More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1254 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1254  amidohydrolase  100 
 
 		 404 aa  826    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226068  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1330  amidohydrolase  76.43 
 
 		 407 aa  631  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1361  amidohydrolase  75.68 
 
 		 405 aa  624  1e-178  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  68.24 
 
 		 407 aa  561  1.0000000000000001e-159  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0903  peptidase M20D, amidohydrolase  65.82 
 
 		 409 aa  543  1e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  61.04 
 
 		 410 aa  505  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  58.65 
 
 		 408 aa  473  1e-132  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  42.89 
 
 		 395 aa  343  2e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  45.25 
 
 		 400 aa  339  5e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  42.89 
 
 		 391 aa  338  9.999999999999999e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  42.86 
 
 		 401 aa  328  9e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3841  amidohydrolase  41.84 
 
 		 397 aa  324  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4957  amidohydrolase  42.16 
 
 		 395 aa  321  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657786 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  42.49 
 
 		 400 aa  320  3e-86  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  40.92 
 
 		 390 aa  318  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5569  amidohydrolase  43.54 
 
 		 401 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  42.93 
 
 		 392 aa  291  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  42.04 
 
 		 402 aa  290  3e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  41.62 
 
 		 399 aa  286  4e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  42.42 
 
 		 391 aa  285  8e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  41.67 
 
 		 389 aa  285  9e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  37.92 
 
 		 390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  43.95 
 
 		 390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  41.47 
 
 		 389 aa  280  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  40.2 
 
 		 466 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  37.6 
 
 		 394 aa  277  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  40.78 
 
 		 403 aa  276  4e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  41.45 
 
 		 394 aa  276  4e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2432  amidohydrolase  40.4 
 
 		 430 aa  276  4e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4257  amidohydrolase  39.95 
 
 		 465 aa  276  6e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  41.42 
 
 		 389 aa  275  8e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  40.73 
 
 		 425 aa  275  8e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  40.05 
 
 		 389 aa  275  9e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  40.94 
 
 		 387 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  41.84 
 
 		 395 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  39.85 
 
 		 465 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  42.89 
 
 		 390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  42.32 
 
 		 387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  41.25 
 
 		 387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  38.96 
 
 		 465 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  42.32 
 
 		 387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  39.95 
 
 		 390 aa  273  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  40.91 
 
 		 396 aa  273  3e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0206  amidohydrolase  40.36 
 
 		 471 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.196253  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  39.36 
 
 		 435 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4131  amidohydrolase  39.7 
 
 		 471 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  42.32 
 
 		 387 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  38.66 
 
 		 402 aa  273  5.000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  40.1 
 
 		 390 aa  273  5.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  37.22 
 
 		 394 aa  273  6e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  39.95 
 
 		 387 aa  272  9e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  41.21 
 
 		 387 aa  272  9e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  40.21 
 
 		 387 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  35.37 
 
 		 405 aa  270  2.9999999999999997e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  41.84 
 
 		 396 aa  269  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  40.36 
 
 		 387 aa  269  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  41.13 
 
 		 399 aa  270  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  39.85 
 
 		 439 aa  269  7e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3941  carboxypeptidase  39.85 
 
 		 470 aa  269  7e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5133  amidohydrolase  41.41 
 
 		 407 aa  269  8e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.519765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  40.79 
 
 		 390 aa  269  8e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  40.36 
 
 		 387 aa  269  8e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  40.47 
 
 		 424 aa  268  8.999999999999999e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  36.96 
 
 		 391 aa  268  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  37.44 
 
 		 437 aa  268  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0017  amidohydrolase  39.14 
 
 		 394 aa  268  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.85 
 
 		 438 aa  267  2.9999999999999995e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5679  amidohydrolase  39.07 
 
 		 408 aa  267  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1494  hippurate hydrolase  43.68 
 
 		 395 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0051  peptidase M20D, amidohydrolase  39.95 
 
 		 407 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  41.55 
 
 		 379 aa  266  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  40.36 
 
 		 387 aa  266  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0378  amidohydrolase family protein  43.68 
 
 		 395 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1288  amidohydrolase  40.67 
 
 		 388 aa  266  4e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0866095  normal  0.389955 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0794  hippurate hydrolase  43.68 
 
 		 395 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1988  amidohydrolase  37.08 
 
 		 399 aa  266  4e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000688604  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2111  hippurate hydrolase  43.68 
 
 		 395 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.216397  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0476  amidohydrolase family protein  43.68 
 
 		 395 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.504077  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  39.74 
 
 		 393 aa  265  7e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  40.21 
 
 		 388 aa  265  7e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  40.94 
 
 		 388 aa  266  7e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  41.33 
 
 		 396 aa  265  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  41.33 
 
 		 396 aa  265  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  41.33 
 
 		 396 aa  265  8e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  41.33 
 
 		 396 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  41.33 
 
 		 396 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  41.33 
 
 		 396 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  41.33 
 
 		 396 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  39.32 
 
 		 397 aa  265  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  41.69 
 
 		 396 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2708  amidohydrolase  34.75 
 
 		 415 aa  265  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0749  peptidase M20D, amidohydrolase  37.56 
 
 		 427 aa  265  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0878973  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1225  amidohydrolase family protein  37.76 
 
 		 398 aa  265  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0413476  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0665  amidohydrolase  39.43 
 
 		 408 aa  264  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  40.05 
 
 		 403 aa  265  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  41.33 
 
 		 396 aa  264  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  40.32 
 
 		 398 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0935  amidohydrolase  38.64 
 
 		 415 aa  264  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0687  amidohydrolase  39.43 
 
 		 408 aa  264  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422759  normal  0.057643 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  34.18 
 
 		 393 aa  263  3e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>