39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8075 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8075  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 401 aa  810    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  46.15 
 
 		 649 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1051  Serine O-acetyltransferase  41.94 
 
 		 700 aa  100  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1008  Pectate disaccharide-lyase  41.94 
 
 		 540 aa  99.8  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0943  ribosomal protein S5  46.03 
 
 		 1316 aa  99.4  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215001 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  43.2 
 
 		 809 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2311  hypothetical protein  39.67 
 
 		 772 aa  89.4  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699121  normal  0.0238538 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  40 
 
 		 554 aa  88.2  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2655  Carbohydrate binding family 6  40.6 
 
 		 847 aa  87.8  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  42.11 
 
 		 789 aa  86.3  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1650  pseudouridine synthase, Rsu  38.69 
 
 		 914 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2308  hypothetical protein  38.84 
 
 		 511 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819182 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  36.3 
 
 		 820 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6865  glycoside hydrolase family 31  38.24 
 
 		 1016 aa  83.2  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0942  ribosomal protein L18  39.53 
 
 		 769 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000113865  hitchhiker  0.00163221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3707  Carbohydrate binding family 6  37.59 
 
 		 1000 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176968  normal  0.212982 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  35.2 
 
 		 831 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2947  hypothetical protein  37.8 
 
 		 574 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00368039  normal  0.813372 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  39.85 
 
 		 1207 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6906  glycoside hydrolase family 16  41.07 
 
 		 628 aa  69.7  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00349487  hitchhiker  0.000227833 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  28.35 
 
 		 1091 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  36.09 
 
 		 1128 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  30.95 
 
 		 2073 aa  65.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3881  Pectate lyase-like  33.06 
 
 		 747 aa  62.8  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000360789  normal  0.117799 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3932  glycoside hydrolase family 43  33.33 
 
 		 456 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3331  carbohydrate-binding family 6 protein  28.68 
 
 		 747 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  29.63 
 
 		 790 aa  56.6  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  35.19 
 
 		 815 aa  56.2  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  30.6 
 
 		 922 aa  55.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4535  carbohydrate-binding family 6 protein  31.25 
 
 		 898 aa  54.7  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.334196  normal  0.875686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  32.85 
 
 		 938 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1832  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.48 
 
 		 379 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5002  Carbohydrate binding family 6  32.28 
 
 		 434 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173534  normal  0.970629 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6504  glycoside hydrolase family 18  31.5 
 
 		 580 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462594  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  29.25 
 
 		 1167 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  35.04 
 
 		 612 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1855  Carbohydrate binding family 6  27.64 
 
 		 892 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.150847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  37.63 
 
 		 918 aa  43.5  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  32.88 
 
 		 869 aa  43.1  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>