More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4206 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4206  ATP-dependent DNA helicase RecQ  100 
 
 
628 aa  1259    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2984  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.21 
 
 
600 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.31482 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3529  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.63 
 
 
620 aa  488  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.600599  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.88 
 
 
601 aa  485  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3439  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.26 
 
 
599 aa  488  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.833511  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4306  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.43 
 
 
607 aa  488  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227101  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.13 
 
 
603 aa  479  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0839  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.15 
 
 
626 aa  479  1e-134  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.305009 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1931  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.16 
 
 
711 aa  479  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161576  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.41 
 
 
598 aa  478  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.55 
 
 
599 aa  477  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32800  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.81 
 
 
707 aa  477  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1812  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.98 
 
 
710 aa  473  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.646087  normal  0.880119 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0953  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.14 
 
 
611 aa  475  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1097  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.14 
 
 
611 aa  475  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5313  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.22 
 
 
616 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3805  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.43 
 
 
714 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.824216  hitchhiker  0.00000305051 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1438  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.22 
 
 
625 aa  473  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.4 
 
 
599 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1786  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.25 
 
 
711 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.57 
 
 
712 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3025  ATP-dependent DNA helicase protein  46.12 
 
 
637 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0062287  normal  0.0101494 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.42 
 
 
709 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3305  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.31 
 
 
637 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.563115  normal  0.0132339 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0695  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.06 
 
 
612 aa  467  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2993  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.68 
 
 
633 aa  468  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768661  normal  0.830913 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0299  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.32 
 
 
609 aa  466  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236448  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4516  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.03 
 
 
715 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121492  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0224  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.82 
 
 
611 aa  462  1e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4022  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.04 
 
 
715 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0251984 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2380  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.64 
 
 
596 aa  463  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212665  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4701  ATP-dependent DNA helicase, RecQ  44.81 
 
 
618 aa  465  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3103  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.99 
 
 
601 aa  463  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.69477  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0870  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.59 
 
 
611 aa  462  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.03 
 
 
715 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6924  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.05 
 
 
625 aa  462  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.286849 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2958  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.15 
 
 
636 aa  462  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217223 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1644  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.26 
 
 
709 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3738  ATP-dependent DNA helicase RecQ:ATP-requiring DNA helicase RecQ  43.42 
 
 
709 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.145176  normal  0.0175539 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6077  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.66 
 
 
618 aa  459  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.9148  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.82 
 
 
620 aa  456  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0400145  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0734  ATP-dependent DNA helicase  43.23 
 
 
600 aa  457  1e-127  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.792164  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2101  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.18 
 
 
625 aa  458  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4296  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.56 
 
 
715 aa  455  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0839194  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0649  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.4 
 
 
600 aa  458  1e-127  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0697  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.84 
 
 
662 aa  457  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2961  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.02 
 
 
622 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.303637 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4412  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.72 
 
 
619 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.659664  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30110  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.55 
 
 
617 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.756128 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0635  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.87 
 
 
748 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000112896  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.16 
 
 
615 aa  451  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0896  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.74 
 
 
598 aa  451  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2446  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.77 
 
 
739 aa  451  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.772322  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0199  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.97 
 
 
602 aa  452  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.67 
 
 
630 aa  450  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554418  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5549  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.68 
 
 
606 aa  448  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.132068  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17970  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.44 
 
 
631 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.510597  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.62 
 
 
608 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00653276  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0913  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.68 
 
 
617 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.631203  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2702  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.6 
 
 
621 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00344  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.75 
 
 
625 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.42 
 
 
611 aa  448  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2226  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.77 
 
 
647 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.67 
 
 
605 aa  448  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.514441  normal  0.157684 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0731  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.19 
 
 
625 aa  442  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0153  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.53 
 
 
633 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3964  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.13 
 
 
608 aa  444  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.23 
 
 
614 aa  445  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.486098  normal  0.649708 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1851  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.53 
 
 
603 aa  445  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.484605  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2194  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.53 
 
 
603 aa  445  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0579  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.04 
 
 
601 aa  444  1e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0114  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.01 
 
 
639 aa  445  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.186389 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1047  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.54 
 
 
657 aa  441  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.763377  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1918  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.85 
 
 
658 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0352657  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1914  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.55 
 
 
588 aa  441  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2638  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.37 
 
 
615 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.923469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6926  ATP-dependent DNA helicase  44.93 
 
 
628 aa  440  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0650469  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3783  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.85 
 
 
647 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0410934  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33130  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.57 
 
 
607 aa  441  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0486618  normal  0.887985 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1604  ATP-dependent DNA helicase  42.04 
 
 
601 aa  441  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.37 
 
 
615 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3074  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.69 
 
 
644 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0876032  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2846  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.41 
 
 
615 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.551557 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3752  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.37 
 
 
615 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2090  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.91 
 
 
621 aa  439  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.375473  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3472  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.37 
 
 
615 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.290967  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3175  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.85 
 
 
763 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0819328  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4157  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.48 
 
 
611 aa  437  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3105  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.02 
 
 
613 aa  436  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.34837  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4241  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.21 
 
 
607 aa  436  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.48 
 
 
609 aa  436  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4343  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.48 
 
 
609 aa  438  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.45 
 
 
714 aa  436  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0555  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.9 
 
 
610 aa  437  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.48 
 
 
611 aa  436  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0459  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.74 
 
 
618 aa  436  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1489  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.82 
 
 
603 aa  436  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.0818763 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0170  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.7 
 
 
633 aa  438  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4289  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.48 
 
 
609 aa  436  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3763  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.64 
 
 
607 aa  436  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.228349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>