More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3449 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3449  Transketolase domain protein  100 
 
 		 346 aa  711    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3807  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) beta chain  47.65 
 
 		 350 aa  301  9e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4445  Transketolase central region  45.77 
 
 		 350 aa  299  4e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0349  transketolase, central region  45.77 
 
 		 330 aa  292  5e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0164413  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0936  acetoin catabolism protein AcoB  46.63 
 
 		 339 aa  288  8e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  47.28 
 
 		 328 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2364  Transketolase central region  44.3 
 
 		 324 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1025  transketolase, central region  45.09 
 
 		 333 aa  282  5.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0434386  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1028  transketolase, central region  45.09 
 
 		 333 aa  282  5.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2753  transketolase, central region  44.86 
 
 		 328 aa  281  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0554  acetoin dehydrogenase, beta subunit  46.01 
 
 		 340 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0593  transketolase, central region  46.01 
 
 		 340 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.90523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10250  acetoin catabolism protein AcoB  46.93 
 
 		 339 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0599  transketolase central region  46.01 
 
 		 340 aa  279  4e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.315571  normal  0.029192 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0706  pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit  44.09 
 
 		 353 aa  278  7e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1475  transketolase, central region  42.19 
 
 		 325 aa  278  7e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21360  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  42.64 
 
 		 348 aa  278  8e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0810  putative pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, beta subunit  44.09 
 
 		 353 aa  278  9e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1776  transketolase, central region  44.95 
 
 		 334 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174657  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0583  Transketolase central region  45.15 
 
 		 344 aa  275  7e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.968763 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2803  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  43.71 
 
 		 344 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.475124  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2504  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  43.71 
 
 		 344 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3502  Transketolase central region  45.45 
 
 		 342 aa  275  1.0000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257276  normal  0.0335061 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2824  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  43.71 
 
 		 344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.464105  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2779  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  43.71 
 
 		 344 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0388974 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3759  transketolase central region  46.93 
 
 		 334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556594  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2538  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  43.71 
 
 		 344 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0449  transketolase domain-containing protein  46.27 
 
 		 325 aa  274  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.94075  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2587  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  43.41 
 
 		 344 aa  273  3e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2775  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  43.41 
 
 		 344 aa  273  3e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2325  acetoin dehydrogenase, E1 component, beta subunit  43.11 
 
 		 346 aa  273  4.0000000000000004e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2509  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  43.41 
 
 		 344 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.398705 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2784  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  43.41 
 
 		 344 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2577  transketolase central region  43.41 
 
 		 344 aa  272  7e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000747615  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1267  transketolase, central region  46.11 
 
 		 328 aa  271  9e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41740  acetoin:2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit AcoB  43.87 
 
 		 339 aa  271  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0225699  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  43.52 
 
 		 327 aa  271  1e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2032  transketolase, central region  44.34 
 
 		 320 aa  271  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4116  transketolase central region  45.68 
 
 		 332 aa  271  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  43.52 
 
 		 327 aa  271  1e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1029  Transketolase central region  44.3 
 
 		 324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005679 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3770  transketolase, central region  42.11 
 
 		 347 aa  269  4e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354561  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4540  transketolase central region  46.33 
 
 		 327 aa  269  5e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1750  transketolase central region  42.56 
 
 		 348 aa  269  5e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1616  Transketolase central region  42.72 
 
 		 332 aa  269  5.9999999999999995e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3966  transketolase  43.24 
 
 		 346 aa  268  8e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1039  transketolase, central region  44.55 
 
 		 324 aa  268  8e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0489701  normal  0.0714055 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0672  Transketolase central region  40.62 
 
 		 325 aa  268  1e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0120  transketolase central region  43.03 
 
 		 341 aa  268  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0314  acetoin dehydrogenase, beta subunit  44.44 
 
 		 334 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2062  Transketolase domain protein  43.81 
 
 		 327 aa  267  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.258257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  40 
 
