More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2026 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2026  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 111 aa  231  2.0000000000000002e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0461  ArsR family transcriptional regulator  76.47 
 
 		 111 aa  167  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000195997  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0425  ArsR family transcriptional regulator  75.25 
 
 		 127 aa  165  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1476  transcriptional regulator, ArsR family  70 
 
 		 111 aa  160  7e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.381385  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1706  ArsR family transcriptional regulator  69.37 
 
 		 111 aa  159  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1115  transcriptional regulator, ArsR family  64.36 
 
 		 113 aa  150  4e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0901427 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0509  transcriptional regulator, ArsR family  67.33 
 
 		 113 aa  149  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  54.95 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3936  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 		 109 aa  97.1  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 116 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  46.74 
 
 		 116 aa  94  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1932  transcriptional regulator, ArsR family  47.13 
 
 		 109 aa  90.9  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.182432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0907  transcriptional regulator, ArsR family  41.58 
 
 		 109 aa  90.9  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.246186 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3644  regulatory protein ArsR  46.74 
 
 		 146 aa  90.9  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45994  normal  0.88589 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6111  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 		 110 aa  88.2  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2833  transcriptional regulator, ArsR family  47.25 
 
 		 97 aa  88.6  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.779996 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0850  transcriptional regulator, ArsR family  40.59 
 
 		 109 aa  88.2  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6304  transcriptional regulator, ArsR family  46.07 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1513  ArsR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 108 aa  85.1  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313082  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0377  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 		 89 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00475  transcriptional regulator, ArsR family protein  39 
 
 		 109 aa  80.1  0.000000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.727712  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3149  regulatory protein ArsR  35 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0540  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 117 aa  76.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  39.53 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2551  transcriptional regulator, ArsR family  49.35 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0974  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0630999  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2987  regulatory protein, ArsR  37.36 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4239  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4418  regulatory protein, ArsR  36.36 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3079  regulatory protein, ArsR  36.36 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06338  hypothetical protein  39.13 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0554  regulatory protein ArsR  38.2 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001410  putative regulatory protein ArsR family  42.5 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0925  regulatory protein, ArsR  33.68 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0708087  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02390  regulatory protein ArsR  36.78 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0946  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02523  predicted DNA-binding transcriptional regulator  38.36 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1016  transcriptional regulator, ArsR family  38.36 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3909  transcriptional regulator, ArsR family  38.36 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.305368 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2947  ArsR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2802  ArsR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02487  hypothetical protein  38.36 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1039  ArsR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2787  ArsR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.255483 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3214  transcriptional regulator, ArsR family  36.99 
 
 		 99 aa  53.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3099  regulatory protein ArsR  33.72 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.22781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2977  regulatory protein ArsR  33.72 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.623995  normal  0.100497 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2664  regulatory protein, ArsR  34.88 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.530465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2994  regulatory protein ArsR  33.72 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.566931  normal  0.0250812 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2910  regulatory protein, ArsR  33.72 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  33.72 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3346  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.388028  hitchhiker  0.00866337 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  42.62 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 115 aa  51.6  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2732  ArsR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 100 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2942  regulatory protein ArsR  32.56 
 
 		 99 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.130788 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  40.24 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 93 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  43.66 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1661  transcriptional regulator  39.51 
 
 		 127 aa  50.8  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.88743e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1969  ArsR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 123 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4671  ArsR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 		 118 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  40.58 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  42.19 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  32.56 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  35.37 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  34.48 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2432  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00680056  normal  0.462104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.18 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  34.78 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0162  transcriptional regulator, ArsR family  32.35 
 
 		 326 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  35.8 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  42.42 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  41.54 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  31.07 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1091  arsenical resistance operon repressor  37.35 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000544872  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2171  ArsR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0439276  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1906  regulatory protein ArsR  33.8 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.186553  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 121 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 119 aa  47.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3421  regulatory protein, ArsR  35.56 
 
 		 105 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.993799  normal  0.836004 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0989  transcriptional regulator, ArsR family  35.44 
 
 		 105 aa  47.4  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0674458  normal  0.0533659 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 125 aa  47.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0027  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.669383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4223  regulatory protein, ArsR  35.62 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0018  transcriptional regulator, ArsR family protein  33.33 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.591177  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  39.44 
 
 		 107 aa  47  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  37.88 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>