More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4307 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4307  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
806 aa  1597    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.767019  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.69 
 
 
966 aa  381  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.691252 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2578  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.2 
 
 
689 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.800994 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3532  PAS  36.95 
 
 
691 aa  369  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.804686  normal  0.0772354 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3083  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.61 
 
 
845 aa  366  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.9 
 
 
1013 aa  369  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1870  sensory box histidine kinase/response regulator  35.95 
 
 
691 aa  365  2e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.99 
 
 
1059 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111783  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.18 
 
 
1011 aa  355  2e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.99 
 
 
814 aa  346  8.999999999999999e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486726  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2045  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 
812 aa  343  5.999999999999999e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000148537 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5545  two component sensor kinase/response regulator hybrid  37.61 
 
 
1036 aa  331  4e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2967  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.09 
 
 
949 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291071  normal  0.350737 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3692  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.54 
 
 
951 aa  327  5e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.408416  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3795  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.8 
 
 
807 aa  326  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.750808 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4603  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.42 
 
 
783 aa  325  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1306  PAS sensor Signal tranduction histidine kinase  38.48 
 
 
949 aa  324  5e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124542  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.31 
 
 
1086 aa  321  3e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2740  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 
943 aa  318  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.11 
 
 
1092 aa  318  3e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  35.11 
 
 
1086 aa  316  9e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  37.42 
 
 
1065 aa  316  9.999999999999999e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.66 
 
 
957 aa  316  9.999999999999999e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324886  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.38 
 
 
1065 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115718  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1277  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.11 
 
 
807 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912371  normal  0.18237 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5841  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.32 
 
 
887 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.111175 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0146  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.05 
 
 
1381 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.12 
 
 
651 aa  309  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326262  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.55 
 
 
1057 aa  306  7e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0540  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 
1089 aa  306  9.000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.93 
 
 
1036 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2976  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.5 
 
 
889 aa  304  3.0000000000000004e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.29382  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3335  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.04 
 
 
942 aa  302  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4749  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.26 
 
 
781 aa  301  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.872225  normal  0.641352 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.25 
 
 
686 aa  301  3e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3298  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.07 
 
 
922 aa  301  4e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1173  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.19 
 
 
795 aa  301  4e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524225  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.2 
 
 
814 aa  301  4e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1031  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.07 
 
 
689 aa  300  7e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.85 
 
 
977 aa  299  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.416631 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3679  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.7 
 
 
979 aa  299  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138825  normal  0.0339746 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0018  ATPase domain-containing protein  42.58 
 
 
681 aa  297  7e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.434302  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0019  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.58 
 
 
681 aa  296  7e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.746553  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6946  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.81 
 
 
789 aa  296  8e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0038  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.67 
 
 
681 aa  296  8e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0323591 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6445  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.75 
 
 
830 aa  296  9e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0224728  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1830  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.5 
 
 
1165 aa  296  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.87 
 
 
732 aa  296  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4711  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.92 
 
 
683 aa  296  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4905  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.82 
 
 
822 aa  296  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.9 
 
 
703 aa  295  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0024  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.45 
 
 
734 aa  295  3e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2026  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.85 
 
 
964 aa  295  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6778  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.21 
 
 
905 aa  294  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.433337  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.33 
 
 
1076 aa  294  5e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.89 
 
 
660 aa  294  5e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3087  ATP-binding region, ATPase-like  36.38 
 
 
847 aa  294  6e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.373882  normal  0.0754896 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 
941 aa  293  7e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1041  sensory box histidine kinase/response regulator  36.18 
 
 
611 aa  293  8e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2635  sensory box histidine kinase/response regulator  36.18 
 
 
611 aa  293  8e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0134  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.45 
 
 
682 aa  293  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.574481  normal  0.0374693 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0137  sensory box histidine kinase/response regulator  36.18 
 
 
611 aa  292  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1307  sensory box histidine kinase/response regulator  36.18 
 
 
611 aa  292  1e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2778  Signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 
611 aa  292  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 
662 aa  291  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0044  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.9 
 
 
810 aa  291  3e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0655  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.49 
 
 
864 aa  291  3e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1794  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
795 aa  291  4e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.477207 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2181  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.02 
 
 
712 aa  290  6e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.113069  normal  0.344517 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.66 
 
 
1076 aa  290  7e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.715458 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0098  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.35 
 
 
1050 aa  289  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0712  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 
827 aa  289  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48160  putative sensor/response regulator hybrid  38.02 
 
 
858 aa  289  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217947 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.32 
 
 
589 aa  289  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.153925  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4293  sensory box histidine kinase/response regulator  35.34 
 
 
793 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0284  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.22 
 
 
1105 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0846765 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4524  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.32 
 
 
589 aa  289  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3634  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.42 
 
 
944 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103342  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1131  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.1 
 
 
826 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.120114  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5228  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.47 
 
 
1224 aa  288  4e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 
943 aa  288  4e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 
1631 aa  288  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3488  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.5 
 
 
508 aa  287  5e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0163  sensory box histidine kinase/response regulator  42.27 
 
 
611 aa  287  7e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2717  sensory box histidine kinase/response regulator  35.81 
 
 
676 aa  286  8e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.230475  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.48 
 
 
789 aa  286  8e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163342  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4534  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.48 
 
 
789 aa  286  8e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178045  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3549  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.16 
 
 
702 aa  286  9e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0225  PAS  36.6 
 
 
673 aa  286  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5728  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.13 
 
 
727 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7844  sensor histidine kinase  43.22 
 
 
529 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3564  histidine kinase  38.98 
 
 
544 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 
821 aa  285  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.01 
 
 
653 aa  284  4.0000000000000003e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0873112  normal  0.0648404 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3355  PAS  39.66 
 
 
646 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.996652  normal  0.102892 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1835  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.92 
 
 
782 aa  284  5.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.448152 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3039  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.72 
 
 
1067 aa  284  6.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.635771  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3139  histidine kinase  36.69 
 
 
533 aa  283  8.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468681  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 
858 aa  283  8.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1300  PAS  35.5 
 
 
695 aa  283  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.233563 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>