More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH00610 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006693  CNH00610  helicase, putative  100 
 
 		 397 aa  828    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05617  DNA replication ATPase (Eurofung)  46.88 
 
 		 528 aa  292  7e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00143305  normal  0.0551147 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  43.19 
 
 		 445 aa  278  8e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  45.24 
 
 		 443 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  41.27 
 
 		 439 aa  270  2.9999999999999997e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  44.44 
 
 		 457 aa  269  8e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  44.73 
 
 		 457 aa  267  2e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61628  DNA-dependent ATPase MGS1 (Maintenance of genome stability protein 1) DNA-directed DNA polymerase ATPase  41.64 
 
 		 747 aa  267  2e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.17782 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  43.9 
 
 		 457 aa  261  2e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  44.74 
 
 		 447 aa  258  1e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1440  recombination factor protein RarA  41.16 
 
 		 426 aa  257  2e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05640  putative ATPase, AAA family protein  43.59 
 
 		 425 aa  255  8e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  44.16 
 
 		 441 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  43.97 
 
 		 434 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  42.9 
 
 		 423 aa  252  8.000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  44.22 
 
 		 446 aa  252  9.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  44.19 
 
 		 440 aa  252  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  41.37 
 
 		 445 aa  251  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  43.48 
 
 		 453 aa  250  4e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  41.99 
 
 		 435 aa  249  4e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  43.68 
 
 		 434 aa  249  5e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  44.93 
 
 		 432 aa  249  6e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0836  recombination factor protein RarA  40.61 
 
 		 449 aa  248  9e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  41.99 
 
 		 435 aa  247  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0379  ATPase, AAA family  41.16 
 
 		 442 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0549  AAA ATPase central domain protein  41.16 
 
 		 442 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.124286  hitchhiker  0.0000609256 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  45.05 
 
 		 485 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  42.9 
 
 		 448 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0410  recombination factor protein RarA  37.73 
 
 		 425 aa  243  3.9999999999999997e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108672  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  39.95 
 
 		 426 aa  242  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  42.65 
 
 		 447 aa  241  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1287  recombination factor protein RarA  41.64 
 
 		 430 aa  239  6.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0420  AAA ATPase central domain protein  42.78 
 
 		 423 aa  239  9e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  43.11 
 
 		 447 aa  238  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3176  recombination factor protein RarA  41.23 
 
 		 435 aa  238  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1128  recombination factor protein RarA  38.4 
 
 		 440 aa  238  1e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1496  recombination factor protein RarA  40.05 
 
 		 442 aa  238  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.410866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  41.42 
 
 		 420 aa  237  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3209  recombination factor protein RarA  42.15 
 
 		 432 aa  237  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5733  AAA ATPase central domain protein  41.12 
 
 		 423 aa  236  4e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855875  normal  0.0926038 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1280  recombination factor protein RarA  38.67 
 
 		 440 aa  236  4e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.76998  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  42.61 
 
 		 505 aa  236  4e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3797  recombination factor protein RarA  42.03 
 
 		 427 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0813  recombination factor protein RarA  39.6 
 
 		 446 aa  236  4e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0334314  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1797  recombination factor protein RarA  36.91 
 
 		 443 aa  236  4e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311557  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1341  recombination factor protein RarA  38.67 
 
 		 440 aa  236  7e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0553369  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  43.35 
 
 		 447 aa  235  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  41.38 
 
 		 457 aa  233  3e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28200  recombination factor protein RarA  40.22 
 
 		 441 aa  233  4.0000000000000004e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2713  recombination factor protein RarA  40.17 
 
 		 442 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3365  recombination factor protein RarA  40.17 
 
 		 442 aa  232  8.000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.263258 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0103  recombination factor protein RarA  43.06 
 
 		 429 aa  232  8.000000000000001e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0736  AAA ATPase central domain-containing protein  43.32 
 
 		 432 aa  232  8.000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.776612  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0497  recombination factor protein RarA  40.36 
 
