More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0269 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0269  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 331 aa  687    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2470  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 338 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2143  transcriptional regulator, AraC family  25.51 
 
 		 338 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal  0.883029 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1451  transcriptional regulator, AraC family  27.65 
 
 		 338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.508698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1131  transcriptional regulator, AraC family  25.68 
 
 		 342 aa  96.7  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.079056 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1998  transcriptional regulator, AraC family  24.01 
 
 		 334 aa  96.7  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3431  AraC family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 341 aa  95.1  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147255  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  22.12 
 
 		 347 aa  91.7  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  22.91 
 
 		 352 aa  90.9  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23660  Transcription activator in PHB biosynthesis, AraC family  23.64 
 
 		 348 aa  90.9  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00474506  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  22.05 
 
 		 347 aa  89  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3015  AraC family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 336 aa  89  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.947427  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4868  transcriptional regulator, AraC family  23.94 
 
 		 365 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608166  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  24.18 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326701  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0616  AraC family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2543  AraC family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 336 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.354483  hitchhiker  0.0000426703 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  23.15 
 
 		 345 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0108  helix-turn-helix domain-containing protein  23.46 
 
 		 347 aa  80.5  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2005  AraC family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 335 aa  79.3  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2600  AraC family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.867319  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4117  AraC family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 341 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.344929 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2682  transcriptional regulator, AraC family  22.22 
 
 		 380 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4253  helix-turn-helix domain-containing protein  22.86 
 
 		 362 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2321  AraC family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 347 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.197837  normal  0.0103816 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4110  transcriptional regulator, AraC family  22.12 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2605  AraC family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 342 aa  77.8  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.384933  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4594  helix-turn-helix domain-containing protein  35.29 
 
 		 346 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.359709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2937  helix-turn-helix domain-containing protein  23.93 
 
 		 350 aa  75.9  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1997  hypothetical protein  23.46 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1224  AraC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 335 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2149  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 365 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0421  AraC family transcriptional regulator  19.94 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4967  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2002  hypothetical protein  23.46 
 
 		 335 aa  74.3  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  22.26 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2336  AraC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 357 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5598  AraC family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1578  AraC family transcriptional regulator  21.65 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  32.52 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3763  AraC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 356 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.570935  normal  0.387809 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3952  transcriptional regulator, AraC family  24.62 
 
 		 358 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.142509 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3839  transcriptional regulator, AraC family  24.62 
 
 		 358 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.565712  normal  0.744721 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5548  AraC family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5630  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.389433  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3508  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 352 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.878691  normal  0.0398628 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5340  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3760  AraC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 356 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0904423  normal  0.271559 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5783  AraC family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 366 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2587  helix-turn-helix domain-containing protein  21.66 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4447  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 342 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5805  AraC family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 372 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597808  normal  0.277234 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0523  helix-turn-helix domain-containing protein  41.46 
 
 		 390 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5492  AraC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 360 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16430  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  44.74 
 
 		 321 aa  72.4  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 353 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  21.97 
 
 		 353 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3231  helix-turn-helix domain-containing protein  34.51 
 
 		 288 aa  72  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2512  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 343 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477717  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  23.08 
 
 		 353 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6972  hypothetical protein  21.09 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5220  transcriptional regulator, AraC family  24.69 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1356  transcriptional regulator, AraC family  33.68 
 
 		 350 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3278  AraC family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3227  AraC family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3216  AraC family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.499109  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37400  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0307932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3895  transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 		 105 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5388  AraC family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74038  normal  0.0344366 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1968  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.83471 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3907  transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 		 120 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1889  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1830  Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.733029  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1903  HTH-type transcriptional regulator, AraC family  23.4 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.107963  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2222  AraC family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844007  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2100  AraC family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2021  transcriptional regulator, AraC family  37.18 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3638  AraC family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4184  helix-turn-helix domain-containing protein  45.33 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26598  normal  0.842889 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2426  transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 		 105 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.438029  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66530  putative transcriptional regulator  40.74 
 
 		 357 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3918  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.798133 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1606  AraC family transcriptional regulator  21.92 
 
 		 358 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4600  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 355 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2934  transcriptional regulator, AraC family  24.93 
 
 		 358 aa  69.7  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2036  transcriptional regulator, AraC family  30.53 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5500  AraC family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 345 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0596  helix-turn-helix domain-containing protein  38.55 
 
 		 356 aa  69.3  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2784  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 398 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00366686  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4375  AraC family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 345 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.987701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0506  helix-turn-helix domain-containing protein  31.63 
 
 		 346 aa  68.9  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1661  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000279685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5670  transcriptional regulator, AraC family  43.59 
 
 		 335 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.661826  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5894  AraC family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2183  AraC family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3602  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 364 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>