More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0926 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0855  arginine decarboxylase  75.86 
 
 		 611 aa  957    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1273  arginine decarboxylase  76.8 
 
 		 611 aa  983    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0487343  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0926  arginine decarboxylase  100 
 
 		 613 aa  1253    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.355796  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1132  arginine decarboxylase  58.27 
 
 		 609 aa  725    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0746  arginine decarboxylase  72.27 
 
 		 609 aa  922    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.274472  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0785  arginine decarboxylase  75.78 
 
 		 610 aa  954    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00102058  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1248  arginine decarboxylase  75.12 
 
 		 610 aa  951    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000273662  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0895  arginine decarboxylase  80.23 
 
 		 613 aa  1034    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.262836  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1289  arginine decarboxylase  69.84 
 
 		 616 aa  893    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00657697  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3114  arginine decarboxylase  38.39 
 
 		 630 aa  431  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.188561 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2839  arginine decarboxylase  38.1 
 
 		 647 aa  425  1e-117  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1771  arginine decarboxylase  37.74 
 
 		 706 aa  416  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1675  arginine decarboxylase  38.46 
 
 		 635 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00247787  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2916  arginine decarboxylase  38.53 
 
 		 635 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1309  arginine decarboxylase  38.53 
 
 		 635 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000212107 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0026  arginine decarboxylase  36.31 
 
 		 650 aa  398  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0904  arginine decarboxylase  36.86 
 
 		 635 aa  395  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284288 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2606  arginine decarboxylase  37.66 
 
 		 635 aa  399  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.455337  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2537  arginine decarboxylase  36.86 
 
 		 635 aa  395  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3789  arginine decarboxylase  35.49 
 
 		 636 aa  394  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1536  arginine decarboxylase  35.44 
 
 		 643 aa  390  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.649083  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2097  arginine decarboxylase  36.96 
 
 		 636 aa  387  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0983  arginine decarboxylase  37.54 
 
 		 635 aa  385  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3466  arginine decarboxylase  36.12 
 
 		 645 aa  383  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2609  arginine decarboxylase  35.82 
 
 		 637 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.901624  normal  0.151183 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3124  arginine decarboxylase  32.8 
 
 		 627 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0508  arginine decarboxylase  33.88 
 
 		 658 aa  375  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595355  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3349  arginine decarboxylase  33.99 
 
 		 659 aa  373  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0845  arginine decarboxylase  33.99 
 
 		 659 aa  373  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0843  arginine decarboxylase  33.99 
 
 		 659 aa  373  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2057  arginine decarboxylase  35.92 
 
 		 637 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.126213  normal  0.137004 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0550  arginine decarboxylase  33.55 
 
 		 657 aa  371  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.314322  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3903  arginine decarboxylase  33.82 
 
 		 659 aa  370  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0317541  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1846  arginine decarboxylase  35.44 
 
 		 669 aa  370  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3423  arginine decarboxylase  34.62 
 
 		 671 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1119  arginine decarboxylase  35.63 
 
 		 639 aa  369  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.139662  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1598  arginine decarboxylase  35.14 
 
 		 639 aa  371  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0503845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3706  arginine decarboxylase  33.82 
 
 		 660 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0526106  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1658  arginine decarboxylase  36.11 
 
 		 645 aa  371  1e-101  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.944199  normal  0.0506092 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1619  arginine decarboxylase  35.71 
 
 		 637 aa  367  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000092888  normal  0.0751508 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00461  arginine decarboxylase  34.75 
 
 		 648 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2321  arginine decarboxylase  35.14 
 
 		 655 aa  365  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00481  arginine decarboxylase  35.16 
 
 		 648 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2280  arginine decarboxylase  35.24 
 
 		 636 aa  368  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000837435  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3973  arginine decarboxylase  34.21 
 
 		 658 aa  369  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0072  arginine decarboxylase  33.93 
 
 		 628 aa  367  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1963  arginine decarboxylase  34.34 
 
 		 636 aa  365  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.143441 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1983  arginine decarboxylase  34.21 
 
 		 654 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119208  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2068  arginine decarboxylase  34.21 
 
 		 654 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3325  arginine decarboxylase  33.81 
 
 		 632 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.591958  normal  0.70504 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3260  arginine decarboxylase  33.81 
 
 		 632 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.55052 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3333  arginine decarboxylase  33.81 
 
