More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3421 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3421  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
404 aa  800    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.135241 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3550  FAD dependent oxidoreductase  46.53 
 
 
415 aa  332  7.000000000000001e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1338  FAD dependent oxidoreductase  46.77 
 
 
415 aa  311  1e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3091  FAD dependent oxidoreductase  32.59 
 
 
381 aa  145  9e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.105972  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 
434 aa  139  6e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  28.09 
 
 
428 aa  138  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  28.09 
 
 
428 aa  139  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1418  FAD dependent oxidoreductase  31.35 
 
 
381 aa  138  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0396  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 
432 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121903  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  24.08 
 
 
428 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1537  FAD dependent oxidoreductase  27.96 
 
 
429 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000289011  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3937  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
428 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  29.52 
 
 
430 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4342  FAD dependent oxidoreductase  29.6 
 
 
436 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4024  FAD dependent oxidoreductase  29.6 
 
 
436 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488918  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6011  FAD dependent oxidoreductase  29.6 
 
 
436 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.414798  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  29.77 
 
 
430 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  29.04 
 
 
425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  27.3 
 
 
426 aa  126  6e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  27.66 
 
 
426 aa  126  7e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 
426 aa  126  7e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  27.66 
 
 
426 aa  126  7e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  27.66 
 
 
426 aa  126  7e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0799  oxidoreductase  27.06 
 
 
427 aa  125  9e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  26.97 
 
 
424 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  29.3 
 
 
424 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  27.41 
 
 
426 aa  125  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 
426 aa  125  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  27.41 
 
 
426 aa  125  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  27.85 
 
 
426 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 
427 aa  124  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  27.49 
 
 
429 aa  123  6e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  28.42 
 
 
424 aa  122  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  28.71 
 
 
425 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 
436 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  27.5 
 
 
424 aa  122  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0139  FAD dependent oxidoreductase  30.17 
 
 
464 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412915  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 
425 aa  121  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0475952 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0153  FAD dependent oxidoreductase  27.13 
 
 
436 aa  120  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185015  hitchhiker  0.000196001 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  28.29 
 
 
444 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 
425 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  28.29 
 
 
444 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  28.32 
 
 
433 aa  119  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  28.22 
 
 
444 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  29.26 
 
 
425 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  29.83 
 
 
462 aa  117  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2722  FAD dependent oxidoreductase  26.2 
 
 
429 aa  116  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0364  FAD dependent oxidoreductase  26.77 
 
 
431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0544453 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0301  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 
436 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 
435 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2366  FAD dependent oxidoreductase  28.13 
 
 
431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  23.58 
 
 
440 aa  114  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0950  FAD dependent oxidoreductase  31.55 
 
 
466 aa  113  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.230558  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0160  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 
428 aa  113  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1866  FAD dependent oxidoreductase  25.56 
 
 
429 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106095  hitchhiker  0.00126113 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5016  FAD dependent oxidoreductase  27.99 
 
 
424 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.208645  normal  0.555113 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 
423 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1829  putative FAD-dependent oxidoreductase  28.04 
 
 
464 aa  111  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.226522  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  26.01 
 
 
423 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1503  putative FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 
430 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  24.44 
 
 
425 aa  109  7.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  27.4 
 
 
435 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4351  FAD dependent oxidoreductase  29.26 
 
 
494 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3951  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 
434 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00431943  normal  0.112468 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 
428 aa  109  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  27.94 
 
 
438 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02230  FAD dependent oxidoreductase superfamily (AFU_orthologue; AFUA_8G05850)  27.09 
 
 
459 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000761243 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3075  FAD dependent oxidoreductase  25.75 
 
 
425 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.769709  normal  0.0446875 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6396  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 
482 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0152469  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2019  FAD dependent oxidoreductase  29.78 
 
 
473 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4863  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 
466 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2186  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 
429 aa  108  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5908  FAD dependent oxidoreductase  28.26 
 
 
425 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3503  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 
466 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 
428 aa  107  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  24.13 
 
 
428 aa  107  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  26.9 
 
 
437 aa  107  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  24.13 
 
 
428 aa  107  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
427 aa  106  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  23.62 
 
 
428 aa  106  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3679  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 
463 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  23.86 
 
 
428 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1461  putative oxidoreductase  27.76 
 
 
454 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2142  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 
427 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  27.83 
 
 
449 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5578  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 
432 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0311057  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  27.57 
 
 
454 aa  105  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  25.26 
 
 
435 aa  104  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3843  FAD dependent oxidoreductase  26.32 
 
 
435 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2555  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 
429 aa  104  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3861  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 
457 aa  104  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2003  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 
471 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0118  FAD dependent oxidoreductase  29.24 
 
 
464 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  26.14 
 
 
433 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1398  FAD dependent oxidoreductase  27.13 
 
 
436 aa  103  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.35524 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2742  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 
432 aa  103  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  25.83 
 
 
431 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  24.13 
 
 
428 aa  102  8e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0231  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 
427 aa  102  9e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>