More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_08690 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_08690  short chain acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 550 aa  1142    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0212832  normal  0.531653 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1853  short chain acyl-CoA synthetase  54.81 
 
 		 543 aa  610  1e-173  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09310  short chain acyl-CoA synthetase  52.66 
 
 		 549 aa  575  1.0000000000000001e-163  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280056  normal  0.513679 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1399  short chain acyl-CoA synthetase  41.79 
 
 		 555 aa  431  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1930  short chain acyl-CoA synthetase  40.93 
 
 		 548 aa  422  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0789974 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1822  short chain acyl-CoA synthetase  40.93 
 
 		 546 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1446  short chain acyl-CoA synthetase  40.93 
 
 		 546 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.191096 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1994  short chain acyl-CoA synthetase  40.93 
 
 		 546 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.059614 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1462  short chain acyl-CoA synthetase  40.93 
 
 		 546 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1941  AMP-dependent synthetase and ligase  40.74 
 
 		 548 aa  420  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.889751  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1480  short chain acyl-CoA synthetase  40.74 
 
 		 546 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.712128  normal  0.130818 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1918  short chain acyl-CoA synthetase  40.93 
 
 		 548 aa  421  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01670  hypothetical protein  40.56 
 
 		 566 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1494  short chain acyl-CoA synthetase  40.93 
 
 		 546 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.433242 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1904  short chain acyl-CoA synthetase  40.19 
 
 		 548 aa  415  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.850786  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01659  hypothetical protein  40.56 
 
 		 566 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2126  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  35.74 
 
 		 547 aa  310  2.9999999999999997e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.191102  decreased coverage  0.00946818 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1188  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  35.06 
 
 		 547 aa  303  7.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5256  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  34.31 
 
 		 549 aa  301  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.242586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0718  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  33.27 
 
 		 547 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3918  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  34.2 
 
 		 549 aa  297  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4107  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  34.69 
 
 		 550 aa  296  5e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1544  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  32.53 
 
 		 547 aa  296  9e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1766  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  34.51 
 
 		 546 aa  295  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.810333  normal  0.381602 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1035  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  32.77 
 
 		 547 aa  293  7e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1192  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.26 
 
 		 1004 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0238022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0914  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  31.4 
 
 		 552 aa  266  8.999999999999999e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.963611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  34.29 
 
 		 541 aa  266  8.999999999999999e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3211  AMP-dependent synthetase and ligase  31.78 
 
 		 534 aa  258  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.155051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2400  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 534 aa  258  3e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0669706  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0876  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  30.96 
 
 		 543 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4296  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  31.33 
 
 		 539 aa  250  5e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  30.22 
 
 		 518 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4966  AMP-dependent synthetase and ligase  32.05 
 
 		 503 aa  233  5e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436432  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  30.48 
 
 		 552 aa  231  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  30.06 
 
 		 553 aa  231  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  27.72 
 
 		 552 aa  231  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3489  AMP-dependent synthetase and ligase  29.15 
 
 		 540 aa  230  6e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  31.02 
 
 		 630 aa  229  7e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  31.01 
 
 		 513 aa  229  8e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.28 
 
 		 503 aa  229  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  31.95 
 
 		 520 aa  227  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4313  AMP-dependent synthetase and ligase  32.89 
 
 		 531 aa  225  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6445  AMP-dependent synthetase and ligase  30.15 
 
 		 542 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.607182  hitchhiker  3.41608e-16 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  31.46 
 
 		 500 aa  223  7e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.62299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4410  AMP-dependent synthetase and ligase  31.46 
 
 		 500 aa  223  7e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5134  AMP-binding domain protein  29.56 
 
 		 518 aa  222  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0657606  normal  0.735688 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  30.43 
 
 		 544 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  31.65 
 
 		 521 aa  222  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4791  AMP-dependent synthetase and ligase  31.26 
 
 		 500 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  31.55 
 
 		 541 aa  219  8.999999999999998e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33 
 
 		 514 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  31.12 
 
 		 498 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599535  normal  0.650207 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3937  AMP-binding domain protein  30.14 
 
 		 539 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104158  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  30.93 
 
 		 509 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  30.06 
 
 		 538 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  29.56 
 
 		 549 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  28.65 
 
 		 570 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  28.65 
 
 		 549 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  28.36 
 
 		 552 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1693  AMP-binding domain protein  28.86 
 
 		 543 aa  213  7.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.301435  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  28.78 
 
 		 547 aa  213  1e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2319  AMP-binding domain protein  30.44 
 
 		 565 aa  213  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.770298  normal  0.0254377 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  30.93 
 
 		 512 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  29.21 
 
 		 575 aa  212  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  28.1 
 
 		 575 aa  211  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  30.54 
 
 		 544 aa  211  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  30.35 
 
 		 525 aa  210  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.24 
 
 		 512 aa  210  6e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1241  acyl-CoA synthetase  30.89 
 
 		 572 aa  210  6e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  29.72 
 
 		 505 aa  210  6e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  27.9 
 
 		 550 aa  210  7e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  28.47 
 
 		 549 aa  209  8e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  29.3 
 
 		 576 aa  209  9e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  29.1 
 
 		 566 aa  209  9e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  29.11 
 
 		 576 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  29.98 
 
 		 550 aa  209  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  29.96 
 
 		 549 aa  209  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  29.11 
 
 		 576 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  29.11 
 
 		 576 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  29.11 
 
 		 576 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  29.11 
 
 		 576 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  28.68 
 
 		 552 aa  208  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  28.94 
 
 		 576 aa  208  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  29.11 
 
 		 570 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  30.42 
 
 		 578 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  28.54 
 
 		 554 aa  208  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  29.98 
 
 		 564 aa  207  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0470  AMP-binding domain protein  28.84 
 
 		 579 aa  207  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.500012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  29.82 
 
 		 538 aa  206  6e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0108  AMP-binding domain protein  28.2 
 
 		 575 aa  206  9e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480818  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0462  AMP-binding domain protein  30.53 
 
 		 564 aa  206  9e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4355  AMP-binding domain protein  29.49 
 
 		 577 aa  206  9e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  28.06 
 
 		 540 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  27.91 
 
 		 575 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  30.92 
 
 		 508 aa  206  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3833  AMP-binding domain protein  29.85 
 
 		 601 aa  206  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4161  AMP-binding domain protein  29.53 
 
 		 577 aa  206  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  29.57 
 
 		 587 aa  206  1e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  28.11 
 
 		 558 aa  205  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0518356  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>