More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2116 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2116  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 
249 aa  488  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0394214  normal  0.10898 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2120  LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
244 aa  85.5  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0535979  normal  0.194929 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1664  transcriptional regulator, LuxR family  31.12 
 
 
237 aa  77.4  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.888844 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1997  autoinducer-binding transcriptional regulator, LuxR family  31.12 
 
 
237 aa  77.4  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.448669  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  34.07 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0323  transcriptional regulator, LuxR family  35.64 
 
 
243 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4114  putative transcriptional activator  29.86 
 
 
213 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0418  LuxR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
242 aa  73.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0198  autoinducer-binding domain-containing protein  28.14 
 
 
235 aa  72.4  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00000129067  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
244 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7112  LuxR family transcriptional regulator  34.59 
 
 
242 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0985225  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0402  regulatory protein, LuxR  28.18 
 
 
242 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5029  transcriptional regulator, LuxR family  29.67 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1003  transcriptional regulator, LuxR family  28.1 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3395  LuxR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5762  LuxR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225342  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5809  transcriptional regulator, LuxR family  32.03 
 
 
235 aa  65.1  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.962539  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2915  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.56 
 
 
237 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454836  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4539  transcriptional regulator, LuxR family, autoinducer-regulated  29.32 
 
 
254 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0641  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.56 
 
 
241 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0312274  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2798  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.56 
 
 
237 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.675669  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1686  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.56 
 
 
237 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0643903  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2672  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.56 
 
 
241 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2729  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.56 
 
 
241 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0930619  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2371  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.56 
 
 
241 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440892  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5040  LuxR family transcriptional regulator  25.74 
 
 
229 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350334  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0920  LuxR family transcriptional regulator  28.18 
 
 
268 aa  63.5  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.81926  normal  0.148698 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3810  LuxR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
242 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1817  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.33 
 
 
241 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.985291  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5194  LuxR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
242 aa  62.4  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5493  transcriptional regulator, LuxR family  27.82 
 
 
236 aa  62  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01929  transcriptional activator of quorum sensing autoinducer synthesis transcription regulator protein  31.28 
 
 
248 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.746701 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0965  transcriptional activator protein LuxR  25 
 
 
248 aa  60.8  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.266935  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3386  putative transcriptional regulator  24 
 
 
237 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4216  regulatory protein, LuxR  28.27 
 
 
254 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3665  LuxR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
238 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39980  putative transcriptional regulator  24.66 
 
 
237 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4977  transcriptional regulator, LuxR family  29.28 
 
 
243 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.142556 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3402  response regulator receiver protein  30.71 
 
 
238 aa  59.7  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.511462  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4514  autoinducer-binding domain-containing protein  29.28 
 
 
243 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
239 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5810  LuxR family transcriptional regulator  28 
 
 
228 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.809704  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6040  LuxR family transcriptional regulator  28 
 
 
228 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.917081 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0127  transcriptional regulator, LuxR family  25.55 
 
 
236 aa  59.3  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3087  transcriptional regulator, LuxR family  30.77 
 
 
241 aa  58.9  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0183  LuxR family transcriptional regulator  29.12 
 
 
235 aa  57.8  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0816251  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0963  transcriptional regulator, LuxR family  25.1 
 
 
237 aa  58.5  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.27907  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0190  LuxR family transcriptional regulator  29.12 
 
 
235 aa  57.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.195449  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1576  LuxR family transcriptional regulator  25.33 
 
 
230 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.893939  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0617  LuxR family transcriptional regulator  25.33 
 
 
230 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0241474  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2215  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  25.33 
 
 
230 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311283  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2128  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  25.33 
 
 
230 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.423434  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0702  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  25.33 
 
 
230 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.669136  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4299  LuxR family transcriptional regulator  29.83 
 
 
237 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190696 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4980  LuxR family transcriptional regulator  29.83 
 
 
237 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1709  autoinducer-binding domain-containing protein  30.51 
 
 
233 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3180  LuxR family transcriptional regulator  29.83 
 
 
237 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2024  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.33 
 
 
230 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.896026  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0122  LuxR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
233 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5699  LuxR family transcriptional regulator  49.21 
 
 
239 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0607724 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1758  autoinducer-binding domain-containing protein  29.51 
 
 
233 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2087  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.31 
 
 
425 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417065  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0282  transcriptional regulator, LuxR family  30.43 
 
 
246 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.419752  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2818  transcriptional regulator, LuxR family  28.99 
 
 
241 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0185947 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3287  transcriptional activator SOLR transcription regulator protein  28.26 
 
 
236 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1443  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.07 
 
 
238 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0854  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.07 
 
 
238 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.777865  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2171  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.07 
 
 
238 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0944598  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0444  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.07 
 
 
238 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853961  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3898  transcriptional regulator LasR  25.42 
 
 
239 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.219668  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0542  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.07 
 
 
238 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1863  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.07 
 
 
394 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00465528  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4045  LuxR family transcriptional regulator  50.82 
 
 
208 aa  55.8  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0100  transcriptional regulator, LuxR family  22.71 
 
 
250 aa  55.8  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3512  regulatory protein, LuxR  49.18 
 
 
222 aa  55.5  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.492486  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.69 
 
 
222 aa  55.8  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3971  LuxR family transcriptional regulator  27.53 
 
 
239 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000126265  normal  0.0321799 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4581  LuxR family transcriptional regulator  28.94 
 
 
239 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000141763  hitchhiker  0.0000089809 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4428  transcriptional regulator, LuxR family  24.63 
 
 
245 aa  55.5  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5576  LuxR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
239 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000012464  normal  0.015154 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2088  LuxR family transcriptional regulator  50.82 
 
 
77 aa  55.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.33427  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0182  LuxR family transcriptional regulator  22.8 
 
 
247 aa  54.7  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00268604  hitchhiker  0.00000585836 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0805  LuxR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
230 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565309  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3102  LuxR family transcriptional regulator  29.83 
 
 
239 aa  54.7  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.644499  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3643  LuxR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
239 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00106494  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0720  LuxR family transcriptional regulator  22.8 
 
 
247 aa  54.7  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4724  LuxR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
239 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000522863  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0791  LuxR family transcriptional regulator  22.8 
 
 
247 aa  54.7  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0142  N-acyl-homoserine lactone dependent regulatory protein  31.73 
 
 
234 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1052  LuxR family transcriptional regulator  28.94 
 
 
239 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445716  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1513  LuxR family transcriptional regulator  29.85 
 
 
246 aa  53.9  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493267  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1231  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.69 
 
 
234 aa  54.3  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.681253  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3273  transcriptional regulator LuxR family  28.42 
 
 
241 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1570  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.73 
 
 
236 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.778317  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 
234 aa  54.3  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0359  LuxR family transcriptional regulator  26.7 
 
 
248 aa  54.3  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.870907  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1652  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.73 
 
 
234 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.643432  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45960  transcriptional regulator LasR  24.29 
 
 
239 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4168  transcriptional regulator, LuxR family  29.15 
 
 
251 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2028  LuxR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
242 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>