48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1711 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1711  endopygalactorunase-like protein  100 
 
 		 620 aa  1279    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0172  coagulation factor 5/8 type domain protein  23.4 
 
 		 685 aa  79.7  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.238557  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3310  hypothetical protein  22.81 
 
 		 518 aa  74.7  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3713  hypothetical protein  25.45 
 
 		 581 aa  72  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4088  glycoside hydrolase family protein  28.02 
 
 		 522 aa  67  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.59776  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0230  glycoside hydrolase family protein  24.61 
 
 		 462 aa  65.5  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4790  glycoside hydrolase family 28  27 
 
 		 541 aa  62.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0680897  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  25.76 
 
 		 865 aa  62.4  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3217  glycoside hydrolase family protein  24.48 
 
 		 491 aa  62  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2818  glycoside hydrolase family 28  27.2 
 
 		 542 aa  59.7  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1579  glycoside hydrolase family 28  21.67 
 
 		 492 aa  59.3  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0814382 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3114  glycoside hydrolase family protein  30.23 
 
 		 479 aa  57.4  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1569  glycoside hydrolase family 28  26.67 
 
 		 443 aa  57  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4285  glycoside hydrolase family protein  31.4 
 
 		 543 aa  55.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2380  Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  26.92 
 
 		 447 aa  55.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0953  glycoside hydrolase family protein  29.57 
 
 		 463 aa  55.5  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.161663  hitchhiker  0.000000205432 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2391  glycoside hydrolase family 28  29.41 
 
 		 470 aa  55.1  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880928  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1581  glycoside hydrolase family 28  24.63 
 
 		 489 aa  54.3  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0871574 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5079  Parallel beta-helix repeat protein  21.32 
 
 		 454 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416725  normal  0.142328 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0824  glycoside hydrolase family 28  22.22 
 
 		 444 aa  53.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2888  glycoside hydrolase family 28  25.25 
 
 		 530 aa  52.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.022046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4247  glycoside hydrolase family protein  22.98 
 
 		 448 aa  52.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783037  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5759  polygalacturonase  21.12 
 
 		 416 aa  51.2  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2300  glycoside hydrolase family 28  28.23 
 
 		 455 aa  51.2  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6953  glycoside hydrolase family 28  24.81 
 
 		 390 aa  50.8  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2125  glycoside hydrolase family 28  25.27 
 
 		 437 aa  50.8  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0498  glycoside hydrolase family protein  22.13 
 
 		 446 aa  50.1  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.446578  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3115  glycoside hydrolase family protein  24.74 
 
 		 509 aa  50.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3371  glycoside hydrolase family 28  22.88 
 
 		 444 aa  49.3  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2736  glycoside hydrolase family protein  23.08 
 
 		 518 aa  49.3  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.835022  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0483  glycoside hydrolase family protein  22.13 
 
 		 446 aa  49.7  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1253  glycoside hydrolase family 28  23.05 
 
 		 544 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80507  normal  0.501453 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2532  glycoside hydrolase family 28  25.14 
 
 		 459 aa  48.9  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2457  glycoside hydrolase family 28  24.29 
 
 		 508 aa  48.5  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140372  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4858  glycoside hydrolase family 28  22.68 
 
 		 671 aa  48.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0653045  normal  0.492882 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4256  glycoside hydrolase family protein  24.3 
 
 		 475 aa  48.1  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0610  glycoside hydrolase family 28  26.62 
 
 		 528 aa  48.1  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1158  glycoside hydrolase family 28  22.9 
 
 		 554 aa  47.8  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5359  putative polygalacturonase protein  19.8 
 
 		 454 aa  47.8  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071082  normal  0.281824 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5903  glycoside hydrolase family 28  24.4 
 
 		 521 aa  47.4  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.672596 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1710  glycoside hydrolase family 28  22.39 
 
 		 518 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190203  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4784  glycoside hydrolase family 28  20.8 
 
 		 551 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.821545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4115  glycoside hydrolase family protein  22.66 
 
 		 560 aa  45.4  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3630  glycoside hydrolase family 28  27.35 
 
 		 513 aa  45.8  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29200  endopolygalacturonase  22.7 
 
 		 431 aa  45.1  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1410  Fibronectin type III domain protein  34.21 
 
 		 659 aa  44.7  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2862  Fibronectin type III domain protein  34.21 
 
 		 659 aa  44.7  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0972  glycoside hydrolase family 28  20.81 
 
 		 448 aa  44.3  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>