More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4318 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4318  Transketolase domain protein  100 
 
 
329 aa  645    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3260  Transketolase central region  63.08 
 
 
326 aa  410  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870956  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2486  transketolase domain-containing protein  66.04 
 
 
321 aa  409  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2669  transketolase central region  64.8 
 
 
321 aa  383  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000406172 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3049  transketolase-like protein  45.2 
 
 
330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2364  Transketolase central region  44.44 
 
 
324 aa  251  1e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0672  Transketolase central region  39.38 
 
 
325 aa  243  3.9999999999999997e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  44.04 
 
 
328 aa  241  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3502  Transketolase central region  42.86 
 
 
342 aa  241  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257276  normal  0.0335061 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0344  acetoin:DCPIP oxidoreductase beta subunit  40.9 
 
 
337 aa  238  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1397  Transketolase central region  41.54 
 
 
327 aa  236  3e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2404  transketolase, central region  44.11 
 
 
339 aa  236  4e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2032  transketolase, central region  42.19 
 
 
320 aa  235  7e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1475  transketolase, central region  39.38 
 
 
325 aa  235  9e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0449  transketolase domain-containing protein  43.73 
 
 
325 aa  235  9e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.94075  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2753  transketolase, central region  42.25 
 
 
328 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0936  acetoin catabolism protein AcoB  41.72 
 
 
339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2324  transketolase, central region  42.77 
 
 
330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0120  transketolase central region  39.4 
 
 
341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1025  transketolase, central region  40.54 
 
 
333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0434386  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1028  transketolase, central region  40.54 
 
 
333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3559  transketolase, central region  44.08 
 
 
337 aa  233  3e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00351586  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3770  transketolase, central region  42.6 
 
 
347 aa  233  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2538  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  41.46 
 
 
344 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0840  transketolase, central region  42.46 
 
 
327 aa  232  6e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.272287 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0318  transketolase, central region  41.92 
 
 
336 aa  231  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.726078  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2803  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  41.16 
 
 
344 aa  231  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.475124  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2779  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  41.16 
 
 
344 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0388974 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2504  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  41.16 
 
 
344 aa  231  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2824  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  41.16 
 
 
344 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.464105  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2577  transketolase central region  41.16 
 
 
344 aa  230  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000747615  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2587  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  41.16 
 
 
344 aa  230  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2775  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  41.16 
 
 
344 aa  230  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1056  transketolase domain-containing protein  41.21 
 
 
330 aa  229  7e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.329928  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6875  transketolase central region  42.63 
 
 
330 aa  228  9e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.580767 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2784  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  40.55 
 
 
344 aa  228  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2680  pyruvate dehydrogenase E1 component  39.63 
 
 
326 aa  228  1e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0583  Transketolase central region  43.71 
 
 
344 aa  227  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.968763 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0349  transketolase, central region  44.55 
 
 
330 aa  228  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0164413  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2509  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  40.24 
 
 
344 aa  227  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.398705 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5165  Transketolase central region  37.2 
 
 
326 aa  226  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  41.23 
 
 
324 aa  227  3e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10250  acetoin catabolism protein AcoB  42.6 
 
 
339 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2269  transketolase, central region  44.21 
 
 
336 aa  227  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0554  acetoin dehydrogenase, beta subunit  40.23 
 
 
340 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246222  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1616  Transketolase central region  41.1 
 
 
332 aa  224  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0599  transketolase central region  39.94 
 
 
340 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.315571  normal  0.029192 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2062  Transketolase domain protein  39.76 
 
 
327 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.258257  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1267  transketolase, central region  41.95 
 
 
328 aa  223  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0589  transketolase, central region  42.99 
 
 
331 aa  224  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2770  pyruvate dehydrogenase subunit beta  41.72 
 
 
467 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0593  transketolase, central region  39.94 
 
 
340 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.90523  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41740  acetoin:2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit AcoB  38.94 
 
 
339 aa  222  6e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0225699  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1088  Transketolase central region  40.61 
 
 
338 aa  222  7e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.589015  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18840  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  45.43 
 
 
356 aa  222  7e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6441  Transketolase central region  38.79 
 
 
327 aa  222  9e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.818323 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0651  hypothetical protein  38.15 
 
 
325 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.208884 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13273  dihydrolipoamide acetyltransferase  36.5 
 
 
325 aa  220  1.9999999999999999e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2820  pyruvate dehydrogenase subunit beta  40.94 
 
 
449 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46160  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  43.08 
 
 
323 aa  221  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6913  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1833  Transketolase central region  41.1 
 
 
325 aa  220  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  38.41 
 
 
327 aa  220  3e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  38.41 
 
 
327 aa  220  3e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2811  pyruvate dehydrogenase subunit beta  41.1 
 
 
469 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344502  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3707  Transketolase central region  39.88 
 
 
327 aa  219  5e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2251  Transketolase central region  39.76 
 
 
328 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00217042  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2325  acetoin dehydrogenase, E1 component, beta subunit  38.53 
 
 
346 aa  217  2e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  41.41 
 
 
324 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  41.41 
 
 
324 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3069  pyruvate dehydrogenase, E1 component, pyruvate dehydrogenase beta subunit  41.54 
 
 
326 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.829686  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2675  Transketolase central region  41.54 
 
 
326 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0989  pyruvate dehydrogenase subunit beta  40.37 
 
 
480 aa  216  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.114856  normal  0.908498 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2490  pyruvate dehydrogenase subunit beta  40.37 
 
 
465 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.423706 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3966  transketolase  40.9 
 
 
346 aa  215  7e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1973  Transketolase central region  39.45 
 
 
328 aa  215  8e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4805  Transketolase central region  39.4 
 
 
337 aa  215  8e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1776  transketolase, central region  42.77 
 
 
334 aa  215  9e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174657  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  40.8 
 
 
324 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0667  transketolase, central region  39.94 
 
 
350 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.238984  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21360  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  40.48 
 
 
348 aa  213  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6516  pyruvate dehydrogenase subunit beta  40.98 
 
 
480 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2110  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dehydrogenase (E1) component  37.65 
 
 
326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.140374  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1880  pyruvate dehydrogenase subunit beta  42.36 
 
 
468 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1188  transketolase, central region  42.95 
 
 
322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.489911  normal  0.0419885 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0953  Transketolase central region  39.88 
 
 
325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1418  pyruvate dehydrogenase subunit beta  40.3 
 
 
456 aa  214  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000135962 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3140  pyruvate dehydrogenase subunit beta  39.56 
 
 
467 aa  213  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  41.28 
 
 
324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4635  transketolase central region  36.53 
 
 
332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1035  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  41.38 
 
 
337 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4984  transketolase, central region  41.49 
 
 
335 aa  213  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.670882 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2510  transketolase-like  42.46 
 
 
320 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.703307 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1690  pyruvate dehydrogenase subunit beta  40.18 
 
 
464 aa  213  3.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.872037 
 
 
-
 
NC_004310  BR1128  pyruvate dehydrogenase subunit beta  39.69 
 
 
461 aa  213  4.9999999999999996e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997621  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0535  pyruvate dehydrogenase subunit beta  38.65 
 
 
454 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1506  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.56 
 
 
458 aa  212  5.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.100072  normal  0.335973 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2910  pyruvate dehydrogenase subunit beta  40.91 
 
 
483 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3434  Transketolase domain protein  42.99 
 
 
353 aa  212  7e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0193049  decreased coverage  0.00000789299 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5071  Transketolase central region  42.02 
 
 
325 aa  212  7e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.067721  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4462  pyruvate dehydrogenase subunit beta  39.88 
 
 
459 aa  212  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.150502 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>