More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3011 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3011  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  100 
 
 		 605 aa  1204    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245556  normal  1 
 
 
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NC_008347  Mmar10_1506  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.58 
 
 		 603 aa  587  1e-166  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2948  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.93 
 
 		 603 aa  546  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181074  hitchhiker  0.00226197 
 
 
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NC_009720  Xaut_4751  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.41 
 
 		 626 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007643  Rru_A2408  RecJ exonuclease  46.26 
 
 		 606 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011666  Msil_3073  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.69 
 
 		 603 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_1563  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.89 
 
 		 610 aa  466  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.553946 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2813  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.35 
 
 		 613 aa  462  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0113123  normal  1 
 
 
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NC_002978  WD0312  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.34 
 
 		 579 aa  452  1.0000000000000001e-126  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_2787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.16 
 
 		 613 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007406  Nwi_1645  RecJ exonuclease  44.21 
 
 		 613 aa  451  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.79109 
 
 
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NC_007958  RPD_2499  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.65 
 
 		 633 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.408241  normal  0.222109 
 
 
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NC_009485  BBta_4000  exonuclease RecJ  45.01 
 
 		 613 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_1741  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.49 
 
 		 600 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
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NC_007354  Ecaj_0891  RecJ exonuclease  39.53 
 
 		 584 aa  442  1e-123  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2307  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.15 
 
 		 613 aa  443  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2797  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.76 
 
 		 605 aa  444  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.532995  normal  0.915588 
 
 
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NC_011369  Rleg2_1547  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.59 
 
 		 600 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007778  RPB_2962  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.98 
 
 		 613 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.972235 
 
 
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NC_007799  ECH_1115  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.76 
 
 		 589 aa  440  9.999999999999999e-123  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008783  BARBAKC583_0900  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.55 
 
 		 594 aa  436  1e-121  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.209081  n/a   
 
 
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NC_007794  Saro_2274  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.74 
 
 		 573 aa  433  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349175  n/a   
 
 
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NC_008044  TM1040_2166  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.19 
 
 		 603 aa  434  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.145891 
 
 
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NC_008048  Sala_3014  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.49 
 
 		 588 aa  434  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.858016 
 
 
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NC_008254  Meso_0990  exonuclease RecJ  43.56 
 
 		 594 aa  435  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009952  Dshi_2275  single-stranded-DNA-specific exonuclease  44.39 
 
 		 585 aa  433  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011989  Avi_2280  single-stranded-DNA-specific exonuclease  43.63 
 
 		 600 aa  434  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340529  n/a   
 
 
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NC_009484  Acry_1296  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.59 
 
 		 594 aa  422  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004310  BR1270  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.29 
 
 		 594 aa  421  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_1920  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.95 
 
 		 594 aa  422  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010172  Mext_2762  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.53 
 
 		 611 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010725  Mpop_2885  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.53 
 
 		 611 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009636  Smed_1452  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.24 
 
 		 600 aa  412  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00256801  hitchhiker  0.00132955 
 
 
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NC_008686  Pden_1877  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.52 
 
 		 580 aa  412  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009511  Swit_4733  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.67 
 
 		 588 aa  413  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008576  Mmc1_1758  exonuclease RecJ  43.63 
 
 		 592 aa  413  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.150743  normal  0.165864 
 
 
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NC_011757  Mchl_2989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.53 
 
 		 611 aa  409  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.907848 
 
 
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NC_009505  BOV_1231  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.43 
 
 		 575 aa  410  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.337799  n/a   
 
 
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NC_009428  Rsph17025_0832  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.28 
 
 		 583 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792862 
 
 
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NC_007802  Jann_3002  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.2 
 
 		 582 aa  401  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.728985  normal  0.47011 
 
 
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NC_007493  RSP_0405  single-stranded DNA-specific exonuclease  44.87 
 
 		 583 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011365  Gdia_2502  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.94 
 
 		 619 aa  394  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386511  normal  0.196855 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2059  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.71 
 
 		 583 aa  395  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011894  Mnod_0206  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.09 
 
 		 597 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_3141  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.18 
 
 		 597 aa  391  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
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NC_007798  NSE_0712  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.27 
 
 		 577 aa  389  1e-106  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.4 
 
 		 568 aa  321  3e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009012  Cthe_1346  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.91 
 
