141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF00630 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006691  CNF00630  electron transporter, transferring electrons within CoQH2-cytochrome c reductase complex, putative  100 
 
 		 320 aa  662    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0899568  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86147  cytochrome c1  70.16 
 
 		 288 aa  375  1e-103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.216039 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00357  Ubiquinol-cytochrome c reductase (Eurofung)  62.11 
 
 		 316 aa  370  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26515  predicted protein  56.9 
 
 		 272 aa  282  7.000000000000001e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28125  predicted protein  62.45 
 
 		 251 aa  281  1e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.138363  normal  0.0229296 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0510  cytochrome c1  53.95 
 
 		 251 aa  233  3e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00016133  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0522  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  52.21 
 
 		 252 aa  229  7e-59  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0503999  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1070  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  51.17 
 
 		 252 aa  219  5e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1303  cytochrome c1  38.87 
 
 		 689 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2616  cytochrome c1  40.52 
 
 		 687 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.634521  normal  0.325896 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1201  cytochrome c1  38.56 
 
 		 689 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0738  cytochrome c1  49.14 
 
 		 269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0973071 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2164  cytochrome c1  46.94 
 
 		 281 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.497281  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0626  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  48.74 
 
 		 256 aa  211  9e-54  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.415478  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  42.91 
 
 		 690 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2244  cytochrome c1  47.7 
 
 		 262 aa  205  8e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0400916  normal  0.437532 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3240  cytochrome c1  44.19 
 
 		 688 aa  202  4e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6796  cytochrome c1  41.29 
 
 		 298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.866248  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7535  cytochrome c1  41.29 
 
 		 298 aa  199  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834957  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3799  cytochrome c1  43.03 
 
 		 297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.76494 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3203  cytochrome c1  44.73 
 
 		 284 aa  197  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.457448  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1385  cytochrome c1  37.69 
 
 		 688 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2301  cytochrome b/c1  40.75 
 
 		 688 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0362  cytochrome c1  41.55 
 
 		 272 aa  193  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0703  cytochrome c1  44.64 
 
 		 284 aa  183  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0156  cytochrome c1  39.57 
 
 		 285 aa  182  8.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.221677 
 
 
-
 
NC_004310  BR1541  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1, putative  46.77 
 
 		 295 aa  181  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.152528  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1490  putative ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  46.77 
 
 		 318 aa  181  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.531378  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1343  cytochrome c1  47.81 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035457  normal  0.0260958 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1539  cytochrome c1  43.59 
 
 		 289 aa  179  5.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.432409 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0465  cytochrome c1  40.32 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1625  cytochrome c1  45.16 
 
 		 290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.2127  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0277  cytochrome c1  42.27 
 
 		 253 aa  173  3.9999999999999995e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3040  cytochrome c1  44.44 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1394  cytochrome c1  45.68 
 
 		 280 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2776  cytochrome c1  43.16 
 
 		 294 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.984815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0676  cytochrome c1  41.1 
 
 		 271 aa  159  6e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140638  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2767  cytochrome c1  34.72 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.428022 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2544  cytochrome c1  34.72 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2472  cytochrome c1  38.1 
 
 		 307 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.546369  normal  0.0330424 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0327  cytochrome c1  38.89 
 
 		 269 aa  133  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2946  cytochrome c1  37.57 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0356  cytochrome c1  30.39 
 
 		 277 aa  116  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000188446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2307  cytochrome c1  33.46 
 
 		 450 aa  116  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.334325  decreased coverage  0.0079978 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1394  cytochrome c1 precursor  35.41 
 
 		 285 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0061  cytochrome c1  35.41 
 
 		 285 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.197339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2812  cytochrome c1  33.33 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241158  normal  0.375315 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2801  cytochrome c1  32.58 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.824407  normal  0.36289 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3276  cytochrome c1  37.45 
 
 		 264 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4164  cytochrome c1  27.78 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0116839  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1960  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  29.06 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3761  cytochrome c1  28.51 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000196164  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3887  cytochrome c1  28.51 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3228  cytochrome c1  28.4 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3704  cytochrome c1  28.07 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00197574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0564  cytochrome c1  28.07 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000336048  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0603  cytochrome c1  28.07 
 
 		 232 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00000571786 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3019  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  29.02 
 
 		 232 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1831  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  27.54 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0803  cytochrome c1  26.48 
 
 		 233 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000755074  hitchhiker  0.00778647 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0604  cytochrome c1  27.63 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000593  normal  0.0809473 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3426  cytochrome c1  27.63 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0003058  normal  0.104383 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3274  cytochrome c1  27.63 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0283583  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2217  cytochrome c1  27.9 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0610  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  27.63 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1404  cytochrome c1  27.07 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3199  cytochrome c1  28.18 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.663491  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3305  cytochrome c1  28.33 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0751  cytochrome c1  25.32 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0945236  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3091  cytochrome c1  27.46 
 
 		 247 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0572  cytochrome c1  26.55 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00834423  normal  0.355949 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2709  cytochrome c1  27.31 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000107976  unclonable  0.0000000000354845 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3111  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  27.31 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3534  cytochrome c1  26.72 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000922213  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2927  putative cytochrome C1 precursor transmembrane protein  24.08 
 
 		 248 aa  62  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5501  cytochrome c1  25.51 
 
 		 251 aa  62  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224998 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1943  ubiquinol cytochrome C oxidoreductase, cytochrome C1 subunit  29.19 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.810872  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2857  cytochrome c1  24.18 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.453799 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1878  cytochrome c1  29.52 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.744991  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0297  cytochrome c1  25.2 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.434279  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3694  cytochrome c1  24.69 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2966  cytochrome c1  24.29 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3204  cytochrome c1  23.77 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.831263 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4690  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  24.71 
 
 		 260 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.222111  normal  0.0239811 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0851  cytochrome c1 precursor  25.51 
 
 		 255 aa  58.9  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.815731 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2353  cytochrome c1  27.11 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.922589  hitchhiker  0.000000000801731 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2731  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  27.11 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0309003  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0791  cytochrome c1  25.1 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.174357 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3933  cytochrome c1  23.14 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.563228 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2107  cytochrome c1  25.43 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560179  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0754  cytochrome c1  25.1 
 
 		 251 aa  57  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0416  putative cytochrome C1 transmembrane protein  22.92 
 
 		 251 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2209  cytochrome c1  27.56 
 
 		 244 aa  55.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.198534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0715  cytochrome c1  25.31 
 
 		 251 aa  54.7  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.269694 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2660  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome C1  24.47 
 
 		 245 aa  54.3  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0667489  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3161  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  22.58 
 
 		 747 aa  53.5  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13080  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  25.51 
 
 		 259 aa  53.9  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004507  ubiquinol cytochrome C oxidoreductase cytochrome C1 subunit  24.57 
 
 		 245 aa  53.1  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000302738  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3542  cytochrome c1  24.79 
 
 		 251 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608845  normal  0.0250819 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0361  cytochrome c1  22.92 
 
 		 252 aa  52.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.278917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>