More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4864 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4864  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 599 aa  1230    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0846936  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0660  hypothetical protein  36.08 
 
 		 605 aa  359  9e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.279373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6416  Rhs element Vgr protein  30.11 
 
 		 617 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5894  Rhs element Vgr protein  29.2 
 
 		 615 aa  227  6e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4109  Rhs element Vgr protein  26.32 
 
 		 576 aa  187  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0273732 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3589  Rhs element Vgr protein  27.3 
 
 		 612 aa  182  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.512863 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1796  Rhs element Vgr protein  26.67 
 
 		 619 aa  169  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3220  Rhs element Vgr protein  26.49 
 
 		 618 aa  165  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3260  Rhs element Vgr protein  24.95 
 
 		 602 aa  139  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386521  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3931  Rhs element Vgr protein  25.27 
 
 		 616 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.410968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4015  Rhs element Vgr protein  24.58 
 
 		 602 aa  118  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.211679  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  26.06 
 
 		 593 aa  115  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  25.21 
 
 		 589 aa  109  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0983  hypothetical protein  35.18 
 
 		 218 aa  103  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3609  Rhs element Vgr protein  25.76 
 
 		 574 aa  99.4  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  24.76 
 
 		 592 aa  98.6  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  23.85 
 
 		 589 aa  98.2  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  27.49 
 
 		 641 aa  95.9  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  29.37 
 
 		 606 aa  95.1  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  24.74 
 
 		 589 aa  95.1  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  25.24 
 
 		 587 aa  94  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0769  Rhs element Vgr protein  28.15 
 
 		 248 aa  90.1  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1051  Rhs element Vgr protein  24.88 
 
 		 594 aa  82  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67230  hypothetical protein  23.66 
 
 		 790 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69550  hypothetical protein  24.11 
 
 		 680 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256731  normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0669  Rhs element Vgr protein  23.27 
 
 		 576 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  23.39 
 
 		 610 aa  79.7  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5384  Rhs element Vgr protein  23.21 
 
 		 602 aa  78.2  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43080  hypothetical protein  24.11 
 
 		 680 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000176027  normal  0.282542 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0696  putative VgrG protein  22.73 
 
 		 741 aa  77  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0764  type VI secretion system Vgr family protein  22.92 
 
 		 741 aa  76.6  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2631  Rhs element Vgr protein  23.14 
 
 		 684 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1042  phosphoserine phosphatase SerB  26.61 
 
 		 565 aa  75.9  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5250  Rhs element Vgr protein  28.14 
 
 		 596 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012293 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2462  hypothetical protein  27.27 
 
 		 595 aa  75.1  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21450  hypothetical protein  23.14 
 
 		 688 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  23.8 
 
 		 794 aa  74.7  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4488  Rhs element Vgr protein  22.93 
 
 		 702 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2892  hypothetical protein  23.61 
 
 		 499 aa  74.3  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18985  hypothetical protein  23.17 
 
 		 808 aa  74.3  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261066  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3003  Rhs element Vgr protein  26.14 
 
 		 598 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  23.06 
 
 		 668 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3666  Rhs element Vgr protein  31.54 
 
 		 226 aa  73.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408922  decreased coverage  0.0000749166 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0820  Rhs element Vgr protein  25.48 
 
 		 694 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.476122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3684  Rhs element Vgr protein  27.96 
 
 		 247 aa  72  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.149401  hitchhiker  0.000521794 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3849  Rhs element Vgr protein  23.12 
 
 		 675 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  23.49 
 
 		 668 aa  71.6  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0587  type VI secretion system Vgr family protein  22.53 
 
 		 633 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2094  Rhs element Vgr protein  26.02 
 
 		 646 aa  70.9  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.730907  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2945  Rhs element Vgr protein  25.58 
 
 		 589 aa  70.9  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703955  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3822  Rhs element Vgr protein  22.08 
 
 		 578 aa  70.5  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2538  Rhs element Vgr protein  23.15 
 
 		 680 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4385  Rhs element Vgr protein  22.36 
 
 		 763 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  25 
 
 		 933 aa  69.7  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  22.8 
 
 		 741 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3077  type VI secretion system Vgr family protein  22.35 
 
 		 633 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1509  Rhs element Vgr protein  29.28 
 
 		 239 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0616  type VI secretion system Vgr family protein  22.35 
 
 		 633 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0499415  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  23.12 
 
 		 668 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0153  Rhs element Vgr protein  21.34 
 
 		 689 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  21.83 
 
 		 735 aa  68.6  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  22.67 
 
 		 907 aa  68.2  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0649  type VI secretion system Vgr family protein  21.93 
 
 		 633 aa  67.8  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1638  type VI secretion system Vgr family protein  22.97 
 
 		 702 aa  67.4  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.674786  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2064  type VI secretion system Vgr family protein  22.6 
 
 		 702 aa  67.4  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.201838  normal  0.0713545 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1538  two component LuxR family transcriptional regulator  22.44 
 
 		 621 aa  67  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0676  Rhs element Vgr protein  23.49 
 
 		 596 aa  66.6  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1953  Rhs element Vgr protein  32.2 
 
 		 275 aa  67  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0339  putative VgrG protein  21.81 
 
 		 732 aa  65.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0251  type VI secretion system Vgr family protein  22.6 
 
 		 713 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830075 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0328  Rhs element Vgr protein  22.39 
 
 		 740 aa  65.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  22.75 
 
 		 975 aa  65.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  24.16 
 
 		 669 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1080  hypothetical protein  27.16 
 
 		 599 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.752206 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  21.67 
 
 		 618 aa  66.2  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  22.91 
 
 		 901 aa  65.1  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  24.32 
 
 		 754 aa  65.1  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0107  Rhs element Vgr protein  22.2 
 
 		 693 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5415  Rhs element Vgr protein  22.85 
 
 		 678 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2044  Rhs element Vgr protein  23.08 
 
 		 680 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.909849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0245  type VI secretion system Vgr family protein  22.36 
 
 		 713 aa  65.1  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0401  type VI secretion system Vgr family protein  21.62 
 
 		 740 aa  65.1  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0243  type VI secretion system Vgr family protein  22.36 
 
 		 713 aa  65.1  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26590  hypothetical protein  22.38 
 
 		 599 aa  64.7  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0848935  normal  0.672502 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3927  Rhs element Vgr protein  23.98 
 
 		 604 aa  64.7  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00332693  hitchhiker  0.00450013 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1162  type VI secretion system Vgr family protein  22.04 
 
 		 617 aa  64.3  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.754803  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  21.57 
 
 		 1057 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  24.29 
 
 		 796 aa  63.9  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  21.18 
 
 		 692 aa  63.9  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2202  type VI secretion system Vgr family protein  22.49 
 
 		 702 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0264417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  22.04 
 
 		 709 aa  63.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  23.14 
 
 		 1048 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2758  vgrG protein  24.23 
 
 		 774 aa  63.5  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  22.79 
 
 		 755 aa  63.2  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5436  Rhs element Vgr protein  23.09 
 
 		 680 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1194  Rhs element Vgr protein  25.73 
 
 		 655 aa  62.8  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5574  Rhs element Vgr protein  20.83 
 
 		 741 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5985  type VI secretion system Vgr family protein  20.45 
 
 		 641 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1183  Rhs element Vgr protein  25.73 
 
 		 694 aa  62.8  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1564  hypothetical protein  22.44 
 
 		 504 aa  62.4  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21515 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>