66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1661 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1661  DoxX  100 
 
 
132 aa  258  2e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.430613  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0183  DoxX family protein  52.8 
 
 
127 aa  134  4e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.313264  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1765  DoxX  45.97 
 
 
127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  41.8 
 
 
130 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0829  DoxX family protein  41.8 
 
 
140 aa  103  5e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0476  DoxX family protein  38.35 
 
 
134 aa  99.4  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0125441  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0176  SRC kinase associated phosphoprotein 2  46.9 
 
 
129 aa  99.8  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.479419  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0945  DoxX family protein  37.21 
 
 
136 aa  97.8  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  40.98 
 
 
138 aa  97.4  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  35.65 
 
 
137 aa  97.4  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0059  DoxX family protein  39.02 
 
 
128 aa  96.7  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3090  DoxX family protein  37.9 
 
 
144 aa  96.7  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  38.71 
 
 
131 aa  95.9  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4416  DoxX family protein  38.02 
 
 
157 aa  95.9  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.386618  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1187  DoxX family protein  35.48 
 
 
144 aa  95.1  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  34.88 
 
 
130 aa  94.4  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  37.39 
 
 
131 aa  92  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1627  DoxX  38.89 
 
 
134 aa  92.8  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109453  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2799  DoxX family protein  35.48 
 
 
144 aa  89.7  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0830  DoxX family protein  36.36 
 
 
149 aa  89  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3308  DoxX family protein  37.5 
 
 
128 aa  88.2  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1594  DoxX  40.91 
 
 
137 aa  87.8  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570785  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1889  DoxX family protein  36.04 
 
 
150 aa  87  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0728  hypothetical protein  35 
 
 
138 aa  86.7  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2934  DoxX family protein  35.54 
 
 
143 aa  84  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1344  DoxX family protein  37.4 
 
 
143 aa  81.3  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2974  DoxX  37.7 
 
 
134 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00548742  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3963  DoxX family protein  39.05 
 
 
114 aa  79.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804647  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0915  DoxX  38.24 
 
 
131 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1388  DoxX family protein  34.4 
 
 
144 aa  77  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2661  DoxX family protein  33.06 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204335  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1247  DoxX family protein  33.88 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0687  DoxX  36.29 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2122  DoxX family protein  31.09 
 
 
129 aa  63.5  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0269415 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  30.7 
 
 
134 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  30.71 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  30.6 
 
 
149 aa  47  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  25.76 
 
 
164 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3022  DoxX family protein  27.74 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  28.12 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  24.81 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4492  hypothetical protein  30 
 
 
134 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  28.32 
 
 
133 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4441  hypothetical protein  30 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1775  DoxX family protein  30.71 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.019545 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4589  hypothetical protein  30 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0267  hypothetical protein  29.01 
 
 
186 aa  42.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4106  hypothetical protein  30 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4095  hypothetical protein  30 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0756  hypothetical protein  30 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4480  hypothetical protein  30 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4257  hypothetical protein  30 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4442  hypothetical protein  30 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  27.01 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4208  DoxX family protein  30 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.550603  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  24.06 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02871  hypothetical protein  29.01 
 
 
186 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.714602  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  29.92 
 
 
147 aa  41.6  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  30.08 
 
 
161 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7034  DoxX family protein  23.85 
 
 
139 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182123  normal  0.352709 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1461  DoxX  23.85 
 
 
139 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6367  DoxX family protein  23.85 
 
 
139 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3079  DoxX family protein  30.91 
 
 
134 aa  40.4  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.738781  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02881  hypothetical protein  28.24 
 
 
186 aa  40  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  24.8 
 
 
133 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  27.2 
 
 
172 aa  40  0.01  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>