More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3653 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3653  NLP/P60 protein  100 
 
 		 232 aa  475  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013969  normal  0.207873 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4179  NLP/P60 protein  37.11 
 
 		 168 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0481386  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0721  NLP/P60 family protein  37.59 
 
 		 202 aa  91.3  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.638789 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2100  NLP/P60 protein  36 
 
 		 302 aa  88.2  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  42.37 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2523  NLP/P60 protein  33.78 
 
 		 189 aa  85.1  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000113171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  40.52 
 
 		 150 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  34.11 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  35.9 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1768  NLP/P60 protein  31.46 
 
 		 325 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  36 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 452 aa  82  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1158  NLP/P60 protein  30.77 
 
 		 181 aa  81.3  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  35.34 
 
 		 332 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  41.18 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  37.19 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  41.41 
 
 		 366 aa  79.7  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  36.67 
 
 		 391 aa  79.3  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  34.97 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  35.67 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  37.23 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  38.06 
 
 		 424 aa  78.6  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  31.33 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  35.9 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0057  lipoprotein  41.8 
 
 		 174 aa  77.4  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438446  hitchhiker  0.00939156 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  36.03 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  33.08 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1954  NLP/P60 protein  31.39 
 
 		 384 aa  76.6  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1426  NLP/P60 protein  32.58 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  36.28 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  34.19 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1742  NlpC/P60 family protein  36.84 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000022854  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  34.85 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1528  NlpC/P60 family protein  36.84 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  39.23 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1542  NlpC/P60 family protein  36.84 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0237599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1911  NlpC/P60 family protein  36.84 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.569551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1602  NlpC/P60 family protein  36.84 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  33.9 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  39.42 
 
 		 340 aa  75.5  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0041  NLP/P60  33.91 
 
 		 331 aa  75.5  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.430296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2584  NLP/P60 protein  37.98 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.416294  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  32.82 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  33.96 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  37.5 
 
 		 205 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  30.77 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  32.46 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  36.03 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  39.05 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  35.29 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  35.29 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  31.72 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  35.29 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3275  NLP/P60 protein  34.96 
 
 		 181 aa  74.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459641  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  30.6 
 
 		 335 aa  73.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  38.66 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  39.05 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  39.05 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  34.59 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  35.29 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  35.29 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  39.05 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7290  NLP/P60 protein  33.96 
 
 		 329 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0724969  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  39.05 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  39.05 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  39.05 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  39.05 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  35.43 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  39.55 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0670  NLP/P60 protein  32.81 
 
 		 207 aa  72  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.160252 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2819  NLP/P60 protein  31.34 
 
 		 159 aa  72  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  35.43 
 
 		 271 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  35.43 
 
 		 271 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  35.43 
 
 		 271 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  33.59 
 
 		 208 aa  72  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  35.43 
 
 		 271 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  35.43 
 
 		 271 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  35.43 
 
 		 271 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  36.67 
 
 		 363 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  35.43 
 
 		 271 aa  72  0.000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  35.43 
 
 		 271 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  34.45 
 
 		 303 aa  71.6  0.000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  35.54 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2420  NLP/P60 protein  33.58 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0740  NLP/P60 family protein  30.08 
 
 		 189 aa  71.2  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  32.84 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0751  NLP/P60 protein  36.17 
 
 		 173 aa  71.6  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  35.29 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  33.09 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  35.54 
 
 		 208 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  35.11 
 
 		 458 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  32.57 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  35.54 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04820  hypothetical protein  36.75 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  40.78 
 
 		 373 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0045  NlpC/P60 family domain protein  35.38 
 
 		 174 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000018046  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  33.61 
 
 		 438 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  34.78 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1792  NLP/P60 protein  35.43 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.851858  normal  0.0301658 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>