231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1885 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1885  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
354 aa  717    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0370  aminoglycoside phosphotransferase  58.58 
 
 
345 aa  403  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.380981  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2652  aminoglycoside phosphotransferase  53.33 
 
 
353 aa  355  6.999999999999999e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000355622  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0618  putative phosphotransferase  52.1 
 
 
350 aa  344  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172758  normal  0.0703036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6361  aminoglycoside phosphotransferase  49.7 
 
 
342 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00784596  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4318  aminoglycoside phosphotransferase  42.3 
 
 
350 aa  269  4e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136216  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1805  aminoglycoside phosphotransferase  41.3 
 
 
354 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.726443  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1852  aminoglycoside phosphotransferase  41.3 
 
 
354 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.906902  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1786  aminoglycoside phosphotransferase  41.3 
 
 
354 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0286679  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2028  aminoglycoside phosphotransferase  43.07 
 
 
350 aa  250  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00704541  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  40.72 
 
 
349 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0861  aminoglycoside phosphotransferase  40.06 
 
 
354 aa  212  7e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.622757  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2450  aminoglycoside phosphotransferase  36.59 
 
 
343 aa  212  7e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4201  aminoglycoside phosphotransferase  35.54 
 
 
343 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3748  aminoglycoside phosphotransferase  36.45 
 
 
350 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3736  aminoglycoside phosphotransferase  36.45 
 
 
350 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3809  aminoglycoside phosphotransferase  36.45 
 
 
350 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.274581 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  37.07 
 
 
355 aa  199  6e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  38.46 
 
 
344 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0097  aminoglycoside phosphotransferase  33.43 
 
 
340 aa  196  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.92974  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  38.18 
 
 
338 aa  195  8.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  37.61 
 
 
349 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  35.36 
 
 
353 aa  193  4e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  37.58 
 
 
352 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  35.13 
 
 
352 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  40.52 
 
 
344 aa  189  8e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  36.72 
 
 
339 aa  188  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  34.74 
 
 
391 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  38.11 
 
 
359 aa  188  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  40.75 
 
 
353 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  35.03 
 
 
350 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  33.9 
 
 
348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  34.68 
 
 
353 aa  182  7e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  37.29 
 
 
354 aa  182  7e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  33.02 
 
 
344 aa  179  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  36.28 
 
 
341 aa  179  9e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2514  aminoglycoside phosphotransferase  34.8 
 
 
365 aa  178  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  37.2 
 
 
348 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  32.22 
 
 
353 aa  176  8e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  35.65 
 
 
338 aa  175  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  33.54 
 
 
352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  31.58 
 
 
363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  35.6 
 
 
358 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  34.42 
 
 
356 aa  173  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  35.17 
 
 
356 aa  172  6.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  36.36 
 
 
352 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  35.78 
 
 
315 aa  171  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  34.69 
 
 
362 aa  169  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  34.8 
 
 
357 aa  169  9e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  31.7 
 
 
388 aa  169  9e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  30.38 
 
 
354 aa  169  9e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  31.21 
 
 
344 aa  167  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  35.74 
 
 
361 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  33.54 
 
 
358 aa  167  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  32.38 
 
 
364 aa  166  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  33.53 
 
 
362 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  33.53 
 
 
362 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  33.13 
 
 
358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0835  aminoglycoside phosphotransferase  36.79 
 
 
360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.407131  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  32.49 
 
 
353 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  30.29 
 
 
355 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  33.13 
 
 
358 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  32.23 
 
 
361 aa  163  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  31.37 
 
 
355 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  33.02 
 
 
358 aa  162  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  33.64 
 
 
344 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  32.31 
 
 
348 aa  162  8.000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2216  aminoglycoside phosphotransferase  33.02 
 
 
355 aa  160  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  33.12 
 
 
368 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  35.22 
 
 
344 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 
362 aa  160  4e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 
346 aa  160  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0471  aminoglycoside phosphotransferase  31.12 
 
 
403 aa  159  5e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  33.13 
 
 
346 aa  160  5e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4129  aminoglycoside phosphotransferase  32.92 
 
 
358 aa  159  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682336  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  31.7 
 
 
359 aa  159  8e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  30.53 
 
 
355 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  36.39 
 
 
338 aa  159  9e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  34.16 
 
 
368 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  34.16 
 
 
368 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  34.16 
 
 
368 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1186  aminoglycoside phosphotransferase  30.23 
 
 
429 aa  157  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.161649  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  33.55 
 
 
353 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  34.16 
 
 
368 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  34.01 
 
 
343 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  34.16 
 
 
368 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  34.16 
 
 
368 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  34.16 
 
 
368 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  32.82 
 
 
368 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  31.14 
 
 
354 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0164  aminoglycoside phosphotransferase  31.78 
 
 
357 aa  156  7e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2908  aminoglycoside phosphotransferase  34.67 
 
 
347 aa  156  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.1681 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  33.73 
 
 
343 aa  155  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  31.77 
 
 
352 aa  155  8e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  30.75 
 
 
355 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  31.33 
 
 
348 aa  155  9e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  29.88 
 
 
379 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  33.54 
 
 
355 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  31.45 
 
 
345 aa  154  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  33.13 
 
 
343 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>