 		 827 aa  317  5e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000597878  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1890  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.56 
 
 		 574 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000386066  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_2006  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.9 
 
 		 586 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007404  Tbd_1771  exonuclease RecJ  37.63 
 
 		 565 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.495895  normal  0.722264 
 
 
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NC_007973  Rmet_1038  exonuclease RecJ  38.25 
 
 		 566 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.329478 
 
 
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NC_012918  GM21_1787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.31 
 
 		 569 aa  302  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0490686 
 
 
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NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.67 
 
 		 885 aa  302  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
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NC_011662  Tmz1t_1969  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.45 
 
 		 563 aa  301  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00305659  n/a   
 
 
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NC_007298  Daro_2838  RecJ exonuclease  36.95 
 
 		 566 aa  301  3e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.934115  normal  1 
 
 
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NC_002939  GSU2614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.54 
 
 		 578 aa  300  4e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007347  Reut_A1074  exonuclease RecJ  37.94 
 
 		 565 aa  299  9e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0444947  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_1721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.58 
 
 		 573 aa  299  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_1327  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.95 
 
 		 599 aa  296  9e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
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NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.38 
 
 		 814 aa  289  9e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000495428  n/a   
 
 
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NC_010622  Bphy_1448  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.12 
 
 		 577 aa  287  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010681  Bphyt_2569  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.22 
 
 		 568 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217652  normal  0.0265746 
 
 
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NC_010682  Rpic_0958  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.18 
 
 		 564 aa  284  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.388256  normal  0.0147257 
 
 
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NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.81 
 
 		 811 aa  283  8.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_0857  RecJ exonuclease  35.34 
 
 		 578 aa  283  8.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009718  Fnod_0336  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.1 
 
 		 989 aa  282  2e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_4050  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.82 
 
 		 570 aa  281  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178442 
 
 
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NC_011059  Paes_1673  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.96 
 
 		 570 aa  281  3e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000218302  normal  0.669002 
 
 
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NC_013411  GYMC61_0937  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.21 
 
 		 788 aa  280  4e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007951  Bxe_A1564  RecJ exonuclease  37.65 
 
 		 568 aa  280  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.373395  normal  0.277595 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1054  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.84 
 
 		 564 aa  280  5e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497812  normal  0.288787 
 
 
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NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  32.64 
 
 		 932 aa  279  9e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
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NC_009943  Dole_2106  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.01 
 
 		 573 aa  279  1e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00306237  n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_2512  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.71 
 
 		 785 aa  278  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000579618  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4256  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.33 
 
 		 773 aa  278  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0707  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.62 
 
 		 779 aa  277  3e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2026  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.53 
 
 		 565 aa  278  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.698536 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3125  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.22 
 
 		 779 aa  277  3e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2153  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.53 
 
 		 565 aa  277  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000147893  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1115  single-stranded-DNA-specific exonuclease protein  38.53 
 
 		 565 aa  277  5e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00151931  normal  0.274168 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1415  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.93 
 
 		 573 aa  276  6e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1313  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.11 
 
 		 573 aa  276  7e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4304  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.73 
 
 		 779 aa  276  8e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4639  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.73 
 
 		 779 aa  276  8e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4493  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.73 
 
 		 779 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2536  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.95 
 
 		 564 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.962109  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4528  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.43 
 
 		 779 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0487  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.46 
 
 		 601 aa  276  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.624528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4543  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.73 
 
 		 779 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_1287  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.58 
 
 		 831 aa  275  2.0000000000000002e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2289  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.02 
 
 		 907 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.322971  hitchhiker  0.00000129081 
 
 
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NC_008836  BMA10229_A3113  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.31 
 
 		 564 aa  274  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease  34.73 
 
 		 779 aa  274  3e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK4153  single-stranded-DNA-specific exonuclease  34.73 
 
 		 779 aa  275  3e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006348  BMA1698  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.31 
 
 		 564 aa  274  3e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_1478  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.31 
 
 		 564 aa  274  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010084  Bmul_1154  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.01 
 
 		 565 aa  274  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0447096 
 
 
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NC_010483  TRQ2_1209  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.71 
 
 		 955 aa  274  3e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00300001  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_2642  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.31 
 
 		 564 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
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