43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3404 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3404  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 441 aa  927    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.316905  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0858  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 		 445 aa  444  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4708  O-Glycosyl hydrolase family 30  47.28 
 
 		 447 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.319201  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04190  glycoside hydrolase family 30  46.41 
 
 		 445 aa  374  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0097  Glucosylceramidase  42.44 
 
 		 446 aa  344  2e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1287  glucosylceramidase  39.52 
 
 		 476 aa  343  5e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6735  glycoside hydrolase family 30  41.12 
 
 		 485 aa  329  6e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.39769 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1563  glycoside hydrolase family protein  39.23 
 
 		 487 aa  313  3.9999999999999997e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.361336  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1562  glycoside hydrolase family protein  42.13 
 
 		 487 aa  309  5.9999999999999995e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1268  glucosylceramidase  36.12 
 
 		 475 aa  302  9e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0296  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  33.99 
 
 		 484 aa  218  2e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  30.65 
 
 		 648 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3714  glycosy hydrolase family protein  27.77 
 
 		 567 aa  203  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.171767  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0445  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  31.69 
 
 		 501 aa  201  1.9999999999999998e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5601  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  31.29 
 
 		 505 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2067  glycoside hydrolase family protein  30.16 
 
 		 480 aa  193  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0826948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3590  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  30.71 
 
 		 486 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00155681  hitchhiker  0.000521994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3714  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  28.31 
 
 		 666 aa  172  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00391353 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1566  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  29.11 
 
 		 474 aa  172  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2261  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  28.76 
 
 		 514 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103038  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6736  glycoside hydrolase family 30  27.88 
 
 		 485 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.338177 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4153  glucosylceramidase  30.41 
 
 		 472 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450582  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54536  predicted protein  29.19 
 
 		 859 aa  164  2.0000000000000002e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6250  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  28.61 
 
 		 627 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2994  glucosylceramidase  28.5 
 
 		 481 aa  159  7e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389806  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1106  glycoside hydrolase family protein  28.95 
 
 		 488 aa  159  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0729101  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  30.71 
 
 		 647 aa  157  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1516  glycoside hydrolase family 30  28.33 
 
 		 481 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1833  O-glycosyl hydrolase  29.02 
 
 		 445 aa  154  4e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3362  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  28.41 
 
 		 497 aa  154  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4356  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  27.27 
 
 		 603 aa  153  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.641869  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  26.36 
 
 		 634 aa  153  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34530  O-glycosyl hydrolase  28.64 
 
 		 447 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0928159  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5017  glycoside hydrolase family 30  27.17 
 
 		 484 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000784671  normal  0.283576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  31.49 
 
 		 603 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  29.23 
 
 		 695 aa  150  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  26.56 
 
 		 982 aa  110  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  30.1 
 
 		 532 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  22.86 
 
 		 726 aa  66.6  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2134  Glucuronoarabinoxylan endo-1,4-beta-xylanase  22.26 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.300272  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  23.23 
 
 		 688 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04558  xylanase  20.1 
 
 		 406 aa  56.2  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.992142  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1486  glycoside hydrolase family 30  24.36 
 
 		 544 aa  50.8  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.291924 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>