More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1118 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1118  DNA repair and recombination protein RadA  100 
 
 		 358 aa  732    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1953  DNA repair and recombination protein RadA  71.75 
 
 		 330 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2081  DNA repair and recombination protein RadA  68.94 
 
 		 332 aa  492  9.999999999999999e-139  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0713  DNA repair and recombination protein RadA  68.63 
 
 		 330 aa  491  9.999999999999999e-139  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2310  DNA repair and recombination protein RadA  68.27 
 
 		 333 aa  481  1e-135  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.469487  hitchhiker  0.00856648 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1017  DNA repair and recombination protein RadA  67.86 
 
 		 358 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  53.87 
 
 		 324 aa  344  1e-93  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1386  DNA repair and recombination protein RadA  51.59 
 
 		 388 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  51.45 
 
 		 324 aa  320  3e-86  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  50.47 
 
 		 325 aa  317  2e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1226  DNA repair and recombination protein RadA  50.48 
 
 		 324 aa  314  9.999999999999999e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2099  DNA repair and recombination protein RadA  47.96 
 
 		 325 aa  309  4e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0040  DNA repair and recombination protein RadA  49.38 
 
 		 327 aa  305  7e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2033  DNA repair and recombination protein RadA  47.65 
 
 		 325 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.507845  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0637  DNA repair and recombination protein RadA  48.92 
 
 		 329 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  46.75 
 
 		 407 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0885  DNA repair and recombination protein RadA  51.4 
 
 		 322 aa  301  1e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1185  DNA repair and recombination protein RadA  42.69 
 
 		 349 aa  288  1e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0982  DNA repair and recombination protein RadA  45.31 
 
 		 322 aa  278  9e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1918  DNA repair and recombination protein RadA  47.34 
 
 		 324 aa  278  1e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1831  DNA repair and recombination protein RadA  43.7 
 
 		 343 aa  277  2e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1273  DNA repair and recombination protein RadA  42.03 
 
 		 348 aa  276  3e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0368  DNA repair and recombination protein RadA  46.52 
 
 		 322 aa  275  8e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01237  UvsC protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78579]  42.6 
 
 		 348 aa  272  6e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.523208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0211  DNA repair and recombination protein RadA  42.52 
 
 		 343 aa  271  9e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0469  DNA repair and recombination protein RadA  45.6 
 
 		 322 aa  271  1e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1450  DNA repair and recombination protein RadA  45.28 
 
 		 322 aa  271  2e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0942903  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0537  DNA repair and recombination protein RadA  45.57 
 
 		 322 aa  269  5e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2624  DNA repair and recombination protein RadA  40.53 
 
 		 343 aa  262  6.999999999999999e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.387482 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54533  Rad51 DNA recombination/repair protein  41.46 
 
 		 350 aa  258  1e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.724719  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09092  meiotic recombination protein (Dmc1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02200)  43.31 
 
 		 658 aa  246  3e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.515485  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01780  meiotic recombination-related protein, putative  42.53 
 
 		 323 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33041  predicted protein  41.8 
 
 		 343 aa  241  1e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0526282 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06990  recombinase, putative  41.85 
 
 		 365 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108784  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17346  predicted protein  39.64 
 
 		 358 aa  229  6e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908819  normal  0.780808 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1023  Rad51-like  40.85 
 
 		 315 aa  224  2e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.973197  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0743  Rad51-like  45.69 
 
 		 250 aa  189  5e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1633  Rad51 domain-containing protein  33.98 
 
 		 307 aa  149  5e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.11008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2031  Rad51-like protein  35.69 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000738645 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1396  Fis family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 312 aa  146  6e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358472  normal  0.485282 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0486  Rad51-like protein  34.19 
 
 		 311 aa  145  8.000000000000001e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.100378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0762  Fis family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0530008 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17626  predicted protein  29.43 
 
 		 358 aa  121  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0870528  hitchhiker  0.00372316 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1039  DNA repair and recombination protein RadB  34.96 
 
 		 243 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2123  DNA repair and recombination protein RadB  34.5 
 
 		 225 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50387  predicted protein  28.66 
 
 		 351 aa  103  5e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142215  normal  0.0213314 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0926  DNA repair and recombination protein RadB  32.34 
 
 		 221 aa  102  8e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0491  DNA repair and recombination protein RadB  33.05 
 
 		 227 aa  100  4e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54137  Rad51 DNA recombination/repair protein  29.12 
 
 		 363 aa  99.8  8e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1786  DNA repair and recombination protein RadB  31.97 
 
 		 235 aa  95.5  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.729381  normal  0.0464986 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1272  hypothetical protein  33.47 
 
 		 224 aa  94  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.998309 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0907  DNA repair and recombination protein RadB  30.9 
 
 		 227 aa  93.6  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2159  DNA repair and recombination protein RadB  32.48 
 
 		 224 aa  93.2  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0260  DNA repair and recombination protein RadB  30.6 
 
 		 224 aa  87.4  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.92433 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0988  DNA repair and recombination protein RadB  33.92 
 
 		 216 aa  86.7  6e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0377224  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1640  DNA repair and recombination protein RadB  33.04 
 
 		 215 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.301627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2453  ATPase  29.82 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0274  DNA repair and recombination protein RadB  32.6 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.944285  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2429  DNA repair and recombination protein RadB  31.9 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2158  DNA repair and recombination protein RadB  28.22 
 
 		 235 aa  81.6  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1629  DNA repair and recombination protein RadB  32.22 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.554742  normal  0.462396 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10145  DNA repair protein (Rad57), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12520)  34.76 
 
 		 554 aa  77.4  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.263483 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1490  DNA repair and recombination protein RadB  33.16 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0087  RecA/RadA recombinase-like protein  33.93 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.439691 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0077  DNA repair and recombination protein RadB  27.02 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58642  predicted protein  31.33 
 
 		 541 aa  69.3  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00988886  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0886  recA protein  27.19 
 
 		 356 aa  65.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02320  RAD57 protein, putative  30.13 
 
 		 598 aa  65.1  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1255  hypothetical protein  30.73 
 
 		 344 aa  65.5  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000979449  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  28.3 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  28.11 
 
 		 363 aa  62  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0530  recA protein  25.94 
 
 		 327 aa  62  0.00000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0466  recombinase A  28.17 
 
 		 353 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0986  recA protein  30.99 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000028976  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2681  recombinase A  29.58 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1162  recA protein  28.23 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.501327  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2573  recombinase A  29.58 
 
 		 359 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2041  recombinase A  29.58 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.461458  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  29.19 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2699  recombinase A  29.58 
 
 		 359 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2652  recombinase A  29.58 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5979  recombinase A  29.58 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  29.09 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0527  recombinase A  29.11 
 
 		 353 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000554316  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0005  recA protein  31.28 
 
 		 355 aa  60.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0310986  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5034  recA protein  27.86 
 
 		 364 aa  60.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0440  recombinase A  28.71 
 
 		 358 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0497  recombinase A  26.79 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00187604 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0017  recombinase A  27.75 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0272  recombinase A  27.75 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0814  recombinase A  27.75 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0971  recombinase A  27.75 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0643  recombinase A  27.19 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.940587  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3948  recA protein  25.93 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2672  recombinase A  27.75 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.996925  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0810  recombinase A  27.75 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  28.85 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2404  recombinase A  27.75 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4152  recombinase A  25.82 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  27.4 
 
 		 361 aa  59.7  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>