More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4812 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8000  ammonium transporter  80.83 
 
 		 466 aa  723    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4812  ammonium transporter  100 
 
 		 465 aa  917    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4015  ammonium transporter  59.28 
 
 		 456 aa  437  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5934  ammonium transporter  56.54 
 
 		 447 aa  420  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80204  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1298  ammonium transporter  55.4 
 
 		 456 aa  420  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1187  ammonium transporter  55.86 
 
 		 478 aa  420  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.569583  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3149  ammonium transporter  52.56 
 
 		 459 aa  404  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000753064  hitchhiker  0.00186594 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  51.51 
 
 		 429 aa  402  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  48.72 
 
 		 474 aa  403  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  53.81 
 
 		 432 aa  404  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5072  ammonium transporter  53.02 
 
 		 440 aa  399  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12934  ammonium-transport integral membrane protein amt  55.87 
 
 		 477 aa  396  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.90633e-27  normal  0.349751 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  49.31 
 
 		 427 aa  398  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0968  ammonium transporter  52.28 
 
 		 439 aa  389  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96365  normal  0.13962 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2547  ammonium transporter  51.15 
 
 		 434 aa  387  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916988  normal  0.19301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1956  ammonium transporter  50.44 
 
 		 446 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.77872  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1936  ammonium transporter  50.44 
 
 		 446 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2002  ammonium transporter  50.44 
 
 		 446 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.490754  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1393  ammonium transporter  55.23 
 
 		 445 aa  384  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0218958  decreased coverage  0.0052659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1785  ammonium transporter  54.25 
 
 		 439 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2907  ammonium transporter  53.33 
 
 		 442 aa  379  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23800  ammonium transporter  47.66 
 
 		 441 aa  377  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0789552  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2242  ammonium transporter  52.43 
 
 		 438 aa  372  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0898942  normal  0.0592971 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0221  ammonium transporter  47.84 
 
 		 446 aa  372  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1162  ammonium transporter  48.99 
 
 		 438 aa  371  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.317935  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3427  ammonium transporter  53.97 
 
 		 433 aa  366  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000283627  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  46.27 
 
 		 439 aa  367  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0980  ammonium transporter  50.81 
 
 		 424 aa  368  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1465  ammonium transporter  48.54 
 
 		 435 aa  362  8e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3518  ammonium transporter  50.22 
 
 		 429 aa  356  5e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0107825 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  50.23 
 
 		 449 aa  356  5e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1301  ammonium transporter  49.43 
 
 		 417 aa  356  5.999999999999999e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500264  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1608  ammonium transporter  46.53 
 
 		 442 aa  353  5e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263179  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2178  ammonium transporter  47.03 
 
 		 450 aa  352  1e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0850706  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2492  ammonium transporter  50 
 
 		 450 aa  350  2e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.262408  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3530  ammonium transporter  46.33 
 
 		 443 aa  347  2e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2078  ammonium transporter  46.77 
 
 		 450 aa  346  6e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.026274  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4185  ammonium transporter  48.58 
 
 		 450 aa  345  1e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.306123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2710  ammonium transporter  48.48 
 
 		 402 aa  345  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3269  ammonium transporter  48.88 
 
 		 441 aa  340  4e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4891  ammonium transporter  51.14 
 
 		 417 aa  339  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4980  ammonium transporter  51.14 
 
 		 417 aa  339  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5259  ammonium transporter  51.14 
 
 		 417 aa  338  9e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2232  ammonium transporter  49.54 
 
 		 451 aa  337  2.9999999999999997e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000018516 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3244  ammonium transporter  45.66 
 
 		 457 aa  337  2.9999999999999997e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  48.15 
 
 		 434 aa  336  5e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  46.54 
 
 		 451 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  46.19 
 
 		 438 aa  333  3e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  46.19 
 
 		 438 aa  333  3e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  46.15 
 
 		 405 aa  331  2e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  47.09 
 
 		 504 aa  330  4e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  43.89 
 
 		 457 aa  330  4e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  47.09 
 
 		 463 aa  329  8e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  46.3 
 
 		 467 aa  328  2.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5508  ammonium transporter  49.66 
 
 		 417 aa  327  3e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.065677 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1236  ammonia permease  47.56 
 
 		 431 aa  326  5e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  46.74 
 
 		 500 aa  325  9e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  46.51 
 
 		 501 aa  325  9e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  46.74 
 
 		 500 aa  325  9e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  46.74 
 
 		 500 aa  325  9e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  46.74 
 
 		 500 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  45.12 
 
 		 472 aa  324  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  45.92 
 
 		 500 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  45.92 
 
 		 466 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  45.92 
 
 		 500 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  43.57 
 
 		 488 aa  323  3e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  45.92 
 
 		 466 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  45.92 
 
 		 466 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3769  ammonium transporter  45.8 
 
 		 477 aa  323  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.63779 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  45.92 
 
 		 444 aa  323  5e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  45.92 
 
 		 478 aa  323  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  45.92 
 
 		 469 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4093  ammonium transporter  45.35 
 
 		 476 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  46.14 
 
 		 431 aa  319  7e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2057  ammonium transporter  49.3 
 
 		 404 aa  317  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00112408  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  42.54 
 
 		 461 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  42.44 
 
 		 515 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  45.39 
 
 		 445 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  45.22 
 
 		 405 aa  312  9e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  45.43 
 
 		 444 aa  312  9e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  42.21 
 
 		 515 aa  311  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3626  ammonium transporter  41.65 
 
 		 499 aa  311  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  43.12 
 
 		 489 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  42.63 
 
 		 485 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  46.99 
 
 		 464 aa  310  4e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  46.51 
 
 		 503 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2251  ammonium transporter  46.99 
 
 		 434 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.163851 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  46.51 
 
 		 497 aa  309  8e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  44.29 
 
 		 499 aa  309  9e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  46.26 
 
 		 459 aa  308  1.0000000000000001e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6029  ammonium transporter  46.65 
 
 		 442 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  42.35 
 
 		 494 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1817  ammonium transporter  41.05 
 
 		 500 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.664398  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  43.85 
 
 		 434 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69795  ammonium transporter AmtB  46.19 
 
 		 442 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.25807 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  46.6 
 
 		 433 aa  307  3e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47780  Ammonium transporter  46.56 
 
 		 438 aa  307  3e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261032  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  44.29 
 
 		 502 aa  307  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  43.75 
 
 		 436 aa  306  4.0000000000000004e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  43.58 
 
 		 436 aa  306  6e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>