273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1406 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1406  basic membrane lipoprotein  100 
 
 		 386 aa  791    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000211605  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2177  basic membrane lipoprotein  50.13 
 
 		 368 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1953  basic membrane lipoprotein  53.13 
 
 		 373 aa  381  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0267127 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1927  basic membrane lipoprotein  46.75 
 
 		 382 aa  364  1e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.940408  normal  0.0318829 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3026  basic membrane lipoprotein  45.14 
 
 		 380 aa  363  4e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.743871 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3237  basic membrane lipoprotein  52.1 
 
 		 352 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1507  Bmp family membrane protein  47.54 
 
 		 382 aa  347  3e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119894  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0216  basic membrane lipoprotein  48.06 
 
 		 354 aa  334  1e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.518023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2594  basic membrane lipoprotein  47.27 
 
 		 362 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.266805  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2299  basic membrane lipoprotein  40.93 
 
 		 384 aa  320  3e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1902  basic membrane lipoprotein  45.78 
 
 		 359 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2501  basic membrane lipoprotein  48.66 
 
 		 381 aa  306  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403436  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2177  lipoprotein  47.59 
 
 		 380 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0794  basic membrane lipoprotein  47.29 
 
 		 380 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0638378  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1923  basic membrane lipoprotein  45.32 
 
 		 355 aa  302  7.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0526758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2379  basic membrane lipoprotein  47.29 
 
 		 385 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185576  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0759  bmp family protein  44.84 
 
 		 364 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1979  basic membrane lipoprotein  46.99 
 
 		 385 aa  300  3e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.919981  normal  0.873808 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0663  basic membrane lipoprotein  45.13 
 
 		 364 aa  299  6e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.888677  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1288  basic membrane lipoprotein  42.37 
 
 		 364 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.756319 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2993  basic membrane lipoprotein  44.44 
 
 		 361 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0878793 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1941  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  43.24 
 
 		 364 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00208553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2318  basic membrane lipoprotein  42.41 
 
 		 368 aa  289  6e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375115  normal  0.178466 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0673  basic membrane lipoprotein  44.54 
 
 		 357 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0869  basic membrane lipoprotein  41.08 
 
 		 356 aa  287  2.9999999999999996e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2636  basic membrane lipoprotein  43.07 
 
 		 376 aa  286  5e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.894025 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3629  basic membrane lipoprotein  45.32 
 
 		 355 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.178645  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1490  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  41.87 
 
 		 376 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0307169  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0567  bmp family protein  45.02 
 
 		 355 aa  283  5.000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3163  basic membrane lipoprotein  45.18 
 
 		 387 aa  281  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3882  basic membrane lipoprotein  42.02 
 
 		 366 aa  280  5e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4187  basic membrane lipoprotein  41.92 
 
 		 373 aa  279  6e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.083899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2138  basic membrane lipoprotein  44.41 
 
 		 390 aa  279  8e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.370861 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2443  basic membrane lipoprotein  43.5 
 
 		 384 aa  277  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2142  basic membrane lipoprotein  42.9 
 
 		 385 aa  276  6e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0806  putative lipoprotein  44.04 
 
 		 385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2169  lipoprotein  41.57 
 
 		 357 aa  274  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0737964  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3453  basic membrane lipoprotein  43.2 
 
 		 383 aa  274  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.032757 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3900  basic membrane lipoprotein  43.5 
 
 		 390 aa  273  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381277  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3176  basic membrane lipoprotein  41.99 
 
 		 376 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2148  basic membrane lipoprotein  43.71 
 
 		 360 aa  271  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.863295  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1106  basic membrane lipoprotein  42.94 
 
 		 357 aa  271  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.383245 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1415  basic membrane lipoprotein  41.03 
 
 		 356 aa  271  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218463  normal  0.0969049 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1903  basic membrane lipoprotein  41.81 
 
 		 358 aa  270  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.94528  normal  0.373123 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1135  basic membrane lipoprotein  41.39 
 
 		 388 aa  269  5e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293026 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5006  basic membrane lipoprotein  41.99 
 
 		 382 aa  269  5.9999999999999995e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3296  basic membrane lipoprotein  40.52 
 
 		 363 aa  268  8e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1914  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1002  basic membrane lipoprotein  40.18 
 
 		 377 aa  268  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1719  basic membrane lipoprotein  41.47 
 
 		 358 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00548824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1063  basic membrane lipoprotein  40.18 
 
