271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6846 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6846  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 430 aa  872    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1095  ABC-2 type transporter  36.51 
 
 		 427 aa  296  4e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0131  ABC-2 type transporter  33.88 
 
 		 418 aa  265  1e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0390339  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0386  ABC transporter, permease component  34.26 
 
 		 428 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246762  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5801  ABC-2 type transporter  32.64 
 
 		 425 aa  211  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552117  normal  0.846192 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2372  hypothetical protein  32.51 
 
 		 410 aa  142  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114721  normal  0.587335 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2108  ABC-2 type transporter  27.05 
 
 		 386 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3970  hypothetical protein  28.5 
 
 		 383 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3385  ABC-2 type transporter  26.98 
 
 		 385 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0864007  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3063  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  24.78 
 
 		 431 aa  91.7  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  29.74 
 
 		 413 aa  91.3  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  32.2 
 
 		 380 aa  89.7  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  21.45 
 
 		 380 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  21.51 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1890  ABC-2 type transporter  22.35 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394039  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4114  ABC-2 type transporter  29.8 
 
 		 437 aa  72.4  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  22.25 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  29.61 
 
 		 372 aa  68.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  28.09 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  20.74 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3438  ABC-2 type transporter  23.33 
 
 		 408 aa  67  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0748672 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  23.96 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3634  ABC-2 type transporter  23.31 
 
 		 403 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135402  normal  0.0306752 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00580  ABC-2 type transport system permease protein  26.67 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0449353  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  21.48 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  20.94 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3747  ABC-2 type transporter  23.33 
 
 		 403 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  27.54 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  20.88 
 
 		 369 aa  64.3  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  27.75 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3377  ABC-2 type transporter  21.92 
 
 		 440 aa  63.2  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  20 
 
 		 365 aa  62.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3153  ABC-2 type transporter  21.8 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  26.09 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  27.78 
 
 		 368 aa  60.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  27.78 
 
 		 368 aa  60.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  27.78 
 
 		 368 aa  60.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  27.78 
 
 		 368 aa  60.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  27.78 
 
 		 368 aa  60.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0216  ABC-2 type transporter  22.07 
 
 		 398 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.316621  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  26.26 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1709  ABC-2 type transporter  29.08 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0615816  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  28.27 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  26.84 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  25.61 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  20.76 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  26.9 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3223  ABC-2 type transporter  26.9 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0649112  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  24.6 
 
 		 365 aa  59.7  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  24.86 
 
 		 371 aa  59.3  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  25.97 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  24.16 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2816  putative ABC transporter, permease protein  25.61 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326896 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  27.75 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  24.31 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  20.23 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  24.22 
 
 		 914 aa  57.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29660  ABC-type multidrug transport system, permease component  20.71 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0479  ABC-2 type transporter  26.15 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  27.23 
 
 		 915 aa  57.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0258  ABC transporter permease  22.25 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.716995  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0081  ABC transporter related  28.08 
 
 		 911 aa  57  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2556  putative ABC transporter, permease protein  26.22 
 
 		 339 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0674400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  24.44 
 
 		 378 aa  57  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  21.61 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  28.5 
 
 		 917 aa  56.6  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  20.55 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  26.52 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4303  ABC-2 type transporter  30.94 
 
 		 287 aa  56.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1047  ABC-2 type transporter  22.22 
 
 		 371 aa  55.8  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  27.07 
 
 		 368 aa  56.2  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0750  ABC-2 type transporter  27.12 
 
 		 375 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212958  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  27.07 
 
 		 368 aa  56.2  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22030  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.84 
 
 		 243 aa  56.2  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0900218 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  21.43 
 
 		 384 aa  56.2  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  20.5 
 
 		 376 aa  56.2  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  26.11 
 
 		 381 aa  55.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  26.26 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  27.27 
 
 		 377 aa  55.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 		 367 aa  55.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  21.84 
 
 		 375 aa  55.1  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3163  ABC-2 type transporter  28.06 
 
 		 283 aa  55.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  27.23 
 
 		 260 aa  54.7  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9217  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  21.85 
 
 		 913 aa  55.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.808205  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2544  ABC transporter, permease protein, putative  24.55 
 
 		 339 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0951215  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11702  ABC-2 type transport system permease protein  25.87 
 
 		 226 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.342622 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2365  ABC transporter permease  24.55 
 
 		 339 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2323  ABC transporter, permease  24.55 
 
 		 339 aa  55.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00174786  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  24.58 
 
 		 368 aa  55.1  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  23.05 
 
 		 378 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2542  ABC transporter permease  24.55 
 
 		 339 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4703  ABC-2 type transporter  23.28 
 
 		 383 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  21.36 
 
 		 382 aa  54.7  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  23.89 
 
 		 922 aa  54.7  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 		 369 aa  54.7  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  22.12 
 
 		 370 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  25.56 
 
 		 368 aa  54.3  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  24.44 
 
 		 387 aa  54.3  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  25.56 
 
 		 368 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>