More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2358 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2358  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 367 aa  751    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0216034  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0786  3-dehydroquinate synthase  42.15 
 
 		 360 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0410044  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  42.04 
 
 		 364 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  44.27 
 
 		 368 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  42.04 
 
 		 364 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1854  3-dehydroquinate synthase  41.4 
 
 		 359 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0869188  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  44.44 
 
 		 370 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  40.31 
 
 		 358 aa  265  1e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20809  3-dehydroquinate synthase  39.3 
 
 		 431 aa  263  3e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  42.25 
 
 		 363 aa  260  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  38.29 
 
 		 363 aa  260  3e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  44.55 
 
 		 368 aa  259  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  41.23 
 
 		 361 aa  259  5.0000000000000005e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  41.33 
 
 		 361 aa  258  1e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  43.21 
 
 		 358 aa  258  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  42.49 
 
 		 361 aa  258  1e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  40.18 
 
 		 368 aa  258  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  42.72 
 
 		 359 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  42.72 
 
 		 359 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  42.72 
 
 		 359 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  42.72 
 
 		 359 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  42.72 
 
 		 359 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  42.72 
 
 		 359 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  42.72 
 
 		 359 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  42.99 
 
 		 359 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  43.53 
 
 		 359 aa  256  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  42.59 
 
 		 359 aa  256  6e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  40.4 
 
 		 376 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  40.4 
 
 		 365 aa  255  8e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0721  3-dehydroquinate synthase  40.95 
 
 		 369 aa  255  9e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.879879  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  40.4 
 
 		 365 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  42.22 
 
 		 361 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  40.11 
 
 		 365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  39.88 
 
 		 368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  42.41 
 
 		 361 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  39.76 
 
 		 362 aa  253  3e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  40.9 
 
 		 369 aa  253  3e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  38.16 
 
 		 359 aa  253  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  37.88 
 
 		 359 aa  253  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  42.41 
 
 		 361 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  40.49 
 
 		 368 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  39.42 
 
 		 358 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  38.2 
 
 		 359 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  40.81 
 
 		 359 aa  252  6e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  39.17 
 
 		 359 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  40.64 
 
 		 367 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  42.27 
 
 		 359 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  42.27 
 
 		 359 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  41.96 
 
 		 359 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  37.6 
 
 		 359 aa  251  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0691  3-dehydroquinate synthase  40.75 
 
 		 370 aa  251  2e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  38.42 
 
 		 360 aa  251  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  38.31 
 
 		 355 aa  251  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  41.32 
 
 		 359 aa  251  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  39.13 
 
 		 358 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  41.9 
 
 		 359 aa  249  4e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  39.13 
 
 		 358 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  42.77 
 
 		 364 aa  249  6e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 359 aa  249  7e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  39.94 
 
 		 361 aa  249  7e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  38.84 
 
 		 358 aa  248  9e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2257  3-dehydroquinate synthase  42.9 
 
 		 354 aa  248  1e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  37.33 
 
 		 359 aa  248  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  38.53 
 
 		 366 aa  248  1e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0296  3-dehydroquinate synthase  44.9 
 
 		 359 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1202  3-dehydroquinate synthase  37.77 
 
 		 366 aa  248  2e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  42.31 
 
 		 366 aa  247  3e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1432  3-dehydroquinate synthase  36.08 
 
 		 373 aa  247  3e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.68619  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0610  3-dehydroquinate synthase  40.46 
 
 		 370 aa  247  3e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  40.84 
 
 		 388 aa  246  6e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1283  3-dehydroquinate synthase  38.87 
 
 		 367 aa  246  6e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.637861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  39.76 
 
 		 358 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1717  3-dehydroquinate synthase  37.43 
 
 		 372 aa  245  8e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  40.12 
 
 		 362 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  40.23 
 
 		 370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38791  predicted protein  37.93 
 
 		 368 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0409062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  41.35 
 
 		 374 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  42.53 
 
 		 372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2564  3-dehydroquinate synthase  38.24 
 
 		 380 aa  243  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.443147 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  39.61 
 
 		 363 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  38.58 
 
 		 366 aa  243  3.9999999999999997e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1218  3-dehydroquinate synthase  40.06 
 
 		 370 aa  243  6e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000176451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0262  3-dehydroquinate synthase  39.76 
 
 		 357 aa  242  7e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00142699  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  37.83 
 
 		 358 aa  242  7e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  39.53 
 
 		 362 aa  242  7e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  41.41 
 
 		 354 aa  241  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  40.58 
 
 		 366 aa  240  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  40.71 
 
 		 356 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  38.6 
 
 		 366 aa  240  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0690  3-dehydroquinate synthase  39.94 
 
 		 355 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  39.94 
 
 		 363 aa  240  4e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  39.54 
 
 		 366 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4051  3-dehydroquinate synthase  37.25 
 
 		 381 aa  239  5.999999999999999e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  39.54 
 
 		 366 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  39 
 
 		 358 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0409  3-dehydroquinate synthase  39.83 
 
 		 367 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  39.02 
 
 		 366 aa  238  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  41.16 
 
 		 368 aa  238  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  39.29 
 
 		 363 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0411  3-dehydroquinate synthase  40.4 
 
 		 366 aa  238  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0359503  normal  0.217295 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>