 		 632 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.104142 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1647  arginine decarboxylase  34.55 
 
 		 637 aa  364  2e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3249  arginine decarboxylase  33.81 
 
 		 632 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.225168  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3430  arginine decarboxylase  33.81 
 
 		 632 aa  364  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000516135 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00521  arginine decarboxylase  35.59 
 
 		 648 aa  364  3e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.325981  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2517  arginine decarboxylase  35.46 
 
 		 639 aa  364  3e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.332138  normal  0.039824 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1698  arginine decarboxylase  34.65 
 
 		 636 aa  364  3e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3081  arginine decarboxylase  33.61 
 
 		 632 aa  363  4e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602145  hitchhiker  0.00168239 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4241  arginine decarboxylase  33.61 
 
 		 632 aa  363  4e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02768  arginine decarboxylase  33.77 
 
 		 658 aa  363  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0756  arginine decarboxylase  33.77 
 
 		 658 aa  363  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1870  arginine decarboxylase  34.55 
 
 		 637 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02731  hypothetical protein  33.77 
 
 		 658 aa  363  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2480  arginine decarboxylase  34.81 
 
 		 637 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.46516  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3281  arginine decarboxylase  33.61 
 
 		 658 aa  363  6e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2517  arginine decarboxylase  34.71 
 
 		 637 aa  363  6e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.977379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1768  arginine decarboxylase  34.71 
 
 		 637 aa  363  6e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0174014  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0773  arginine decarboxylase  33.61 
 
 		 658 aa  363  6e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00439854 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3096  arginine decarboxylase  33.61 
 
 		 658 aa  363  6e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1761  arginine decarboxylase  34.71 
 
 		 637 aa  363  6e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0168893  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3371  arginine decarboxylase  33.61 
 
 		 658 aa  363  6e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.575173  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3934  arginine decarboxylase  34.56 
 
 		 655 aa  363  7.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.948508 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2840  arginine decarboxylase  35.28 
 
 		 634 aa  362  1e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177287 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0046  arginine decarboxylase  34.59 
 
 		 648 aa  362  1e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1896  arginine decarboxylase  33.55 
 
 		 654 aa  362  1e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.907046  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1805  arginine decarboxylase  34.55 
 
 		 637 aa  362  2e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0026532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1557  arginine decarboxylase  34.39 
 
 		 637 aa  360  3e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1632  arginine decarboxylase  34.39 
 
 		 637 aa  360  3e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.386766  normal  0.0176215 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1624  arginine decarboxylase  34.18 
 
 		 637 aa  360  3e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0743651 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3344  arginine decarboxylase  33.65 
 
 		 658 aa  360  5e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0727  arginine decarboxylase  33.66 
 
 		 637 aa  360  6e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.594395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2513  arginine decarboxylase  34.44 
 
 		 642 aa  358  9.999999999999999e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.494839 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1964  arginine decarboxylase  34.58 
 
 		 660 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.015476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1536  arginine decarboxylase  34.79 
 
 		 645 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.767792 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2172  arginine decarboxylase  34.54 
 
 		 642 aa  355  1e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4038  arginine decarboxylase  34.71 
 
 		 679 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.781244 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0202  arginine decarboxylase  33.12 
 
 		 634 aa  355  2e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.500667  normal  0.147392 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1677  arginine decarboxylase  33.13 
 
 		 681 aa  353  4e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.814883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0901  arginine decarboxylase  35.53 
 
 		 638 aa  352  8.999999999999999e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000100122  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1037  arginine decarboxylase  33.22 
 
 		 647 aa  352  1e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.919876 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1142  arginine decarboxylase  33.96 
 
 		 693 aa  352  1e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.344888  hitchhiker  0.00702994 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03894  arginine decarboxylase  33.89 
 
 		 639 aa  348  2e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0027527  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28311  arginine decarboxylase  33.89 
 
 		 648 aa  348  2e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.205321 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1650  arginine decarboxylase  32.62 
 
 		 681 aa  347  4e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00521  arginine decarboxylase  34.53 
 
 		 648 aa  347  5e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.234716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3873  arginine decarboxylase  33.84 
 
 		 642 aa  347  5e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0571  arginine decarboxylase  33.33 
 
 		 650 aa  346  6e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0544  arginine decarboxylase  33.75 
 
 		 633 aa  345  1e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.073067  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2047  arginine decarboxylase  32.91 
 
 		 625 aa  345  2e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>