More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2416 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2416  multiple sugar-binding ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 346 aa  707    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.860941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0799  ABC transporter related protein  36.73 
 
 		 353 aa  206  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.46134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2648  ABC transporter related  35.83 
 
 		 325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0257  ABC transporter related  37.5 
 
 		 316 aa  186  5e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.784545  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.5 
 
 		 362 aa  181  2e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  37.25 
 
 		 356 aa  180  2.9999999999999997e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3441  ABC transporter related  37.39 
 
 		 330 aa  179  5.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  35.92 
 
 		 355 aa  179  8e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2162  ABC transporter related  33.03 
 
 		 327 aa  177  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.526088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  32.07 
 
 		 342 aa  176  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3825  ABC transporter related  33.75 
 
 		 364 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  32.56 
 
 		 343 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  33.63 
 
 		 365 aa  172  5.999999999999999e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1027  ABC transporter related  34.57 
 
 		 370 aa  172  6.999999999999999e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0361894 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  30.84 
 
 		 366 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  32.42 
 
 		 352 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02380  2-aminoethylphosphonate transport  37.24 
 
 		 304 aa  169  7e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.174206  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 		 333 aa  169  9e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0526  ABC transporter related protein  33.53 
 
 		 314 aa  168  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0396747  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  32.87 
 
 		 384 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1111  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  31.36 
 
 		 384 aa  167  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0542  ABC transporter related  31.92 
 
 		 370 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4552  ABC transporter related  39.67 
 
 		 360 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  34.69 
 
 		 353 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3398  ABC transporter related  32.97 
 
 		 357 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3947  ABC transporter-related protein  31.83 
 
 		 356 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.615077 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0308  ABC transporter related  33.63 
 
 		 360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0657  ABC transporter related protein  36.67 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3576  ABC transporter related  38.57 
 
 		 373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0465993  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0555  ABC transporter related  35.27 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0413767  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  37.31 
 
 		 352 aa  164  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0701  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  30.38 
 
 		 367 aa  163  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0500  ABC transporter related  37.05 
 
 		 359 aa  164  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026096  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0782  ABC transporter related  34.2 
 
 		 356 aa  164  3e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  34.85 
 
 		 333 aa  164  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  32.31 
 
 		 384 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1377  ABC transporter related  31.28 
 
 		 356 aa  163  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.745904  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  32.31 
 
 		 384 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3126  ABC transporter related  32.97 
 
 		 359 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3147  ABC transporter ATP-binding protein  31.28 
 
 		 356 aa  163  4.0000000000000004e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4710  ABC transporter related  31.8 
 
 		 359 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0388309 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1262  ABC transporter related  31.32 
 
 		 353 aa  163  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0942202  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  32.4 
 
 		 384 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0323  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.86 
 
 		 357 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000345783  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1260  ABC transporter, ATP-binding protein  31.28 
 
 		 356 aa  163  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1719  ABC transporter related  39.04 
 
 		 364 aa  163  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.430519 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  30.08 
 
 		 378 aa  162  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5863  ABC transporter related  32.85 
 
 		 358 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0374119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1180  ABC transporter related  34.71 
 
 		 312 aa  162  6e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.584734 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2898  ABC transporter related  33.43 
 
 		 366 aa  162  7e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00959734 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  32.03 
 
 		 386 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3121  ABC transporter related  32.06 
 
 		 353 aa  162  8.000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  31.91 
 
 		 366 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1215  ABC-transporter, ATP-binding protein  31.91 
 
 		 333 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  34.53 
 
 		 333 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  31.91 
 
 		 333 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0781  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  32.11 
 
 		 349 aa  161  1e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00618653  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  30.92 
 
 		 343 aa  161  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  31.91 
 
 		 333 aa  161  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0656  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  30.09 
 
 		 367 aa  160  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  37.15 
 
 		 363 aa  161  2e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1300  ABC transporter related  37.41 
 
 		 356 aa  161  2e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.437284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2548  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  34.51 
 
 		 374 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.469643  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1496  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  29.43 
 
 		 384 aa  160  3e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1903  sulphate transport system permease protein 1  33.45 
 
 		 343 aa  160  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000843013  hitchhiker  0.000000000000895278 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0503  sulphate transport system permease protein 1  33.67 
 
 		 360 aa  160  4e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  34.14 
 
 		 357 aa  159  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5388  ABC transporter related  34.03 
 
 		 352 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  29.89 
 
 		 368 aa  159  5e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2841  ABC transporter related  30.72 
 
 		 343 aa  159  6e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355371  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0633  ABC transporter related  29.57 
 
 		 379 aa  159  6e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1522  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  29.63 
 
 		 375 aa  159  7e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4396  ABC transporter related  30.59 
 
 		 370 aa  159  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.625138  normal  0.658591 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2335  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  29.63 
 
 		 375 aa  159  7e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  31.39 
 
 		 381 aa  159  8e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2065  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  32.37 
 
 		 351 aa  159  9e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.981525  normal  0.53005 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  33.33 
 
 		 369 aa  159  9e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  31.59 
 
 		 361 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1756  ABC transporter related  32.39 
 
 		 360 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1784  ABC transporter related  32.39 
 
 		 360 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1128  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA  34.49 
 
 		 357 aa  158  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0364  ABC transporter related  37.8 
 
 		 365 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4499  ABC transporter related protein  31.06 
 
 		 381 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0578082  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1680  sulphate transport system permease protein 1  35.82 
 
 		 338 aa  157  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.070095  normal  0.46795 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2640  ABC transporter related  33.12 
 
 		 349 aa  158  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0268682  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0609  sulphate transport system permease protein 1  31.31 
 
 		 359 aa  157  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.863407  normal  0.7165 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2413  ABC transporter related  37.14 
 
 		 376 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1158  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  36.95 
 
 		 372 aa  157  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1524  ABC transporter, ATP-binding protein  31.48 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1531  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.32 
 
 		 353 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1014  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.8 
 
 		 357 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.939142  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1739  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  31.85 
 
 		 355 aa  157  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6242  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (maltose/maltodextrin)  32.19 
 
 		 377 aa  156  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0869  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  31.91 
 
 		 371 aa  156  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  30.84 
 
 		 352 aa  156  4e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1163  ABC transporter related  34.44 
 
 		 372 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0455034  normal  0.217765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5048  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  32.77 
 
 		 338 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1284  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  35.69 
 
 		 426 aa  156  5.0000000000000005e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.508961  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1821  ABC transporter related  30.86 
 
 		 382 aa  156  6e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1807  ABC transporter related  33.45 
 
 		 367 aa  156  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0324794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>