More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0516 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0516  nitroreductase  100 
 
 
276 aa  561  1.0000000000000001e-159  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4153  nitroreductase  60.45 
 
 
273 aa  312  3.9999999999999997e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000365143  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4035  nitroreductase  53.07 
 
 
273 aa  288  6e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1372  nitroreductase family protein  60.67 
 
 
273 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1852  nitroreductase  52.4 
 
 
288 aa  258  1e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1161  nitroreductase  59.02 
 
 
273 aa  256  4e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.395366  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2655  nitroreductase  54.04 
 
 
273 aa  254  8e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.263589  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5299  nitroreductase  52.94 
 
 
274 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.367904  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1130  nitroreductase  52.06 
 
 
286 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3290  putative nitroreductase family protein  51.5 
 
 
284 aa  237  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45940  Nitroreductase-like protein  52.22 
 
 
273 aa  232  6e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2490  nitroreductase family protein  54.72 
 
 
274 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3098  nitroreductase  52.87 
 
 
304 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7190  Nitroreductase  50.79 
 
 
253 aa  219  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08360  conserved hypothetical protein  40.4 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811217  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3660  nitroreductase family protein  41.95 
 
 
244 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.930381  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1790  nitroreductase family protein  41.06 
 
 
244 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1528  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  41.03 
 
 
244 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.165515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1647  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  41.03 
 
 
244 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1682  nitroreductase family protein  40.25 
 
 
244 aa  176  5e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1532  nitroreductase  41.53 
 
 
244 aa  175  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.509965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1713  nitroreductase family protein  40.6 
 
 
244 aa  175  8e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0371  nitroreductase  40.87 
 
 
261 aa  175  9e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1736  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  40.16 
 
 
244 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0685688  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1500  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  40.6 
 
 
244 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00104852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1491  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  40.6 
 
 
244 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1365  nitroreductase A  37.85 
 
 
240 aa  170  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2607  nitroreductase  36.72 
 
 
253 aa  167  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  0.767551 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0202  nitroreductase  42.86 
 
 
243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.779167  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1336  nitroreductase  38.31 
 
 
244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3889  nitroreductase  36.11 
 
 
248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  36.68 
 
 
240 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  35.68 
 
 
257 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0249  nitroreductase A  39.44 
 
 
240 aa  150  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0954  nitroreductase A  36.95 
 
 
240 aa  149  6e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2745  nitroreductase A  36.95 
 
 
240 aa  149  6e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.154506 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00856  nitroreductase A, NADPH-dependent, FMN-dependent  36.95 
 
 
240 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2791  nitroreductase  36.95 
 
 
240 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0923  nitroreductase A  36.95 
 
 
240 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0878  nitroreductase A  36.95 
 
 
240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00862  hypothetical protein  36.95 
 
 
240 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2481  nitroreductase A  36.55 
 
 
240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2492  nitroreductase  37.89 
 
 
249 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1005  nitroreductase A  36.55 
 
 
240 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.224676 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  39.51 
 
 
246 aa  144  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0062  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  38.22 
 
 
251 aa  142  7e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0613  NADPH-flavin oxidoreductase  31.75 
 
 
251 aa  142  7e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00207228  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0441  nitroreductase  38.79 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000237608  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0430  nitroreductase  38.79 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000330176  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0381  nitroreductase  35.86 
 
 
246 aa  139  7e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0338  nitroreductase  35.86 
 
 
246 aa  138  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0947  nitroreductase A  37.75 
 
 
240 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0911  nitroreductase A  37.75 
 
 
240 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1008  nitroreductase A  37.75 
 
 
240 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0979  nitroreductase A  37.75 
 
 
240 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1689  nitroreductase A  36.95 
 
 
239 aa  136  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.589123  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1955  nitroreductase A  37.27 
 
 
239 aa  135  9e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45348  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1027  nitroreductase A  37.35 
 
 
240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.515962  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1245  nitroreductase A  35.74 
 
 
242 aa  132  5e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2290  nitroreductase  40.08 
 
 
240 aa  132  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0996  nitroreductase  29.48 
 
 
250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  33.79 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1079  nitroreductase A  33.47 
 
 
240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0493  nitroreductase  35.56 
 
 
269 aa  130  3e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2389  nitroreductase  44.15 
 
 
240 aa  122  9e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0797  nitroreductase  33.95 
 
 
240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8680  nitroreductase  31.16 
 
 
282 aa  116  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281057  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2300  nitroreductase  34.06 
 
 
317 aa  112  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0351081 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1106  nitro/flavin reductase  31.15 
 
 
248 aa  112  8.000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000115125  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0391  nitroreductase  34.4 
 
 
316 aa  106  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1560  nitroreductase  27.57 
 
 
253 aa  104  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1816  nitroreductase  32.37 
 
 
238 aa  102  5e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.545584 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0755  nitroreductase  29.34 
 
 
245 aa  102  5e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1439  nitroreductase  33.33 
 
 
238 aa  102  6e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1072  nitroreductase  29.67 
 
 
251 aa  100  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1230  nitroreductase  27.48 
 
 
248 aa  95.9  6e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3965  nitroreductase  26.35 
 
 
265 aa  95.5  9e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.696228 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1309  nitroreductase family protein  30.37 
 
 
299 aa  94.7  1e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1502  Nitroreductase  31.63 
 
 
254 aa  92.4  6e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1770  nitroreductase  27.34 
 
 
247 aa  92.4  7e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0889  nitroreductase  35.33 
 
 
238 aa  77.4  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.351311 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  31.29 
 
 
174 aa  75.1  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  27.12 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1633  nitroreductase  34.69 
 
 
238 aa  72.4  0.000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  42.7 
 
 
206 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  30.46 
 
 
170 aa  71.2  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  30.46 
 
 
176 aa  70.1  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1003  nitroreductase  30.21 
 
 
270 aa  68.9  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.91406  hitchhiker  0.00384505 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  28.16 
 
 
169 aa  67  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  29.12 
 
 
175 aa  67.4  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0992  hypothetical protein  36.71 
 
 
175 aa  66.6  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.911499 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  25.37 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  27.38 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1357  nitroreductase  27.17 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.374254 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  28.42 
 
 
171 aa  65.9  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  27.75 
 
 
169 aa  62.8  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  30.46 
 
 
192 aa  62.8  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  27.81 
 
 
175 aa  62.4  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.21 
 
 
584 aa  62.4  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  26.67 
 
 
184 aa  61.6  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>