 		 377 aa  266  7e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2444  basic membrane lipoprotein  42.9 
 
 		 382 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1708  basic membrane lipoprotein  42.34 
 
 		 426 aa  265  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.918914 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2146  basic membrane lipoprotein  39.55 
 
 		 368 aa  264  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.233394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1060  basic membrane lipoprotein  39.88 
 
 		 377 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2027  basic membrane lipoprotein  42.04 
 
 		 426 aa  263  6e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.073285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0224  hypothetical protein  39.34 
 
 		 365 aa  262  6e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3721  basic membrane lipoprotein  41.14 
 
 		 367 aa  262  6.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1766  basic membrane lipoprotein  43.24 
 
 		 358 aa  261  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3942  hypothetical protein  36.59 
 
 		 364 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116941  normal  0.561112 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0764  basic membrane lipoprotein  41.49 
 
 		 390 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000134233  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01800  hypothetical protein  38.74 
 
 		 365 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347768  normal  0.597763 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1039  basic membrane lipoprotein  42.17 
 
 		 383 aa  259  5.0000000000000005e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1486  basic membrane lipoprotein  40.84 
 
 		 386 aa  256  6e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1142  basic membrane lipoprotein  39.33 
 
 		 366 aa  255  7e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111164  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3560  ABC transporter periplasmic-binding protein  37.18 
 
 		 364 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.368311  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0928  basic membrane lipoprotein  37.14 
 
 		 360 aa  253  3e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2057  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  39.94 
 
 		 359 aa  254  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297273  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2964  putative basic membrane protein  40 
 
 		 387 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.698329 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3243  basic membrane lipoprotein  36.89 
 
 		 364 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5058  basic membrane lipoprotein  38.14 
 
 		 365 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1690  basic membrane lipoprotein  40.48 
 
 		 355 aa  250  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00161056  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1044  basic membrane lipoprotein  39.82 
 
 		 361 aa  248  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.361221  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0493  basic membrane lipoprotein  41.09 
 
 		 358 aa  246  6e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00240976  normal  0.0511349 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1118  basic membrane lipoprotein  36.6 
 
 		 359 aa  242  9e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0536373  normal  0.804172 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0450  basic membrane lipoprotein  38.64 
 
 		 625 aa  242  1e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0975  basic membrane lipoprotein  34.99 
 
 		 432 aa  242  1e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.494831 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1314  basic membrane lipoprotein  35.7 
 
 		 431 aa  227  3e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.348799  normal  0.383779 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1044  basic membrane lipoprotein  33.17 
 
 		 428 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00211594 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1176  basic membrane lipoprotein  36.2 
 
 		 430 aa  225  8e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0623927 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1015  basic membrane lipoprotein  37.05 
 
 		 362 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1460  basic membrane lipoprotein  37.15 
 
 		 382 aa  222  7e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.892929 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1794  basic membrane lipoprotein  36.59 
 
 		 381 aa  220  3.9999999999999997e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal  0.801516 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0141  Bmp family membrane protein  36.84 
 
 		 364 aa  218  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000041374  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0270  basic membrane lipoprotein  35.96 
 
 		 372 aa  214  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308192  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1360  bmp family protein  37.1 
 
 		 369 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4620  ABC transporter substrate-binding protein  36.53 
 
 		 369 aa  208  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0689181 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4847  basic membrane lipoprotein  36.17 
 
 		 371 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5659  lipoprotein  36.81 
 
 		 422 aa  206  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373529  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6457  basic membrane lipoprotein  35.24 
 
 		 375 aa  206  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.153955 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4236  basic membrane lipoprotein  34.35 
 
 		 360 aa  206  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1368  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  36.31 
 
 		 365 aa  205  9e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0529921  normal  0.073818 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5243  basic membrane lipoprotein  35.71 
 
 		 365 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1159  bmp family protein  35.76 
 
 		 363 aa  203  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1169  twin-arginine translocation pathway signal  36.23 
 
 		 369 aa  203  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1001  basic membrane lipoprotein  34.24 
 
 		 363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4474  basic membrane lipoprotein  34.67 
 
 		 375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.766807 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0836  basic membrane lipoprotein  34.81 
 
 		 367 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5873  basic membrane lipoprotein  30.31 
 
 		 364 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3026  basic membrane lipoprotein  36.8 
 
 		 381 aa  200  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1117  basic membrane lipoprotein  35.69 
 
 		 384 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.246215  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>