More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0927 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0927  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
544 aa  1096    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.887829  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5772  extracellular solute-binding protein  41.68 
 
 
534 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.228919  normal  0.273878 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0164  extracellular solute-binding protein family 5  38.57 
 
 
550 aa  293  6e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  28.83 
 
 
516 aa  172  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  28.83 
 
 
516 aa  171  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  28.69 
 
 
516 aa  170  6e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  28.69 
 
 
516 aa  170  7e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  28.69 
 
 
516 aa  169  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  28.48 
 
 
516 aa  169  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1750  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  28.78 
 
 
516 aa  167  5e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.843018  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1855  twin-arginine translocation pathway signal  28.96 
 
 
540 aa  166  9e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686889  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3741  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 
532 aa  162  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1084  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  29.05 
 
 
539 aa  155  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2713  extracellular solute-binding protein  29.29 
 
 
529 aa  156  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4121  extracellular solute-binding protein  27.99 
 
 
521 aa  154  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3993  extracellular solute-binding protein family 5  28.51 
 
 
531 aa  154  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  27.02 
 
 
515 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 
516 aa  152  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1906  extracellular solute-binding protein  27.24 
 
 
543 aa  151  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0377443  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3528  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 
564 aa  150  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.61993  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1248  extracellular solute-binding protein  26.16 
 
 
537 aa  149  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.710714 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2197  extracellular solute-binding protein family 5  27.09 
 
 
556 aa  148  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0135  extracellular solute-binding protein family 5  27.7 
 
 
531 aa  147  6e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0799  extracellular solute-binding protein  27.01 
 
 
531 aa  145  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162067  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2532  extracellular solute-binding protein family 5  28.09 
 
 
525 aa  145  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3888  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.1 
 
 
550 aa  145  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.799639  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1799  extracellular solute-binding protein family 5  27.27 
 
 
531 aa  145  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0907769  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1494  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 
526 aa  145  2e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.69615 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0602  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 
545 aa  142  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.497567  hitchhiker  0.000000266408 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2056  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 
521 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149494  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  25.69 
 
 
534 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0372  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 
529 aa  139  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.132597  normal  0.149219 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2047  extracellular solute-binding protein  28.31 
 
 
529 aa  138  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.101703  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5088  extracellular solute-binding protein family 5  28.86 
 
 
553 aa  136  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.416607 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2465  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 
529 aa  136  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0038  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 
532 aa  136  9e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.216937  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  26.78 
 
 
510 aa  136  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0422  extracellular solute-binding protein  27.82 
 
 
525 aa  136  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1917  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 
518 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0403  twin-arginine translocation pathway signal  28.38 
 
 
559 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0925  extracellular solute-binding protein family 5  28.27 
 
 
523 aa  134  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.30323 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3088  extracellular solute-binding protein  27.58 
 
 
538 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902972  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 
501 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0407  extracellular solute-binding protein family 5  25.56 
 
 
528 aa  133  1.0000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00229954  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0807  ABC dipeptide transporter, substrate-binding subunit DdpA  24.34 
 
 
538 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123514  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.93 
 
 
540 aa  131  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3829  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 
569 aa  131  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.847313 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  28.24 
 
 
512 aa  131  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1030  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.83 
 
 
534 aa  130  7.000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.180664  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7015  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  29.14 
 
 
528 aa  129  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0208042  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1781  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 
501 aa  129  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000533035  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  25.57 
 
 
509 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3852  extracellular solute-binding protein family 5  25.8 
 
 
547 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2326  extracellular solute-binding protein  25.89 
 
 
546 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.294702  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 
595 aa  129  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4180  extracellular solute-binding protein family 5  25.8 
 
 
547 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336386  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 
501 aa  128  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  25.47 
 
 
535 aa  127  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  24.57 
 
 
520 aa  127  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0872  extracellular solute-binding protein family 5  27.2 
 
 
527 aa  127  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6191  extracellular solute-binding protein family 5  26.75 
 
 
504 aa  126  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172417  normal  0.779113 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  28.33 
 
 
503 aa  126  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 
503 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1240  extracellular solute-binding protein  28 
 
 
530 aa  125  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 
511 aa  125  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58360  putative binding protein component of ABC transpor  25.69 
 
 
532 aa  125  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6371  extracellular solute-binding protein family 5  26.6 
 
 
504 aa  124  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5111  ABC transporter periplasmic binding protein  25.84 
 
 
532 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.914948  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1255  extracellular solute-binding protein family 5  24.71 
 
 
566 aa  122  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3308  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 
528 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5381  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  26.02 
 
 
524 aa  121  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.121189  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4061  extracellular solute-binding protein  27.16 
 
 
529 aa  121  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.707761  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19540  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25 
 
 
567 aa  120  3.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.394832  normal  0.058637 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1612  extracellular solute-binding protein family 5  23.68 
 
 
549 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  25.89 
 
 
525 aa  120  7.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4238  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 
531 aa  120  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301487  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2226  extracellular solute-binding protein family 5  27.91 
 
 
507 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0969064 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1188  extracellular solute-binding protein  25.3 
 
 
499 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000019193  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0142  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  26.31 
 
 
551 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0632409  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4561  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.47 
 
 
531 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2124  hypothetical protein  24.91 
 
 
566 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.415891  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2998  extracellular solute-binding protein family 5  24.86 
 
 
610 aa  119  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.869563  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 
540 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4012  extracellular solute-binding protein  25.89 
 
 
529 aa  118  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0256267  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2073  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 
517 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.610417  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4474  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 
529 aa  117  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0385001  normal  0.989495 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  28.39 
 
 
519 aa  117  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0756  extracellular solute-binding protein family 5  23.51 
 
 
549 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  26.69 
 
 
529 aa  116  8.999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  25.3 
 
 
540 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0882  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  24.9 
 
 
544 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0255  extracellular solute-binding protein  26.84 
 
 
531 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.146115  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.35 
 
 
510 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1442  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.74 
 
 
563 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.663118  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1105  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 
522 aa  115  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0925  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 
536 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4004  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 
535 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1880  extracellular solute-binding protein  31.35 
 
 
536 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.70178  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2455  extracellular solute-binding protein family 5  27.49 
 
 
543 aa  115  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000169374 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  26.57 
 
 
565 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>