 		 473 aa  231  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213446 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  41.74 
 
 		 447 aa  231  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1728  recombination factor protein RarA  39.68 
 
 		 434 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1761  recombination factor protein RarA  41.74 
 
 		 452 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2129  recombination factor protein RarA  35.77 
 
 		 443 aa  230  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000081607  normal  0.0213472 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2146  recombination factor protein RarA  37.04 
 
 		 449 aa  230  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0601218  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2481  recombination factor protein RarA  37.82 
 
 		 443 aa  229  4e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000627884  hitchhiker  0.00000452551 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1721  recombination factor protein RarA  37.74 
 
 		 447 aa  230  4e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0979  AAA ATPase central domain protein  44.81 
 
 		 425 aa  230  4e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  39.27 
 
 		 441 aa  230  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2552  recombination factor protein RarA  38.2 
 
 		 435 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  39.22 
 
 		 441 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1728  recombination factor protein RarA  40.78 
 
 		 434 aa  229  5e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00896  recombination protein  39.63 
 
 		 447 aa  229  6e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.203608  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2751  AAA ATPase central domain protein  39.63 
 
 		 447 aa  229  6e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000101047  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1651  recombination factor protein RarA  39.33 
 
 		 433 aa  229  6e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  39.36 
 
 		 440 aa  229  6e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2228  recombination factor protein RarA  39.63 
 
 		 447 aa  229  6e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.331515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1668  AAA ATPase central domain protein  40.46 
 
 		 463 aa  229  6e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0287351  normal  0.641434 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  37.75 
 
 		 444 aa  229  6e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0997  recombination factor protein RarA  39.63 
 
 		 447 aa  229  6e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0155118  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  40.48 
 
 		 432 aa  229  6e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00903  hypothetical protein  39.63 
 
 		 447 aa  229  6e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1054  recombination factor protein RarA  39.63 
 
 		 447 aa  229  6e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0434989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3177  recombination factor protein RarA  40.63 
 
 		 440 aa  229  8e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1983  recombination factor protein RarA  39.9 
 
 		 438 aa  229  8e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0796  recombination factor protein RarA  39.42 
 
 		 455 aa  229  8e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5359  recombination factor protein RarA  37.8 
 
 		 434 aa  229  9e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1563  recombination factor protein RarA  39.14 
 
 		 436 aa  228  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  41.33 
 
 		 451 aa  228  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2386  recombination factor protein RarA  38.71 
 
 		 440 aa  228  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010148 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0967  recombination factor protein RarA  39.33 
 
 		 447 aa  228  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.17279  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1873  recombination factor protein RarA  37.63 
 
 		 462 aa  228  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2704  recombination factor protein RarA  39.33 
 
 		 447 aa  227  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20405  normal  0.882945 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1416  recombination factor protein RarA  37.57 
 
 		 447 aa  228  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.680205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2436  recombination factor protein RarA  38.15 
 
 		 447 aa  228  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.203785  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0094  recombination factor protein RarA  42.65 
 
 		 429 aa  226  4e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1989  recombination factor protein RarA  37.5 
 
 		 447 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2595  recombination factor protein RarA  36.6 
 
 		 446 aa  226  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0707  recombination factor protein RarA  39.42 
 
 		 453 aa  226  6e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.56713  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1076  recombination factor protein RarA  39.02 
 
 		 447 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2988  recombination factor protein RarA  38.87 
 
 		 436 aa  226  7e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2357  recombination factor protein RarA  37.37 
 
 		 434 aa  226  7e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.545615  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1027  recombination factor protein RarA  39.02 
 
 		 447 aa  226  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0758  recombination factor protein RarA  39.77 
 
 		 447 aa  226  8e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000599835 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0165  AAA ATPase central domain protein  42.4 
 
 		 419 aa  226  8e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1061  recombination factor protein RarA  39.02 
 
 		 447 aa  225  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>