More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1024 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1024  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 261 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.62 
 
 		 274 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2711  short chain dehydrogenase  31.87 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3041  short chain dehydrogenase  31.6 
 
 		 268 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.631041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3311  short chain dehydrogenase  31.85 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0701949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.14 
 
 		 282 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.193827 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.79 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4667  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.79 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 264 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200417  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.3 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.15703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.69 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3021  short chain dehydrogenase  31.5 
 
 		 268 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2666  short chain dehydrogenase  36.84 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.144956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.91 
 
 		 347 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.44 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.37 
 
 		 269 aa  102  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1729  short chain dehydrogenase  37.98 
 
 		 227 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5218  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.8 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.901767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6757  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.78 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.65 
 
 		 306 aa  100  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12307  hitchhiker  0.00977234 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.23 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0389  short chain dehydrogenase  29.21 
 
 		 270 aa  99.8  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38500  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  35.48 
 
 		 253 aa  99.4  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.34 
 
 		 264 aa  99  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.34 
 
 		 295 aa  99  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.17 
 
 		 233 aa  98.6  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000223483  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.08 
 
 		 272 aa  98.2  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.17 
 
 		 244 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.43 
 
 		 238 aa  97.4  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.06 
 
 		 344 aa  97.4  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.753226  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.05 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6766  putative short-chain dehydrogenase  32.32 
 
 		 279 aa  96.7  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 		 321 aa  96.7  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5157  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.05 
 
 		 271 aa  96.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0437  short chain dehydrogenase  26.77 
 
 		 267 aa  96.3  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.71 
 
 		 317 aa  95.9  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00194851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.84 
 
 		 286 aa  95.9  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.252629  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.05 
 
 		 278 aa  95.9  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.314719  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.23 
 
 		 258 aa  95.5  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.392131  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.55 
 
 		 259 aa  95.1  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303734  normal  0.393919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.25 
 
 		 238 aa  94.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2393  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.82 
 
 		 247 aa  94.7  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114782  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.12 
 
 		 279 aa  95.1  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.56 
 
 		 269 aa  94.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421935 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 		 281 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255746 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.76 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.809428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.67 
 
 		 295 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3415  short chain dehydrogenase  27.61 
 
 		 268 aa  93.6  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.560569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.53 
 
 		 267 aa  93.2  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.98 
 
 		 268 aa  93.2  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3968  short chain dehydrogenase  28.85 
 
 		 269 aa  92.8  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231224  normal  0.018096 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.5 
 
 		 292 aa  93.2  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 		 262 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3588  short chain dehydrogenase  26.39 
 
 		 267 aa  93.2  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 		 262 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1414  short chain dehydrogenase  31.32 
 
 		 270 aa  92.8  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11020  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.75 
 
 		 253 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0353  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 		 262 aa  92.4  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36881  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  31.88 
 
 		 308 aa  92.8  6e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.804236  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.08 
 
 		 266 aa  92.4  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.197421 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.17 
 
 		 249 aa  92.4  6e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.617745 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.34 
 
 		 268 aa  92  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392753  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 		 262 aa  92  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28 
 
 		 271 aa  92  8e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.89 
 
 		 272 aa  92  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333155 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2585  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 		 259 aa  92  8e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.19 
 
 		 244 aa  92  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000989308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0124  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.34 
 
 		 269 aa  92  9e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0441  short chain dehydrogenase  26.67 
 
 		 267 aa  92  9e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1902  short chain dehydrogenase  29.52 
 
 		 269 aa  92  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0327948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.74 
 
 		 262 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.128983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0930  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.59 
 
 		 279 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3264  putative oxidoreductase protein  32.62 
 
 		 264 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0597317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.29 
 
 		 266 aa  90.5  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0602  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111601  normal  0.208822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.36 
 
 		 281 aa  90.5  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.75 
 
 		 300 aa  90.9  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.680577 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.85 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.32 
 
 		 268 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3404  short chain dehydrogenase  26.59 
 
 		 267 aa  90.9  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.5 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3218  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.32 
 
 		 268 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1861  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  30.3 
 
 		 270 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0952097  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0301  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.51 
 
 		 305 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0783167 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.18 
 
 		 317 aa  90.1  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.26 
 
 		 291 aa  90.1  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2443  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.5 
 
 		 300 aa  90.5  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 		 268 aa  90.1  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.37 
 
 		 272 aa  90.1  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.971691  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.61 
 
 		 281 aa  90.1  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4049  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.69 
 
 		 238 aa  90.5  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0429  short chain dehydrogenase  26.3 
 
 		 267 aa  90.1  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.09 
 
 		 313 aa  90.1  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.638785  decreased coverage  0.00000422955 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.3 
 
 		 275 aa  89.7  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.433019  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0293  short chain dehydrogenase  26.82 
 
 		 267 aa  89.7  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0289  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.92 
 
 		 258 aa  89.7  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.520585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.03 
 
 		 307 aa  89.7  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.958738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>