289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3927 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3927  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 604 aa  1226    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00332693  hitchhiker  0.00450013 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0369  Rhs element Vgr protein  40.56 
 
 		 596 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3003  Rhs element Vgr protein  41.41 
 
 		 598 aa  451  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0676  Rhs element Vgr protein  37.81 
 
 		 596 aa  441  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2462  hypothetical protein  40.68 
 
 		 595 aa  433  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  36.57 
 
 		 589 aa  396  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  36.9 
 
 		 589 aa  395  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5250  Rhs element Vgr protein  36.66 
 
 		 596 aa  389  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012293 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3155  Rhs element Vgr protein  36.86 
 
 		 581 aa  387  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0669  Rhs element Vgr protein  34.18 
 
 		 576 aa  351  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3609  Rhs element Vgr protein  33.22 
 
 		 574 aa  338  9.999999999999999e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1042  phosphoserine phosphatase SerB  32.87 
 
 		 565 aa  318  1e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1080  hypothetical protein  35.05 
 
 		 599 aa  306  6e-82  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.752206 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0896  Rhs element Vgr protein  28.04 
 
 		 545 aa  184  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.79786 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1040  Rhs element Vgr protein  28.04 
 
 		 545 aa  184  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.605907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  26.08 
 
 		 593 aa  139  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  26.69 
 
 		 589 aa  139  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  25.04 
 
 		 641 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1051  Rhs element Vgr protein  27.02 
 
 		 594 aa  134  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  24.11 
 
 		 610 aa  124  6e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  24.02 
 
 		 592 aa  120  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5384  Rhs element Vgr protein  25.48 
 
 		 602 aa  109  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3822  Rhs element Vgr protein  24.02 
 
 		 578 aa  106  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  25 
 
 		 587 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26590  hypothetical protein  25.09 
 
 		 599 aa  100  8e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0848935  normal  0.672502 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  26.57 
 
 		 606 aa  94.7  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3043  Rhs element Vgr protein  31.55 
 
 		 229 aa  91.7  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160638 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0983  hypothetical protein  32.24 
 
 		 218 aa  90.9  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2945  Rhs element Vgr protein  23.19 
 
 		 589 aa  84.7  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703955  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1509  Rhs element Vgr protein  33.67 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0660  hypothetical protein  33.18 
 
 		 605 aa  80.1  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.279373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3260  Rhs element Vgr protein  32.97 
 
 		 602 aa  79  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386521  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0769  Rhs element Vgr protein  26.27 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2892  hypothetical protein  21.36 
 
 		 499 aa  74.7  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000029  hypothetical protein  28.4 
 
 		 611 aa  74.7  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3589  Rhs element Vgr protein  27.62 
 
 		 612 aa  70.9  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.512863 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1564  hypothetical protein  21.61 
 
 		 504 aa  67.8  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21515 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3684  Rhs element Vgr protein  27.62 
 
 		 247 aa  65.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.149401  hitchhiker  0.000521794 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2094  Rhs element Vgr protein  26.67 
 
 		 646 aa  65.1  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.730907  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4864  Rhs element Vgr protein  23.98 
 
 		 599 aa  64.7  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0846936  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4390  Rhs element Vgr protein  21.81 
 
 		 652 aa  64.7  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.86257  normal  0.698434 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00256  Rhs-family protein  24.8 
 
 		 645 aa  64.3  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3666  Rhs element Vgr protein  27.33 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408922  decreased coverage  0.0000749166 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5894  Rhs element Vgr protein  28.71 
 
 		 615 aa  64.3  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  25.16 
 
 		 841 aa  64.3  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2014  type VI secretion system Vgr family protein  31.11 
 
 		 753 aa  63.9  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758033  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  28.15 
 
 		 735 aa  63.9  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3931  Rhs element Vgr protein  28.02 
 
 		 616 aa  63.9  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.410968  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  25.5 
 
 		 841 aa  63.2  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  25.5 
 
 		 841 aa  63.2  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  25.83 
 
 		 683 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4187  Rhs element Vgr protein  29.34 
 
 		 769 aa  62.8  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6416  Rhs element Vgr protein  25.72 
 
 		 617 aa  60.8  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1358  VgrG preotein, VgrG-2  26.01 
 
 		 754 aa  60.1  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  24.85 
 
 		 838 aa  59.7  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  27.12 
 
 		 757 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  33.62 
 
 		 712 aa  58.5  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  27.43 
 
 		 618 aa  58.5  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1508  phage protein D  21.36 
 
 		 348 aa  58.9  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  39.66 
 
 		 774 aa  58.5  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  24.88 
 
 		 683 aa  58.5  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  39.66 
 
 		 907 aa  58.2  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  39.66 
 
 		 748 aa  58.5  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  34.38 
 
 		 734 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  34.38 
 
 		 731 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  34.38 
 
 		 734 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  34.38 
 
 		 734 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  34.38 
 
 		 734 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  34.38 
 
 		 734 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  34.38 
 
 		 734 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  40.38 
 
 		 785 aa  58.2  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3429  Rhs element Vgr protein  25.62 
 
 		 782 aa  57.8  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  34.38 
 
 		 731 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1796  Rhs element Vgr protein  22.2 
 
 		 619 aa  57.4  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1749  hypothetical protein  21.74 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.698415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3665  Rhs element Vgr protein  27.15 
 
 		 245 aa  57  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  hitchhiker  0.000248141 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4015  Rhs element Vgr protein  28.49 
 
 		 602 aa  57  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.211679  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1726  Rhs element Vgr protein  19.14 
 
 		 642 aa  56.6  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  44.23 
 
 		 734 aa  56.6  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4109  Rhs element Vgr protein  27.37 
 
 		 576 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0273732 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01965  hypothetical protein  25.57 
 
 		 771 aa  57  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2555  hypothetical protein  23.96 
 
 		 273 aa  56.6  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000216389 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  36.11 
 
 		 616 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0043  Rhs element Vgr protein  32.98 
 
 		 320 aa  56.6  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0650  Rhs element Vgr protein  32.98 
 
 		 727 aa  56.6  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0732792  normal  0.0253872 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0838  Rhs element Vgr protein  31.91 
 
 		 697 aa  56.6  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  36.21 
 
 		 756 aa  56.6  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3177  Rhs family protein  28.66 
 
 		 697 aa  56.2  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  40.38 
 
 		 730 aa  55.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  23.67 
 
 		 754 aa  56.2  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  44.23 
 
 		 734 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2959  hypothetical protein  25.21 
 
 		 644 aa  56.2  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027443 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5985  type VI secretion system Vgr family protein  20.55 
 
 		 641 aa  56.2  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  38.46 
 
 		 788 aa  55.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  35.82 
 
 		 1057 aa  55.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  38.33 
 
 		 1048 aa  55.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  40.35 
 
 		 792 aa  55.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  36.21 
 
 		 572 aa  55.5  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  38.46 
 
 		 755 aa  55.5  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  31.86 
 
 		 614 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>