More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1245 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1245  ion channel protein  100 
 
 		 261 aa  521  1e-147  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1729  MscS Mechanosensitive ion channel  47.64 
 
 		 272 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.356127  hitchhiker  0.00130809 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1298  MscS Mechanosensitive ion channel  50 
 
 		 262 aa  272  5.000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.861763  normal  0.526246 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0541  MscS mechanosensitive ion channel  44.89 
 
 		 273 aa  186  4e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0812  small-conductance mechanosensitive channel  41.67 
 
 		 274 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  40.55 
 
 		 280 aa  173  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  38.11 
 
 		 275 aa  172  5e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  36 
 
 		 279 aa  172  5.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1674  MscS mechanosensitive ion channel  35.66 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702305  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02189  hypothetical protein  33.61 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0204  mechanosensitive ion channel family protein  35.29 
 
 		 271 aa  169  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.171183  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0202  mechanosensitive ion channel family protein  35.29 
 
 		 271 aa  169  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  35.65 
 
 		 270 aa  167  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1199  mechanosensitive ion channel component  36.51 
 
 		 281 aa  168  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000786613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  37.55 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4420  MscS mechanosensitive ion channel  40.65 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0689552  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4603  mechanosensitive ion channel family protein  35.15 
 
 		 275 aa  159  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  31.64 
 
 		 275 aa  159  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  32.42 
 
 		 275 aa  157  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  33.73 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  30.86 
 
 		 275 aa  156  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  30.86 
 
 		 275 aa  156  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  33.6 
 
 		 288 aa  155  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1419  mechanosensitive ion channel family protein  39.3 
 
 		 278 aa  155  8e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  31.8 
 
 		 275 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  31.8 
 
 		 275 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  30.98 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  36.4 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  34.67 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  31.38 
 
 		 275 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  35.32 
 
 		 322 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  32.38 
 
 		 269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1359  MscS mechanosensitive ion channel  32.03 
 
 		 275 aa  152  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  31.38 
 
 		 275 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  31.47 
 
 		 274 aa  152  7e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  32.54 
 
 		 274 aa  152  7e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  34.76 
 
 		 276 aa  152  7e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0585  putative small-conductance mechanosensitive channel  30.54 
 
 		 277 aa  152  8e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591532  normal  0.0145572 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4086  MscS mechanosensitive ion channel  35.61 
 
 		 276 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4496  MscS mechanosensitive ion channel  38.21 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.737667  normal  0.727724 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4392  mechanosensitive ion channel family protein  35.23 
 
 		 276 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49232  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  32.22 
 
 		 275 aa  149  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4965  hypothetical protein  37.7 
 
 		 278 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57110  hypothetical protein  38.11 
 
 		 278 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  30.59 
 
 		 274 aa  149  6e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  30.47 
 
 		 275 aa  149  6e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  31.4 
 
 		 275 aa  148  8e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3375  MscS mechanosensitive ion channel  35.24 
 
 		 302 aa  148  9e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.190462  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  32 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1966  hypothetical protein  34.7 
 
 		 268 aa  146  3e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  32.23 
 
 		 277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  32.57 
 
 		 275 aa  145  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  29.8 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1353  MscS mechanosensitive ion channel  39.43 
 
 		 282 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.512703  normal  0.132094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4371  MscS mechanosensitive ion channel  39.43 
 
 		 280 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.053495 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  32.75 
 
 		 280 aa  141  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5331  MscS mechanosensitive ion channel  29.17 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0960  MscS mechanosensitive ion channel  39.02 
 
 		 280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5803  Small-conductance mechanosensitive channel  30.4 
 
 		 284 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2565  hypothetical protein  30.99 
 
 		 283 aa  137  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  31.09 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3671  MscS mechanosensitive ion channel  32.03 
 
 		 277 aa  136  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  32.72 
 
 		 305 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  30.77 
 
 		 563 aa  132  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  32.6 
 
 		 270 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2423  MscS Mechanosensitive ion channel  27.49 
 
 		 297 aa  132  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0692547 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2402  hypothetical protein  32.2 
 
 		 279 aa  132  5e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.267781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0527  MscS mechanosensitive ion channel  30.68 
 
 		 276 aa  132  6e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  33.16 
 
 		 305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0426  MscS mechanosensitive ion channel  30.2 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000444789  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2942  MscS mechanosensitive ion channel  30.13 
 
 		 288 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.711571 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4989  MscS mechanosensitive ion channel  30.7 
 
 		 321 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0847315  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  30.92 
 
 		 298 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3171  MscS mechanosensitive ion channel  30.7 
 
 		 321 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3256  MscS mechanosensitive ion channel  30.7 
 
 		 292 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00789281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5106  MscS mechanosensitive ion channel  30.7 
 
 		 292 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0140126  decreased coverage  0.0019989 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  29.02 
 
 		 286 aa  129  6e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4309  MscS mechanosensitive ion channel  31.14 
 
 		 289 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000550538  decreased coverage  0.0000000451244 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  32.1 
 
 		 533 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  28.63 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  28.63 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  28.63 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  28.63 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  28.63 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1584  MscS mechanosensitive ion channel  32.52 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00518641  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  28.63 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  28.63 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  28.63 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0797  MscS Mechanosensitive ion channel  29.6 
 
 		 268 aa  127  3e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4903  MscS mechanosensitive ion channel  32.86 
 
 		 327 aa  125  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2755  MscS mechanosensitive ion channel:conserved TM helix  30.8 
 
 		 276 aa  125  7e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1616  MscS mechanosensitive ion channel  28.05 
 
 		 273 aa  125  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.19083  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  29.27 
 
 		 532 aa  125  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1557  mechanosensitive ion channel family protein  31.08 
 
 		 274 aa  124  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.172425  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  31.2 
 
 		 288 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1967  MscS Mechanosensitive ion channel  27.75 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  30.26 
 
 		 276 aa  123  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0515  MscS Mechanosensitive ion channel  29.18 
 
 		 292 aa  123  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3942  MscS mechanosensitive ion channel  29.9 
 
 		 288 aa  123  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.639966 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4349  MscS Mechanosensitive ion channel  31.69 
 
 		 285 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>