 		 324 aa  267  2e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0912  transketolase, central region  41.27 
 
 		 341 aa  267  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2251  Transketolase central region  41.61 
 
 		 328 aa  267  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00217042  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5078  transketolase, central region  44.62 
 
 		 327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1973  Transketolase central region  41.3 
 
 		 328 aa  266  4e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5919  Transketolase central region  43.54 
 
 		 334 aa  266  5e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1518  Transketolase central region  42.17 
 
 		 339 aa  266  5e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5551  transketolase, central region:transketolase, C-terminal  43.28 
 
 		 338 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.198983  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1491  transketolase  43.71 
 
 		 327 aa  264  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5139  acetoin/2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit  44.65 
 
 		 334 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0912103  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0318  transketolase, central region  42.99 
 
 		 336 aa  263  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.726078  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4984  transketolase, central region  44.48 
 
 		 335 aa  263  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.670882 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1088  Transketolase central region  43.56 
 
 		 338 aa  263  3e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.589015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3707  Transketolase central region  44.48 
 
 		 327 aa  263  3e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5126  Transketolase central region  46.58 
 
 		 327 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13273  dihydrolipoamide acetyltransferase  38.82 
 
 		 325 aa  263  4e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0667  transketolase, central region  40.9 
 
 		 350 aa  262  6.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.238984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2883  Transketolase central region  45.89 
 
 		 327 aa  261  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3213  Transketolase central region  45.89 
 
 		 327 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09511  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  44.48 
 
 		 329 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.789221  normal  0.154301 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1035  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  44.34 
 
 		 337 aa  261  1e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1188  transketolase, central region  47.24 
 
 		 322 aa  261  1e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.489911  normal  0.0419885 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1435  transketolase central region  44.34 
 
 		 334 aa  260  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464869 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3038  transketolase central region  42.19 
 
 		 325 aa  261  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4178  Transketolase central region  40.87 
 
 		 328 aa  260  3e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008867 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1749  transketolase central region  44.65 
 
 		 334 aa  259  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374866  normal  0.0546828 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2811  Transketolase central region  44.9 
 
 		 326 aa  259  4e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0143  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dehydrogenase (E1) component  45.89 
 
 		 326 aa  259  5.0000000000000005e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1862  transketolase central region  44.48 
 
 		 334 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0703587  hitchhiker  0.00590609 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2229  transketolase, central region  44.62 
 
 		 335 aa  259  7e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0589  transketolase, central region  43.81 
 
 		 331 aa  258  8e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6241  transketolase, central region  44.48 
 
 		 334 aa  258  9e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1838  transketolase, central region  44.48 
 
 		 334 aa  258  9e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267827  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0281  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  45.97 
 
 		 329 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.177643  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0953  Transketolase central region  42.63 
 
 		 325 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1280  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  43.67 
 
 		 327 aa  257  2e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0419  Transketolase central region  40.18 
 
 		 791 aa  257  2e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0246116  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1833  Transketolase central region  41.85 
 
 		 325 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3730  Transketolase central region  44.79 
 
 		 340 aa  257  3e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.98943 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07151  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  43.53 
 
 		 327 aa  256  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.132194 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2680  pyruvate dehydrogenase E1 component  39.75 
 
 		 326 aa  256  3e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2304  Transketolase central region  39.44 
 
 		 327 aa  256  4e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16211  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  45.89 
 
 		 327 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.220601 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6441  Transketolase central region  40.99 
 
 		 327 aa  256  5e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.818323 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2324  transketolase, central region  40.94 
 
 		 330 aa  256  5e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0266  Transketolase central region  39.44 
 
 		 327 aa  255  7e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0879  acetoin dehydrogenase, thymine PPi dependent, E1 component, beta subunit  42.5 
 
 		 332 aa  255  8e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0456  Transketolase central region  42.81 
 
 		 326 aa  255  8e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3051  TPP-dependent acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  39.69 
 
 		 338 aa  254  1.0000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0710212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>