56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1512 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1512  hypothetical protein  100 
 
 		 1203 aa  2473    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1865  hypothetical protein  28.89 
 
 		 1080 aa  425  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3608  hypothetical protein  28.53 
 
 		 1008 aa  395  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.607062  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0987  hypothetical protein  25.6 
 
 		 1119 aa  370  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.365158  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0766  hypothetical protein  25.31 
 
 		 1101 aa  321  3.9999999999999996e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26610  conserved hypothetical protein, phage tail-like region  28.18 
 
 		 649 aa  193  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.894944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1049  hypothetical protein  29.87 
 
 		 653 aa  185  5.0000000000000004e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4392  hypothetical protein  28.51 
 
 		 656 aa  174  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.642574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2814  hypothetical protein  28.87 
 
 		 676 aa  170  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5381  hypothetical protein  27.81 
 
 		 644 aa  169  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1417  hypothetical protein  30.48 
 
 		 650 aa  167  9e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.677247  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1950  hypothetical protein  30.33 
 
 		 651 aa  166  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.134895  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1666  hypothetical protein  28.4 
 
 		 676 aa  164  9e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2269  Baseplate J family protein  27.49 
 
 		 647 aa  162  3e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260983  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1136  hypothetical protein  28.83 
 
 		 737 aa  160  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0988  hypothetical protein  30.4 
 
 		 677 aa  157  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0765  hypothetical protein  27.16 
 
 		 649 aa  155  5e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.877447  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1909  hypothetical protein  26.57 
 
 		 647 aa  155  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.026445  hitchhiker  0.00137339 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1864  hypothetical protein  28.92 
 
 		 692 aa  152  5e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2948  hypothetical protein  26.83 
 
 		 650 aa  146  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0923  hypothetical protein  28.21 
 
 		 652 aa  141  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.566647  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1725  hypothetical protein  26.47 
 
 		 785 aa  134  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000310844 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3825  hypothetical protein  32.62 
 
 		 706 aa  134  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.150333  normal  0.0425607 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4352  hypothetical protein  28.49 
 
 		 796 aa  129  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0800102  normal  0.244923 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3046  hypothetical protein  24.86 
 
 		 760 aa  114  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000814337 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2889  hypothetical protein  24.71 
 
 		 854 aa  108  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1872  hypothetical protein  24.93 
 
 		 730 aa  107  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.214082  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0849  hypothetical protein  24.7 
 
 		 957 aa  104  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1489  hypothetical protein  28.89 
 
 		 833 aa  92  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.499572 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1811  kelch repeat-containing protein  26.45 
 
 		 1744 aa  85.1  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524443  normal  0.65479 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1141  hypothetical protein  29.35 
 
 		 1088 aa  82  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0947  hypothetical protein  26.21 
 
 		 469 aa  81.6  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.024118  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1874  hypothetical protein  26.21 
 
 		 469 aa  80.1  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0205022  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3832  hypothetical protein  25.89 
 
 		 469 aa  79.7  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0819  hypothetical protein  24.42 
 
 		 1030 aa  79  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.984927  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0666  hypothetical protein  24.36 
 
 		 503 aa  74.7  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0820  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1168 aa  74.3  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1745  hypothetical protein  23.88 
 
 		 986 aa  72.8  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0343775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0366  hypothetical protein  28.17 
 
 		 1289 aa  72  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.801022  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0856  hypothetical protein  28.74 
 
 		 503 aa  70.1  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1490  hypothetical protein  23.46 
 
 		 833 aa  68.9  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2553  hypothetical protein  26.92 
 
 		 1236 aa  68.9  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1678  hypothetical protein  26.84 
 
 		 1235 aa  68.2  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1567  hypothetical protein  25.71 
 
 		 843 aa  68.2  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3158  hypothetical protein  26.94 
 
 		 1124 aa  64.3  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.278506  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1513  hypothetical protein  24.02 
 
 		 289 aa  63.5  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0557  hypothetical protein  25 
 
 		 1258 aa  62.8  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000239434 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0850  hypothetical protein  34.29 
 
 		 1183 aa  60.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1045  hypothetical protein  23.5 
 
 		 1022 aa  57.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.771071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3000  hypothetical protein  22.05 
 
 		 1413 aa  57.4  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1814  hypothetical protein  31.25 
 
 		 814 aa  55.8  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5247  hypothetical protein  21.88 
 
 		 1332 aa  54.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167515 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3606  50S ribosomal protein L13E  23.92 
 
 		 1007 aa  52  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.975656  hitchhiker  0.0000178294 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2552  hypothetical protein  26.91 
 
 		 939 aa  50.8  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108717 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3930  hypothetical protein  22.52 
 
 		 1246 aa  48.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.172533  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0201  hypothetical protein  29.06 
 
 		 305 aa  47  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>