More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4943 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4943  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
290 aa  573  1.0000000000000001e-162  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  44.07 
 
 
290 aa  231  1e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0774  alpha/beta hydrolase fold  46.02 
 
 
307 aa  229  4e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.921601  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1245  alpha/beta hydrolase fold  44.13 
 
 
290 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.433154 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0941  alpha/beta hydrolase  46.18 
 
 
284 aa  217  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2860  alpha/beta hydrolase fold  42.61 
 
 
290 aa  206  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.390288 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2058  alpha/beta hydrolase fold  44.03 
 
 
292 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1013  alpha/beta hydrolase fold  43.55 
 
 
307 aa  185  7e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1430  hypothetical protein  41.61 
 
 
295 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.227801  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1872  alpha/beta hydrolase fold  41.52 
 
 
299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0521053  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1140  alpha/beta hydrolase fold protein  39.32 
 
 
298 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348769  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0987  alpha/beta hydrolase fold  38.01 
 
 
298 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201557  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0927  alpha/beta hydrolase fold  42.31 
 
 
274 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.111106 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2253  hydrolase or acyltransferase  41.96 
 
 
274 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  34.93 
 
 
287 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  38.28 
 
 
284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1991  alpha/beta hydrolase fold protein  40.08 
 
 
323 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534257  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1573  hypothetical protein  38.71 
 
 
323 aa  152  7e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1867  hypothetical protein  32.35 
 
 
300 aa  149  4e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  34.88 
 
 
607 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0851  alpha/beta hydrolase fold protein  37.67 
 
 
308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1876  hypothetical protein  31.99 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2701  putative hydrolase / acyltransferase  38.87 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1659  alpha/beta hydrolase  40.64 
 
 
277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0254328  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3150  alpha/beta hydrolase fold  38.18 
 
 
311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  37.82 
 
 
311 aa  144  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1100  alpha/beta fold family hydrolase  39.53 
 
 
325 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.474494  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1707  alpha/beta fold family hydrolase  40 
 
 
421 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1885  alpha/beta fold family hydrolase  39.92 
 
 
448 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0206  alpha/beta fold family hydrolase  40 
 
 
378 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218372  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0958  alpha/beta fold family hydrolase  39.92 
 
 
448 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.200305  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1544  alpha/beta fold family hydrolase  39.92 
 
 
448 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1731  alpha/beta fold family hydrolase  39.92 
 
 
448 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.722872  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 
626 aa  142  8e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1652  hydrolase or acyltransferase  39.58 
 
 
275 aa  142  8e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.710733  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1396  alpha/beta hydrolase fold  37.3 
 
 
298 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1838  Alpha/beta hydrolase fold  39.25 
 
 
286 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.557547  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1782  alpha/beta hydrolase fold  37.21 
 
 
298 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1272  Alpha/beta hydrolase fold  37.3 
 
 
294 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  37.08 
 
 
306 aa  139  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1356  alpha/beta hydrolase fold  36.51 
 
 
297 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1898  alpha/beta hydrolase fold  36.58 
 
 
300 aa  138  8.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033526 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2243  alpha/beta hydrolase fold  41.04 
 
 
274 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134722  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4612  Alpha/beta hydrolase  36.99 
 
 
298 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00157572  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2599  alpha/beta fold family hydrolase  39.15 
 
 
301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1650  alpha/beta hydrolase fold protein  38.08 
 
 
289 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1449  alpha/beta hydrolase fold  36.51 
 
 
298 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00111957  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0989  alpha/beta hydrolase fold  36.51 
 
 
298 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160444  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1471  alpha/beta hydrolase fold  36.51 
 
 
298 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0221  putative hydrolase  29.85 
 
 
284 aa  134  9.999999999999999e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.555704  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1368  putative hydrolase  36.9 
 
 
304 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1980  alpha/beta hydrolase fold  37.31 
 
 
289 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4162  alpha/beta hydrolase fold  31.13 
 
 
283 aa  132  6e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.685661  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3569  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 
282 aa  132  6.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0939994  normal  0.0434942 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0785  alpha/beta hydrolase fold  32.68 
 
 
302 aa  129  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1157  alpha/beta hydrolase fold  38.15 
 
 
293 aa  129  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750914  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1577  putative hydrolase protein  36.5 
 
 
296 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2759  alpha/beta hydrolase fold  37.21 
 
 
304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2557  alpha/beta hydrolase fold  36.27 
 
 
302 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2855  alpha/beta hydrolase fold  36.76 
 
 
335 aa  126  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521635  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0785  Alpha/beta hydrolase  30 
 
 
283 aa  125  1e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  28.52 
 
 
285 aa  124  1e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2070  alpha/beta hydrolase  34.94 
 
 
299 aa  125  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1646  alpha/beta hydrolase fold  34.33 
 
 
292 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969824  normal  0.0462381 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0035  hypothetical protein  36.98 
 
 
279 aa  123  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1587  alpha/beta hydrolase fold  35.85 
 
 
330 aa  123  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4365  alpha/beta hydrolase fold  35.09 
 
 
292 aa  123  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2058  alpha/beta hydrolase fold protein  33.96 
 
 
292 aa  122  5e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0070331  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01917  putative hydrolase protein  33.07 
 
 
305 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.602694  normal  0.0615168 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2423  alpha/beta hydrolase fold protein  33.08 
 
 
295 aa  119  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2586  alpha/beta hydrolase fold protein  34.26 
 
 
319 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0132974  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2704  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 
309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0111794  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2538  alpha/beta hydrolase fold  32.85 
 
 
306 aa  110  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0065  alpha/beta hydrolase fold  32.05 
 
 
312 aa  105  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418354  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  32.41 
 
 
299 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  32.41 
 
 
299 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0946  alpha/beta hydrolase  30.83 
 
 
297 aa  90.5  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.649137  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 
280 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 
282 aa  80.1  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 
295 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10140  alpha/beta hydrolase  41.35 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0243415  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
264 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 
300 aa  72  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3435  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.898623  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2698  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.705965  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2742  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  28.26 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2728  alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 
275 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal  0.292016 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  35.29 
 
 
270 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 
290 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1862  alpha/beta hydrolase fold  30.16 
 
 
301 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  26.95 
 
 
292 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1025  alpha/beta hydrolase fold protein  31.27 
 
 
301 aa  68.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  28.15 
 
 
267 aa  67.8  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  37.19 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  34.81 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0653  alpha/beta hydrolase fold  22.66 
 
 
262 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.748775  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0638  alpha/beta hydrolase fold  22.66 
 
 
262 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 
285 aa  67  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>