More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1729 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1729  aminotransferase  100 
 
 		 385 aa  797    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118879  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0798  aspartate aminotransferase  75.32 
 
 		 387 aa  614  1e-175  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1558  aminotransferase class I and II  69.87 
 
 		 386 aa  566  1e-160  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0317788  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1353  aspartate aminotransferase  71.69 
 
 		 385 aa  556  1e-157  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1502  aminotransferase class I and II  68.31 
 
 		 388 aa  552  1e-156  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000290558  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2793  aminotransferase  53.14 
 
 		 386 aa  431  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0434  aminotransferase class I and II  44.68 
 
 		 393 aa  305  7e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  42.71 
 
 		 379 aa  292  8e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  41.07 
 
 		 387 aa  286  5.999999999999999e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2793  aminotransferase  40.58 
 
 		 390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  42.86 
 
 		 397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0168  aminotransferase, class I and II  40.62 
 
 		 400 aa  283  5.000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0910  aminotransferase class I and II  42.64 
 
 		 421 aa  276  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.111037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  41.35 
 
 		 394 aa  266  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3813  aminotransferase  40.89 
 
 		 405 aa  265  1e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.512222 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  39.68 
 
 		 382 aa  264  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1235  aminotransferase class I and II  39.37 
 
 		 393 aa  264  2e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  40.15 
 
 		 387 aa  261  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  39.34 
 
 		 388 aa  256  4e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  38.02 
 
 		 397 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  36.61 
 
 		 383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  42.05 
 
 		 387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  38.5 
 
 		 397 aa  254  3e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3242  aminotransferase class I and II  39.62 
 
 		 392 aa  253  4.0000000000000004e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363576 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  37.47 
 
 		 385 aa  251  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  38.04 
 
 		 386 aa  250  3e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  38.73 
 
 		 389 aa  249  6e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  39.73 
 
 		 395 aa  249  8e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  38.52 
 
 		 393 aa  248  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  40.91 
 
 		 413 aa  248  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  38.1 
 
 		 409 aa  246  6e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0857  hypothetical protein  36.04 
 
 		 383 aa  245  9e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0998197 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  36.71 
 
 		 384 aa  243  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  37.56 
 
 		 395 aa  243  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  40.11 
 
 		 401 aa  242  7.999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0627  aminotransferase class I and II  39.02 
 
 		 369 aa  241  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5952  aminotransferase  38.75 
 
 		 387 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1783  aminotransferase class I and II  39.64 
 
 		 390 aa  241  1e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  37.21 
 
 		 391 aa  241  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2104  hypothetical protein  35.71 
 
 		 384 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  35.44 
 
 		 387 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40190  putative aminotransferase  38.04 
 
 		 382 aa  241  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2507  succinyldiaminopimelate aminotransferase  37.89 
 
 		 402 aa  240  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0380247  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2224  hypothetical protein  35.44 
 
 		 385 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1240  hypothetical protein  37.36 
 
 		 383 aa  240  4e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4596  putative aminotransferase  38.36 
 
 		 382 aa  239  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13700  succinyldiaminopimelate aminotransferase  38.54 
 
 		 413 aa  239  5.999999999999999e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.189376 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2740  hypothetical protein  36.97 
 
 		 394 aa  237  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4725  hypothetical protein  33.51 
 
 		 388 aa  237  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2081  hypothetical protein  35.16 
 
 		 384 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2517  hypothetical protein  36.51 
 
 		 394 aa  236  4e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935034 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2084  hypothetical protein  37.4 
 
 		 394 aa  236  6e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1088  putative aminotransferase  37.81 
 
 		 390 aa  235  9e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214876  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0776  hypothetical protein  37.33 
 
 		 391 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.623469  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3361  hypothetical protein  34.99 
 
 		 384 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  decreased coverage  0.00419079 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  39.78 
 
 		 397 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1253  putative aminotransferase  36.44 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1440  aminotransferase, classes I and II  36.16 
 
 		 382 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  37.9 
 
 		 400 aa  233  3e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0442  putative aminotransferase  37.81 
 
 		 391 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1328  putative aminotransferase  37.81 
 
 		 391 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1465  putative aminotransferase  37.81 
 
 		 384 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0402989  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0710  putative aminotransferase  37.81 
 
 		 391 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1319  putative aminotransferase  37.81 
 
 		 391 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1159  putative aminotransferase  37.81 
 
 		 391 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00196774  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4557  hypothetical protein  35.29 
 
 		 398 aa  232  9e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2445  hypothetical protein  35.66 
 
 		 394 aa  232  9e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1801  putative aminotransferase  37.53 
 
 		 384 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  37.17 
 
 		 389 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  38.98 
 
 		 397 aa  231  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  37.8 
 
 		 389 aa  230  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  36.96 
 
 		 395 aa  230  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4321  hypothetical protein  35.01 
 
 		 409 aa  229  5e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1500  hypothetical protein  35.62 
 
 		 384 aa  229  7e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0858  putative aminotransferase  35.07 
 
 		 382 aa  229  9e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0888  putative aminotransferase  35.07 
 
 		 382 aa  229  9e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.533677 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5553  putative aminotransferase  36.16 
 
 		 390 aa  229  9e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.182232 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4320  putative aminotransferase  35.07 
 
 		 382 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000717764 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3334  putative aminotransferase  36.16 
 
 		 385 aa  228  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.946068  hitchhiker  0.000376908 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  36.68 
 
 		 387 aa  228  2e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0778  aminotransferase class I and II  33.42 
 
 		 380 aa  227  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  37.57 
 
 		 391 aa  227  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0976  putative aminotransferase  36.16 
 
 		 389 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3495  putative aminotransferase  35.29 
 
 		 382 aa  226  7e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3793  hypothetical protein  36.09 
 
 		 391 aa  226  7e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0901  putative aminotransferase  34.52 
 
 		 382 aa  225  8e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002174 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2249  putative aminotransferase  36.16 
 
 		 390 aa  226  8e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1613  putative aminotransferase  36.16 
 
 		 390 aa  225  9e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2225  putative aminotransferase  36.16 
 
 		 390 aa  225  9e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1450  putative aminotransferase  34.19 
 
 		 391 aa  224  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3534  putative aminotransferase  36.07 
 
 		 388 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.605783  normal  0.0143572 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2142  putative aminotransferase  36.44 
 
 		 390 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1012  putative aminotransferase  35.62 
 
 		 390 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2263  putative aminotransferase  36.44 
 
 		 390 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0852  aminotransferase class I and II  33.89 
 
 		 384 aa  223  4e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1052  putative aminotransferase  35.89 
 
 		 390 aa  223  6e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00744709  normal  0.582641 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4497  aminotransferase  37.7 
 
 		 389 aa  223  6e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4584  aminotransferase  37.7 
 
 		 389 aa  223  6e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.344557 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2011  putative aminotransferase  35.89 
 
 		 399 aa  222  7e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.482994  normal  0.0887187 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5070  aminotransferase  36.53 
 
 		 391 aa  223  7e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.807516  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>