58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5352 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0720  putative methylase/helicase  46.71 
 
 		 1440 aa  1144    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.649111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1533  methylase/helicase  45.05 
 
 		 1440 aa  1102    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0293999 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3921  hypothetical protein  43.37 
 
 		 1425 aa  1001    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1475  putative methylase/helicase  46.79 
 
 		 1435 aa  1162    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3334  putative methylase/helicase  44.66 
 
 		 1437 aa  1085    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0476558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7413  putative methylase/helicase  46.12 
 
 		 1444 aa  1152    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.741196  normal  0.925564 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7717  putative methylase/helicase  45.84 
 
 		 1474 aa  1125    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.256661 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5265  putative methylase/helicase  42.96 
 
 		 1412 aa  989    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3174  methylase/helicase  47.14 
 
 		 1451 aa  1170    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1218  putative methylase/helicase  46.79 
 
 		 1439 aa  1128    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3517  putative methylase/helicase  46.79 
 
 		 1439 aa  1128    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.646689  normal  0.782963 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2128  methylase/helicase  46.96 
 
 		 1446 aa  1148    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3026  methylase/helicase  46.56 
 
 		 1447 aa  1152    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5352  methylase/helicase  100 
 
 		 1421 aa  2862    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.686845 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5206  putative methylase/helicase  72.48 
 
 		 1414 aa  2006    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3065  probably methylase/helicase  46.23 
 
 		 1448 aa  1149    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2784  putative methylase/helicase  46.56 
 
 		 1440 aa  1157    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.847517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6191  putative methylase/helicase  46.07 
 
 		 1463 aa  1113    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.255382  hitchhiker  0.00747336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2494  putative methylase/helicase  42.36 
 
 		 1529 aa  1087    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.207281 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3850  putative methylase/helicase  42.58 
 
 		 1536 aa  1102    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.829414 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5567  probably methylase/helicase  45.81 
 
 		 1458 aa  1053    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.368773  normal  0.186844 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3566  methylase/helicase  45.29 
 
 		 1455 aa  1113    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0108  hypothetical protein  43.36 
 
 		 1440 aa  1066    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0377  putative methylase/helicase  46.18 
 
 		 1459 aa  1100    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.27856  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2208  putative methylase/helicase  43.86 
 
 		 1413 aa  991    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3919  methylase/helicase  44.85 
 
 		 1459 aa  1109    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3828  methylase/helicase  46.26 
 
 		 1449 aa  1137    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0535  methylase/helicase  45.69 
 
 		 1444 aa  1119    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4223  putative methylase/helicase  45.88 
 
 		 896 aa  744    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.233912  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4155  putative methylase/helicase  45.7 
 
 		 1498 aa  1135    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2652  methylase/helicase  46.26 
 
 		 1396 aa  1126    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0582946 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3699  putative methylase/helicase  45.74 
 
 		 836 aa  572  1e-161  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0441  putative methylase/helicase  43.99 
 
 		 824 aa  560  1e-158  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.683443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4008  putative methylase/helicase  45.22 
 
 		 836 aa  548  1e-154  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.621017  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0437  putative methylase/helicase  43.28 
 
 		 611 aa  441  9.999999999999999e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3694  hypothetical protein  43.36 
 
 		 623 aa  398  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4003  hypothetical protein  42.24 
 
 		 623 aa  388  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40550  predicted protein  32.62 
 
 		 950 aa  363  2e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4601  putative methylase/helicase  39.82 
 
 		 684 aa  320  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3082  hypothetical protein  39.04 
 
 		 515 aa  209  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30868  predicted protein  29.62 
 
 		 1487 aa  177  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.186936  normal  0.423198 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4470  hypothetical protein  50 
 
 		 397 aa  100  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5392  helicase domain protein  24.1 
 
 		 2123 aa  90.1  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3582  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  34.97 
 
 		 254 aa  73.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3662  hypothetical protein  33.15 
 
 		 569 aa  69.7  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4206  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 658 aa  64.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000155925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  28.74 
 
 		 660 aa  62.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  29.24 
 
 		 557 aa  61.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3698  hypothetical protein  31.67 
 
 		 449 aa  59.3  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3619  methyltransferase type 11  27.12 
 
 		 450 aa  56.2  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4148  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  29.31 
 
 		 481 aa  55.5  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.948867  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0073  DNA-methyltransferase-like  31.78 
 
 		 313 aa  52  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.648628 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4362  hypothetical protein  31.41 
 
 		 520 aa  51.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0222  hypothetical protein  32.93 
 
 		 451 aa  50.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.791587 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7298  DNA restriction methylase  32.12 
 
 		 548 aa  47.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000885633  unclonable  0.0000166631 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1957  putative methylase  31.54 
 
 		 188 aa  45.8  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0003  helicase. putatve  24.1 
 
 		 2133 aa  45.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1888  type I restriction-modification system, M subunit  24.16 
 
 		 526 aa  45.1  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>