  232  2e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0175  histidine kinase  28.69 
 
 		 597 aa  220  5e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_167  sensor histidine kinase  27.49 
 
 		 589 aa  211  2e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0301  sensory box sensor histidine kinase  40.87 
 
 		 426 aa  196  1e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1354  sensor histidine kinase  40.94 
 
 		 426 aa  189  1e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0123  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.34 
 
 		 433 aa  189  2e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0107  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 		 408 aa  187  6e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1431  sensory box sensor histidine kinase  41.5 
 
 		 392 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  38.98 
 
 		 1070 aa  179  1e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0305  sensory box sensor histidine kinase  41.34 
 
 		 425 aa  178  3e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  38.98 
 
 		 1070 aa  178  3e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1539  sensory box sensor histidine kinase  36.28 
 
 		 392 aa  177  4e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_93  sensor histidine kinase  44.54 
 
 		 759 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1395  sensory box sensor histidine kinase  40.24 
 
 		 534 aa  175  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0171  sensory box sensor histidine kinase  42.69 
 
 		 503 aa  171  4e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0315  sensory box sensor histidine kinase  39.44 
 
 		 534 aa  168  2e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1331  sensor histidine kinase/response regulator  38.52 
 
 		 1118 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1321  sensor histidine kinase  35.77 
 
 		 377 aa  163  9e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1312  sensor histidine kinase  39.48 
 
 		 510 aa  159  1e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.17 
 
 		 780 aa  149  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2206  histidine kinase  33.66 
 
 		 556 aa  146  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 763 aa  144  4e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 		 568 aa  144  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_84  histidine kinase  34.19 
 
 		 1084 aa  144  5e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2814  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.69 
 
 		 763 aa  144  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.155467  normal  0.302046 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3302  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.69 
 
 		 763 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  33.13 
 
 		 1046 aa  141  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0644  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 754 aa  141  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 		 778 aa  139  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 		 386 aa  137  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000238922  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.79 
 
 		 570 aa  137  8e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1645  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 906 aa  136  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.884619  normal  0.02986 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2788  histidine kinase  33.58 
 
 		 576 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.27 
 
 		 602 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0955  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 		 765 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.68 
 
 		 1559 aa  135  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.32 
 
 		 927 aa  135  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4664  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 		 413 aa  134  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03078  sensor histidine kinase  30.8 
 
 		 678 aa  134  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 		 1140 aa  134  3.9999999999999996e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1124  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.33 
 
 		 502 aa  134  5e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.963767  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  35.14 
 
 		 1399 aa  133  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 3470 aa  133  9e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 911 aa  132  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0065  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 377 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.45 
 
 		 1352 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1005  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 646 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.442988  decreased coverage  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2944  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 573 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 631 aa  132  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1221  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 525 aa  131  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0121657 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  32.45 
 
 		 823 aa  131  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1295  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.31 
 
 		 1223 aa  132  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0981526  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  33.99 
 
 		 560 aa  132  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2415  PAS sensor protein  29.61 
 
 		 810 aa  131  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1492  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.06 
 
 		 606 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216645  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.45 
 
 		 760 aa  130  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762207 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1922  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 558 aa  130  6e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 600 aa  130  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0583  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 		 816 aa  130  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.412959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3722  ATP-binding region, ATPase-like protein  32.33 
 
 		 1120 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1168  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 676 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  31.77 
 
 		 508 aa  129  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.45 
 
 		 1058 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.49 
 
 		 1267 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4802  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.51 
 
 		 910 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.150201 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1418  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.34 
 
 		 853 aa  129  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 451 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5235  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.06 
 
 		 757 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3171  adaptive-response sensory kinase  34.63 
 
 		 401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.109214 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.78 
 
 		 1297 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 827 aa  129  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.48 
 
 		 1313 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1997  histidine kinase/response regulator hybrid protein  29.89 
 
 		 558 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.947527  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1949  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 		 623 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 473 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4197  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 679 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0091  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31 
 
 		 930 aa  128  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00954137  normal  0.993222 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0609  histidine kinase  34.85 
 
 		 395 aa  128  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.32 
 
 		 1021 aa  128  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.23 
 
 		 835 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2901  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.51 
 
 		 733 aa  127  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.248575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 979 aa  127  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2390  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.8 
 
 		 618 aa  127  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.868312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0648  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.63 
 
 		 661 aa  127  7e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.84 
 
 		 1407 aa  126  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.07 
 
 		 1274 aa  126  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 896 aa  126  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 		 451 aa  126  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 		 621 aa  126  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 		 458 aa  126  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.48 
 
 		 969 aa  126  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2129  sensory box histidine kinase/response regulator  30.22 
 
 		 746 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.706377  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 590 aa  125  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4928  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.37 
 
 		 889 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.62 
 
 		 1260 aa  125  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 609 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.66 
 
 		 1331 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.07 
 
 		 934 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.49 
 
 		 1406 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>