76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3510 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3510  superfamily I DNA/RNA helicase  100 
 
 		 600 aa  1235    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.418094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2163  putative DNA helicase  55.31 
 
 		 518 aa  549  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.522245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3757  putative DNA helicase  42.66 
 
 		 501 aa  355  2e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0926  F-box only protein 18  35.48 
 
 		 498 aa  239  1e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0098755  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6048  UvrD Superfamily I DNA and RNA helicase  30.83 
 
 		 645 aa  206  9e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4241  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  29.88 
 
 		 555 aa  195  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3759  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  28.37 
 
 		 500 aa  193  7e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324134  normal  0.152428 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4050  hypothetical protein  30.63 
 
 		 481 aa  192  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0120  hypothetical protein  30.61 
 
 		 647 aa  190  7e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000210723 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3358  hypothetical protein  29.67 
 
 		 509 aa  183  8.000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0575  UvrD/REP helicase  29.76 
 
 		 536 aa  178  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000167989  unclonable  0.00000359794 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0186  hypothetical protein  28.8 
 
 		 503 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.589701  hitchhiker  0.00261133 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2787  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  28.43 
 
 		 519 aa  177  6e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.803649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4503  DNA helicase  30.62 
 
 		 493 aa  176  9e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1452  hypothetical protein  29.98 
 
 		 487 aa  176  9e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2323  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  29.16 
 
 		 505 aa  176  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488765 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0879  hypothetical protein  29.78 
 
 		 485 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6248  putative DNA helicase  29.63 
 
 		 486 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59830  putative helicase  30.25 
 
 		 493 aa  173  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000685074  hitchhiker  7.95621e-18 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1569  putative DNA helicase  27.91 
 
 		 486 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5233  putative helicase superfamily I  27.91 
 
 		 486 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161896  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2306  putative DNA helicase  28.21 
 
 		 499 aa  165  3e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.92249 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2003  DNA helicase  27.57 
 
 		 499 aa  162  1e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3627  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  29.07 
 
 		 513 aa  157  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.180644  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4323  hypothetical protein  25.78 
 
 		 511 aa  142  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14422  predicted protein  26.28 
 
 		 1658 aa  137  4e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.799653  normal  0.0906106 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4987  putative helicase superfamily I  26.12 
 
 		 500 aa  124  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1708  UvrD/REP helicase  26.77 
 
 		 695 aa  68.2  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2436  UvrD/REP helicase  24.6 
 
 		 759 aa  67.4  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000724075  normal  0.154121 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0080  DNA-dependent helicase II  27.08 
 
 		 724 aa  62.4  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1455  UvrD/REP helicase  25.23 
 
 		 715 aa  60.1  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2848  UvrD/REP helicase  24.48 
 
 		 611 aa  57.8  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.385626  normal  0.424075 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2080  hypothetical protein  44.26 
 
 		 292 aa  55.8  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5077  UvrD/REP helicase  25.76 
 
 		 600 aa  55.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.935976  normal  0.623065 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1546  UvrD/REP helicase  22.84 
 
 		 564 aa  53.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.924385  hitchhiker  0.000024327 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0445  UvrD/REP helicase  23.77 
 
 		 515 aa  53.5  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00058157 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1611  UvrD/REP helicase  25.76 
 
 		 729 aa  53.1  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.780541  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1264  UvrD/REP helicase  24.25 
 
 		 678 aa  51.6  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.145211 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0128  DNA-dependent helicase II  27.57 
 
 		 741 aa  50.1  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000143952  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0860  UvrD/Rep family helicase  26.19 
 
 		 639 aa  48.5  0.0004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_917  predicted protein  21.69 
 
 		 657 aa  47.8  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.770015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0146  UvrD/REP helicase  31.3 
 
 		 721 aa  47.4  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.728084  normal  0.499392 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0137  UvrD/REP helicase  30.43 
 
 		 695 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0661  UvrD/REP helicase  26.45 
 
 		 708 aa  47  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612479  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1726  UvrD/REP helicase  20.45 
 
 		 593 aa  46.6  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3877  UvrD/REP helicase  30.58 
 
 		 696 aa  47  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0149  UvrD/REP helicase  30.43 
 
 		 695 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2905  UvrD/REP helicase  30.43 
 
 		 695 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.306179  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0163  UvrD/REP helicase  30.43 
 
 		 695 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3085  UvrD/Rep helicase  21.18 
 
 		 717 aa  45.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.173371  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2812  UvrD/REP helicase  28.05 
 
 		 719 aa  46.2  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0127  DNA helicase II  26.99 
 
 		 646 aa  45.8  0.002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.889231  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4079  DNA helicase II  24.57 
 
 		 724 aa  45.8  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0497  DNA-dependent helicase II  22.87 
 
 		 726 aa  46.2  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.615928  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0150  UvrD/REP helicase  30.43 
 
 		 695 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275527  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2967  UvrD/REP helicase  23.4 
 
 		 520 aa  45.8  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0060  ATP-dependent DNA helicase Rep  33.33 
 
 		 696 aa  46.2  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3329  UvrD/REP helicase  30.43 
 
 		 695 aa  46.2  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.544954  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4444  UvrD/REP helicase  27.64 
 
 		 737 aa  46.2  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.805765  normal  0.0453578 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3000  UvrD/REP helicase  31.82 
 
 		 731 aa  45.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.120838 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3327  ATP-dependent DNA helicase Rep  32.65 
 
 		 704 aa  45.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0992503  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1050  UvrD/REP helicase  32.86 
 
 		 597 aa  45.4  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1693  UvrD/REP helicase  21.81 
 
 		 683 aa  45.1  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.508868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1775  UvrD/REP helicase  28.46 
 
 		 1164 aa  44.7  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.579512 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3260  ATP-dependent DNA helicase Rep  33.7 
 
 		 848 aa  44.3  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.807902  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7513  ATP-dependent DNA helicase Rep  32.89 
 
 		 686 aa  44.3  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.556127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03230  DNA-dependent helicase II  25.52 
 
 		 728 aa  44.3  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3821  UvrD/REP helicase  26.23 
 
 		 1150 aa  44.3  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0155122  decreased coverage  0.00328324 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3046  UvrD/REP helicase  26.85 
 
 		 697 aa  44.3  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.672611  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0122  ATP-dependent DNA helicase Rep  33.7 
 
 		 733 aa  43.9  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3642  DNA-dependent helicase II  24.75 
 
 		 726 aa  43.9  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3919  ATP-dependent DNA helicase Rep  33.7 
 
 		 695 aa  43.9  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0828794  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3991  ATP-dependent DNA helicase Rep  33.7 
 
 		 695 aa  43.9  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282307  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2007  UvrD/REP helicase  24.16 
 
 		 714 aa  43.5  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0358603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0484  DNA-dependent helicase II  36.17 
 
 		 722 aa  43.9  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2353  DNA helicase IV  22.94 
 
 		 684 aa  43.5  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.757014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>